[发明专利]口蹄疫病毒O型、A型、AsiaⅠ型三重实时荧光RT-PCR检测试剂盒在审
申请号: | 201510844151.X | 申请日: | 2015-11-26 |
公开(公告)号: | CN105506176A | 公开(公告)日: | 2016-04-20 |
发明(设计)人: | 王善普;曹明慧;李秀梅;齐德林;杨作丰;王岩保;马健;马超峰;刘兆磊;王俊峰;陈新刚;耿玉静 | 申请(专利权)人: | 洛阳莱普生信息科技有限公司;辽宁省动物医学研究院;辽宁省动物疫病预防控制中心 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 洛阳公信知识产权事务所(普通合伙) 41120 | 代理人: | 时国珍 |
地址: | 471000 河南省*** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 口蹄疫病毒 asia 三重 实时 荧光 rt pcr 检测 试剂盒 | ||
技术领域
本发明涉及兽用生物诊断制品技术领域,具体涉及口蹄疫病毒O型、A型、AsiaⅠ型三重实时荧光RT-PCR检测试剂盒。
背景技术
口蹄疫(Footandmouthdisease,FMD)是由口蹄疫病毒(Footandmouthdiseasevirus,FMDV)引起的偶蹄动物发生的急性、热性和高度接触性传染病。口蹄疫在欧洲、亚洲、非洲、南北美洲及大洋洲历史上皆有过发生,欧洲、亚洲、拉丁美洲、非洲在近代史上从未间断发生。它破坏性很大,对生产、生活和经济等方面造成严重的危害,被世界动物卫生组织列为A类传染病之首。口蹄疫病毒具有多型性,共有7个血清型。不同血清型口蹄疫病毒之间,不能产生交互免疫,因此,快速准确地对口蹄疫病毒定型在口蹄疫的研究和防疫中至关重要。
我国周边国家和地区存在口蹄疫的流行,印度和中亚地区存在多种血清型病毒,印度素有“毒库”之称,中亚地区也被称为“病毒走廊”,我国有不同血清型病毒侵入的危险。当前对我国威胁较大的是O型、A型、AsiaI型3种血清型,O型、A型、AsiaI型3种血清型的RNA序列同源性为60%~70%。编码结构蛋白的Pl区比编码非结构蛋白的其他区域差异更大。用于设计分型引物的lD片断同源性约60%,而且同一血清型的病毒差异也比较大。这就给引物设计带来了困难。在引物设计时,要综合考虑方法的特异性和检出率,具有良好特异性的同时,叉要具有高检出率。本发明下载了49条O型FMDV序列、34条AsiaI型序列和57条A型序列,在充分比较同源性的基础上,选取了多个血清型之间同源性低、血清型内同源性高的基因区段。最后经过筛选,选取了比较理想的区段设计引物,在众多参考序列的基础上,提高了检出率。因此本发明建立的多重RT-PCR方法旨在用于区分这3种血清型病毒。
控制FMD的关键在于早发现、早隔离、早预防,因而快速、敏感、可靠的诊断方法受到人们的重视。目前,国内检疫、诊断该病常用的方法有病毒分离和酶联免疫吸附试验等,这些方法或需长时间才能获得检测结果,或检出率低。聚合酶链式反应(PCR)具有灵敏性高、特异性强、操作简便等特点,已被广泛用于分子生物学各个领域,在分子克隆、疾病诊断等方面发挥着重要作用。相对常规诊断方法。PCR检测准确、直接,对于口蹄疫病毒的快速定型具有重要意义。荧光PCR相较普通PCR操作更加方便快捷、灵敏度更高。因此,本发明利用荧光定量RT-PCR来区分O型、A型和AsiaⅠ型的FMDV,设计了3对引物和3条探针,并组建一种口蹄疫病毒O型、A型、AsiaⅠ型三重实时荧光RT-PCR检测试剂盒。
发明内容
本发明的目的是提供口蹄疫病毒O型、A型、AsiaⅠ型三重实时荧光RT-PCR检测试剂盒。
本发明为解决上述问题所采取的技术方案是:口蹄疫病毒O型、A型、AsiaⅠ型三重实时荧光RT-PCR检测试剂盒,包括病毒RNA提取试剂和RT-qPCR扩增试剂,其中RT-qPCR扩增试剂包括扩增反应液、酶系、阳性对照和阴性对照;
所述扩增反应液为5×HSOne-stepRT-PCRbuffer、三对引物、三条TaqMan荧光探针和灭菌超纯水的混合物;
用于检测口蹄疫病毒O型、A型和AsiaⅠ型的荧光定量RT-PCR引物和探针序列如下:
所述酶系为SuperM-MLVReverseTranscriptase、HotstartHiTaqDNAPolymerase和酶缓冲液混合物;
所述阳性对照为含FMDV病毒O型、A型、AsiaⅠ型基因片段的T载体质粒混合物,阴性对照为灭菌超纯水。
上述口蹄疫病毒O型、A型、AsiaⅠ型三重实时荧光RT-PCR检测试剂盒,所述病毒RNA提取试剂包括平衡液BL、缓冲液RG、缓冲液RD、缓冲液RW、RNA洗脱液、RNaseFree吸附柱和收集管、RNaseFree离心管以及实时荧光8联排管。
有益效果
本发明根据口蹄疫病毒O型、A型和AsiaⅠ型的基因序列,设计3对特异性引物和3条探针,能在一次PCR扩增过程中实现对口蹄疫病毒不同基因型的监测。本发明包含了病料提取RNA和RT-qPCR扩增所需的全部试剂,不需操作人员再另外准备,具有快速简便、灵敏度高、特异性强、稳定性好等优点,可最大限度的减少人为误差。
附图说明
图1是本发明试剂盒对口蹄疫病毒O型-A型-AsiaⅠ型混合物的三重检验结果;
图2是本发明试剂盒对O型口蹄疫病毒的敏感性试验结果;
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