[发明专利]一套适于大白菜品种核酸指纹数据库构建的核心SNP标记及其应用有效
申请号: | 201510837629.6 | 申请日: | 2015-11-26 |
公开(公告)号: | CN105779581B | 公开(公告)日: | 2019-07-02 |
发明(设计)人: | 于拴仓;苏同兵;张凤兰;余阳俊;张德双;赵岫云;汪维红;卢桂香;隋光磊 | 申请(专利权)人: | 北京市农林科学院 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 关畅;白艳 |
地址: | 100097 北京市海淀区*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一套 适于 大白菜 品种 核酸 指纹 数据库 构建 核心 snp 标记 及其 应用 | ||
1.大白菜基因组中的96个SNP位点在如下任一中的应用:
(1)大白菜品种进行基因分型;
(2)构建大白菜DNA指纹数据库;
(3)大白菜种质资源遗传多样性分析和/或进化分析和/或聚类分析;
(4)鉴别或辅助鉴别大白菜品种;
(5)检测任意两个大白菜的相似性;
所述96个SNP位点如下:
SNP位点1为A01染色体上的第1248141位核苷酸;
SNP位点2为A01染色体上的第4225329位核苷酸;
SNP位点3为A01染色体上的第7102966位核苷酸;
SNP位点4为A01染色体上的第9716212位核苷酸;
SNP位点5为A01染色体上的第14897192位核苷酸;
SNP位点6为A01染色体上的第16592150位核苷酸;
SNP位点7为A01染色体上的第18635734位核苷酸;
SNP位点8为A01染色体上的第22449302位核苷酸;
SNP位点9为A01染色体上的第24456539位核苷酸;
SNP位点10为A01染色体上的第26752589位核苷酸;
SNP位点11为A02染色体上的第751652位核苷酸;
SNP位点12为A02染色体上的第2421548位核苷酸;
SNP位点13为A02染色体上的第6035955位核苷酸;
SNP位点14为A02染色体上的第9423555位核苷酸;
SNP位点15为A02染色体上的第11181828位核苷酸;
SNP位点16为A02染色体上的第14862673位核苷酸;
SNP位点17为A02染色体上的第18425637位核苷酸;
SNP位点18为A02染色体上的第21426261位核苷酸;
SNP位点19为A02染色体上的第23096858位核苷酸;
SNP位点20为A02染色体上的第23181920位核苷酸;
SNP位点21为A02染色体上的第25360564位核苷酸;
SNP位点22为A03染色体上的第128271位核苷酸;
SNP位点23为A03染色体上的第3151130位核苷酸;
SNP位点24为A03染色体上的第4471683位核苷酸;
SNP位点25为A03染色体上的第7828461位核苷酸;
SNP位点26为A03染色体上的第12523505位核苷酸;
SNP位点27为A03染色体上的第15431305位核苷酸;
SNP位点28为A03染色体上的第18277222位核苷酸;
SNP位点29为A03染色体上的第21003111位核苷酸;
SNP位点30为A03染色体上的第23890389位核苷酸;
SNP位点31为A03染色体上的第26316567位核苷酸;
SNP位点32为A03染色体上的第30080620位核苷酸;
SNP位点33为A04染色体上的第1223515位核苷酸;
SNP位点34为A04染色体上的第6933634位核苷酸;
SNP位点35为A04染色体上的第8662680位核苷酸;
SNP位点36为A04染色体上的第9741929位核苷酸;
SNP位点37为A04染色体上的第11311194位核苷酸;
SNP位点38为A04染色体上的第12579896位核苷酸;
SNP位点39为A04染色体上的第13764622位核苷酸;
SNP位点40为A04染色体上的第14413900位核苷酸;
SNP位点41为A05染色体上的第487586位核苷酸;
SNP位点42为A05染色体上的第1283352位核苷酸;
SNP位点43为A05染色体上的第2835432位核苷酸;
SNP位点44为A05染色体上的第4379811位核苷酸;
SNP位点45为A05染色体上的第8088873位核苷酸;
SNP位点46为A05染色体上的第10705210位核苷酸;
SNP位点47为A05染色体上的第14960042位核苷酸;
SNP位点48为A05染色体上的第16182627位核苷酸;
SNP位点49为A05染色体上的第19009544位核苷酸;
SNP位点50为A05染色体上的第22962829位核苷酸;
SNP位点51为A06染色体上的第18887位核苷酸;
SNP位点52为A06染色体上的第6403261位核苷酸;
SNP位点53为A06染色体上的第13545093位核苷酸;
SNP位点54为A06染色体上的第14701558位核苷酸;
SNP位点55为A06染色体上的第16193195位核苷酸;
SNP位点56为A06染色体上的第18685199位核苷酸;
SNP位点57为A06染色体上的第21632076位核苷酸;
SNP位点58为A06染色体上的第23153503位核苷酸;
SNP位点59为A06染色体上的第24717886位核苷酸;
SNP位点60为A07染色体上的第246275位核苷酸;
SNP位点61为A07染色体上的第1028346位核苷酸;
SNP位点62为A07染色体上的第2970833位核苷酸;
SNP位点63为A07染色体上的第6101124位核苷酸;
SNP位点64为A07染色体上的第11498098位核苷酸;
SNP位点65为A07染色体上的第14523031位核苷酸;
SNP位点66为A07染色体上的第18060124位核苷酸;
SNP位点67为A07染色体上的第19894600位核苷酸;
SNP位点68为A07染色体上的第24460147位核苷酸;
SNP位点69为A08染色体上的第100717位核苷酸;
SNP位点70为A08染色体上的第2374634位核苷酸;
SNP位点71为A08染色体上的第8933259位核苷酸;
SNP位点72为A08染色体上的第10869244位核苷酸;
SNP位点73为A08染色体上的第15287418位核苷酸;
SNP位点74为A08染色体上的第16162051位核苷酸;
SNP位点75为A08染色体上的第17179902位核苷酸;
SNP位点76为A08染色体上的第20716882位核苷酸;
SNP位点77为A09染色体上的第583658位核苷酸;
SNP位点78为A09染色体上的第3817906位核苷酸;
SNP位点79为A09染色体上的第5122605位核苷酸;
SNP位点80为A09染色体上的第8876252位核苷酸;
SNP位点81为A09染色体上的第8877380位核苷酸;
SNP位点82为A09染色体上的第16265081位核苷酸;
SNP位点83为A09染色体上的第18332606位核苷酸;
SNP位点84为A09染色体上的第21636788位核苷酸;
SNP位点85为A09染色体上的第26520788位核苷酸;
SNP位点86为A09染色体上的第31873135位核苷酸;
SNP位点87为A09染色体上的第34559009位核苷酸;
SNP位点88为A09染色体上的第37238042位核苷酸;
SNP位点89为A10染色体上的第617354位核苷酸;
SNP位点90为A10染色体上的第5601251位核苷酸;
SNP位点91为A10染色体上的第6477381位核苷酸;
SNP位点92为A10染色体上的第8425118位核苷酸;
SNP位点93为A10染色体上的第12492205位核苷酸;
SNP位点94为A10染色体上的第13127812位核苷酸;
SNP位点95为A10染色体上的第13859895位核苷酸;
SNP位点96为A10染色体上的第15835648位核苷酸。
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