[发明专利]一种鲤鱼肌内脂肪沉积相关ACOX基因及其应用

说明书

技术领域

本发明属于鱼类分子标记技术领域，具体涉及一种鲤鱼肌内脂肪沉积相关的ACOX基因及其应用。

背景技术

肌内脂肪(IntramuscularFat,IMF)是影响养殖动物肉质诸多因素中极其重要的一个指标，可以影响肉质的嫩度和多汁性。在淡水鱼养殖不断增产的今天，消费者对鱼类营养、口感等的要求也日益提高。鲤鱼是世界性养殖鱼类，遗传多样性丰富、抗性强、产量高，在淡水鱼类养殖中占有重要地位。通过测定养殖在同一池塘的建鲤和荷包红鲤的肌肉脂肪含量，发现荷包红鲤肌肉脂肪含量明显比建鲤高。

发明内容

本发明的目的是提供一种鲤鱼肌内脂肪沉积相关的ACOX基因及其应用，有助今后筛选脂肪含量高或者低的黑色鲤鱼。

为实现上述目的，本发明采用如下技术方案：

一种鲤鱼肌内脂肪沉积相关的酰基辅酶A氧化酶(acyl-CoenzymeAoxidase1,palmitoyl，ACOX)基因，分别命名为ACOX-L，ACOX-M；基因的CDS序列全长均为1983bp，其核苷酸序列分别为SEQ.ID.NO.1、SEQ.ID.NO.2。

所述鲤鱼肌内脂肪沉积相关ACOX基因编码的氨基酸序列，ACOX基因编码660个氨基酸，氨基酸序列分别为SEQ.ID.NO.11、SEQ.ID.NO.21。

所述鲤鱼肌内脂肪沉积相关ACOX基因在筛选脂肪含量高或者低的鲤鱼中的应用。

所述的应用，包括如下步骤：

1)采集同期孵化同池养殖的鲤鱼的肝脏、肌肉样品，抽提总RNA；并以总RNA为模板进行RT反应；

2)根据鲤鱼肌内脂肪沉积相关ACOX基因的核苷酸序列设计的特异定量引物，以步骤1)中的鲤鱼的RT反应产物为模板进行实时定量PCR检测；

3)统计实时定量PCR检测结果，挑选鲤鱼肌内脂肪沉积相关ACOX基因表达量高的鲤鱼。

步骤2)中引物为：正义引物序列为：

ACOX-L-DF:5′CTGCACTTGGGCATGTTCCTG3′；

ACOX-M-DF:5′GTGTATCAAGAGCCCTTTGGTGTCC3′；

反义引物为：ACOX-DR:5′CAGCTGAGCCAGGACTATAGCATG3′。

步骤2)中采用PremixExTaq^TMII(TAKARA)试剂盒进行实时定量PCR检测，PCR体系总体积20μL，其中含SYBRMix10μL，上下游引物各0.8μL，cDNA模板2μL，用灭菌双蒸馏水补足体积。

有益效果：本发明提供了一种与鲤鱼肌内脂肪沉积相关的ACOX基因，以及该基因编码的蛋白质，可以为今后筛选脂肪含量高或者低的黑色鲤鱼提供分子基础。

附图说明

图1为脂肪含量不同的建鲤、荷包红鲤的肝脏组织中，ACOX-L与ACOX-M基因的相对表达结果；

图2为脂肪含量不同的建鲤、荷包红鲤的肌肉组织中，ACOX-L与ACOX-M基因的相对表达结果。

具体实施方式

实施例1