[发明专利]一种烟草反转录转座子基因Ntrt1及其用途

说明书

本发明公开了一种烟草反转录转座子基因Ntrt1，其特征在于：具有SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列。其编码的蛋白质，其特征在于：具有SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示的氨基酸序列；用于调节烟草植株的高矮。

技术领域

本发明涉及一种烟草反转录转座子基因Ntrt1及其用途，属于植物基因工程领域。

背景技术

反转录转座子( retrotransposon) 是真核生物基因组中一类可移动的遗传元件，其转座依赖于反转录酶的反转录反应，以DNA-RNA-DNA方式进行。反转录转座子最早在动物和酵母中发现，在植物基因组中也广泛存在，且占基因组的比例也各不相同。例如，水稻基因中反转录转座子的比例约18%，而玉米中则达到50%~80%，在小麦中高达达90%。反转录转座子按其结构可分为两类：长末端重复反转录转座子(long terminal repeats,LTRs)和非长末端重复反转录转座子(non-long terminal repeats, non-LTRs)。LTR在转座子的5，端和3，端有一对同向高度相似的序列，主要包括一些调控元件，通常含有LTR转录需要的启动子和终止子，LTR的转录通常由RNA 聚合酶II负责，其方向为5，端到3，端。LTR类反转录转座子又可分为Ty1-copia与Ty3-gypsy两个亚类，他们都编码一个多聚蛋白（polyprotein），随后被蛋白酶切割形成有gag和pol 2个功能多肽。gag蛋白的主要功能是包涵反转录转座时的RNA中间体，而pol编码的蛋白主要是和反转录转座子的生活周期有关。non-LTR根据长度和组成的不同又可分为长散在元件(long interspersed nuclearelements，LINEs) 和短散在元件( short interspersed nuclear elements，SINEs) 两种类型。LINE在所有植物中都有分布，而SINE仅在被子植物中有分布。

植物反转录转座子在其基因组中具有较多的拷贝，其主要作用是造成染色体的倒位、易位、重复，以及核苷酸序列的缺失、插入等突变，从而对基因组的结构、大小及部分基因功能造成重要影响。

尽管利用生物信息学方法可以对为止功能基因进行预测，但基因的最终功能还是要靠生物学鉴定。随着分子生物学的发展，基因转导、反义技术、RNA干扰、基因敲除、基因芯片技术以及蛋白质组学等方法用于植物基因功能的鉴定。尤其是近年来，VIGS（Virusinduced gene silencing）作为一种快速的鉴定植物基因功能的方法，越来越受到研究者的重视。

因此，如何开发一种能够调节烟草株高的LTR类反转录转座子是本领域技术人员亟待解决的技术问题。

发明内容

本发明要解决的技术问题是：提供一种烟草反转录转座子基因Ntrt1以及该基因编码的蛋白质，该基因的活性与烟草植株高矮密切相关。

本发明的技术方案是：一种烟草反转录转座子基因Ntrt1，具有SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列。

一种烟草反转录转座子基因Ntrt1编码的蛋白质，具有SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示的氨基酸序列。

一种烟草反转录转座子基因Ntrt1用于调节烟草植株的高矮。

本发明的有益效果：本发明提供一个烟草LTR类反转录转座子基因，被命名为Ntrt1，编码3个ORF，研究了该基因在调节植物株高方面的功能。Ntrt1基因是调节烟草株高的重要的因子。