[发明专利]一种用于HLA基因分型的试剂盒和方法有效
申请号: | 201510757211.4 | 申请日: | 2015-11-06 |
公开(公告)号: | CN105255875B | 公开(公告)日: | 2018-08-28 |
发明(设计)人: | 贝锦新;冯丽娜;左晓宇;刘稳升 | 申请(专利权)人: | 中山大学肿瘤防治中心 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/6827 |
代理公司: | 广州三环专利商标代理有限公司 44202 | 代理人: | 刘孟斌 |
地址: | 510000 *** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 试剂盒 扩增 引物 分型 扩增引物 引物序列 分辨率 准确率 科研 应用 | ||
1.一种用于HLA基因分型的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括用于扩增HLA-B基因的2号外显子和3号外显子的引物,和用于扩增HLA-B基因的4号外显子的引物;
所述用于扩增HLA-B基因的2号外显子和3号外显子的引物包括由SEQ ID NO.1和SEQID NO.2所示的引物序列组成的扩增引物对;
所述用于扩增HLA-B基因的4号外显子的引物包括由SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4所示的引物序列组成的扩增引物对。
2.一种HLA基因分型的方法,其特征在于,所述方法包括:
(1)提取待测样本的DNA;
(2)分别采用由SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示的引物序列组成的扩增引物对和由SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4所示的引物序列组成的扩增引物对,对待测样本DNA进行PCR扩增,得到含有HLA-B基因的2号外显子和3号外显子的第一扩增片段和含有HLA-B基因的4号外显子的第二扩增片段,然后分别纯化含有HLA-B基因的2号外显子和3号外显子的第一扩增片段和含有HLA-B基因的4号外显子的第二扩增片段;
(3)将步骤(2)纯化后的第一扩增片段和第二扩增片段分别进行测序;
(4)将步骤(3)中的测序结果与数据库中HLA基因的外显子标准序列进行对比,确定HLA基因的型别。
3.根据权利要求2所述的HLA基因分型的方法,其特征在于,所述步骤(4)中数据库为国际组织IMGT数据库。
4.根据权利要求2所述的HLA基因分型的方法,其特征在于,如果比对后出现模棱两可的分型结果,则将步骤(2)中的第一扩增片段和第二扩增片段分别进行T-A克隆,然后进行测序比对,确定HLA基因的型别。
5.根据权利要求2所述的HLA基因分型的方法,其特征在于,如果比对后出现模棱两可的分型结果,则针对步骤(2)中的第一扩增片段和第二扩增片段分别设计allele特异性的引物进行区分,然后进行扩增后测序比对,确定HLA基因的型别。
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