[发明专利]一种与高邮鸭育成中期体重、胸肌增长相关的分子标记、其获取方法及应用有效
申请号: | 201510883406.3 | 申请日: | 2015-12-03 |
公开(公告)号: | CN105349679B | 公开(公告)日: | 2019-06-21 |
发明(设计)人: | 宋卫涛;朱春红;徐文娟;陶志云;李慧芳;刘宏祥;章双杰;单艳菊;姬改革;王晓峰 | 申请(专利权)人: | 江苏省家禽科学研究所 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11 |
代理公司: | 北京东正专利代理事务所(普通合伙) 11312 | 代理人: | 蔡仲德 |
地址: | 江苏省扬*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 高邮 育成 中期 体重 胸肌 增长 相关 分子 标记 获取 方法 应用 | ||
本发明公开了一种与高邮鸭育成中期体重、胸肌增长相关的分子标记、其获取方法和应用,所述分子标记位于SEQ ID NO:1所示核苷酸的第185位,该位点的核苷酸为C或T。PCR扩增高邮鸭基因组DNA,扩增产物经连接酶检测反应后测序,通过序列分析获取与高邮鸭育成中期体重、胸肌增长相关的分子标记。该分子标记在筛选高邮鸭育成中期体重、胸肌增长相关性状中的应用,可以用于家系选育中的早期选择,在选配中提供分子依据。本发明分子标记为筛选高邮鸭育成中期体重、胸肌增长相关性状提供了新的方法。
技术领域
本发明属于家禽基因工程的技术领域,更具体地,涉及一种与高邮鸭育成中期体重、胸肌增长相关的分子标记、其获取方法及应用。
背景技术
肌肉生长抑制素(Myostatin,MSTN)又称GDF-8,属TGF-β超家族,是1997年发现的一种骨骼肌生长发育的负调控因子,其活性的丧失或降低,会引起动物肌肉的过度发育,表现为双肌性状。MSTN在骨骼肌中广泛表达的糖蛋白,其功能和表达量的变化可能会通过调节靶蛋白的表达来改变肌肉的纤维组成及造成肌肉重量的变化。MSTN对骨骼肌的生长有调节作用,其基因在猪、人、绵羊和牛已被定位和标记,但在家禽尤其是水禽育种过程中的研究及利用则相对缺乏研究和探索。
单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP),主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。SNP作为第三代分子标记,具有数量多、分布广、代表性强和遗传稳定性好等特点。目前已经在动植物的遗传多样性分析、基因作图、分子标记辅助育种和功能基因学的研究中得到了广泛的应用。结合PCR技术、电泳、荧光等方法的SNP检测方法,在动植物遗传育种中起到重要作用。高邮鸭是全国三大名鸭之一,生长发育快,肉质好,属于肉蛋兼用型地方品种。在育种工作中,与改变个体遗传特性(人工诱变)相比较,改变品种遗传结构相对容易。而现有技术中尚未发现与高邮鸭育成中期体重、胸肌增长相关的分子标记与应用。
发明内容
为了解决现有技术存在的不足,本发明提供了一种与高邮鸭育成中期体重、胸肌增长相关的分子标记、其获取方法及应用。
本发明提供了一种与高邮鸭育成中期体重、胸肌增长相关的分子标记,所述分子标记位于SEQ ID NO:1所示核苷酸的第185位,该位点的核苷酸为C或T。
本发明还提供了一种获取与高邮鸭育成中期体重、胸肌增长相关的分子标记的方法,PCR扩增高邮鸭基因组DNA,扩增产物经连接酶检测反应后测序,通过序列分析获取与高邮鸭育成中期体重、胸肌增长相关的分子标记。
其中,PCR扩增所用引物对序列如SEQ ID NO:2和SEQ ID NO:3所示。
其中,连接酶检测反应所用探针序列如SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6所示。
其中,连接酶检测反应产物长度101bp的为基因型CC,连接酶检测反应产物长度103bp的为基因型TT,连接酶检测反应产物长度101bp和103bp的为基因型CT。
本发明还提供了一种与高邮鸭育成中期体重、胸肌增长相关的分子标记在筛选高邮鸭育成中期体重、胸肌增长相关性状中的应用。
本发明的有益效果:本发明提供了一种与高邮鸭育成中期体重、胸肌增长相关的分子标记,针对该分子标记单核苷酸多态性,设计特定的引物扩增包含SNP位点的基因片段,然后进行连接酶检测反应,测序分析,能够简单、快速、低成本、精确地检测其单核苷酸的多态性。对上述SNP位点的基因型与高邮鸭育成中期体重、胸肌增重进行关联分析,可以用于家系选育中的早期选择,也可在选配中提供分子依据。本发明分子标记为筛选高邮鸭育成中期体重、胸肌增长相关性状提供了新的方法。
附图说明
图1是ABI3730型基因分析仪检测与Genemapper分析结果。
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