[发明专利]一种快速筛查疾病候选标志物或靶标的方法在审
| 申请号： | 201510828705.7 | 申请日： | 2015-11-24 |
| 公开（公告）号： | CN105316416A | 公开（公告）日： | 2016-02-10 |
| 发明（设计）人： | 杜红丽;陈毓新;姜晓腾 | 申请（专利权）人： | 华南理工大学 |
| 主分类号： | C12Q1/68 | 分类号： | C12Q1/68 |
| 代理公司： | 广州市华学知识产权代理有限公司 44245 | 代理人： | 罗观祥 |
| 地址： | 510640 广*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 快速 疾病 候选 标志 靶标 方法 | ||
【权利要求书】：
1.一种整合转录组、代谢组和KEGG数据快速筛查疾病候选标志物或靶标的方法，其特征在于包括如下步骤：
(1)整理代谢物数据：在HMDB中下载特定疾病的所有代谢物数据，并解压到一个文件A中；或用已有的代谢物信息按照HMDB相应格式整理好，放在一个文件A中；
(2)下载和分析转录组数据：在NCBIGEO数据库对特定疾病的转录组数据进行检索，收集GEO数据；将GEO数据通过提取表达值，然后归一化之后，再进行t-test的分析和贝叶斯平滑处理；最后提取出差异表达基因；将差异表达基因进行DAVID聚类分析，得到各基因所在KEGG通路的文件B；
(3)将步骤(1)中的文件A和步骤(2)中的文件B在软件Associationanalysis中整理成标准的格式，然后读取数据并输出KEGG的通路图。
2.权利要求1所述的整合转录组、代谢组和KEGG数据快速筛查疾病候选标志物或靶标的方法在疾病标志物或靶标分离鉴定中的应用。
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