[发明专利]一种可视化检测不同基因型蔓枯病菌的引物及其应用在审
申请号: | 201510886224.1 | 申请日: | 2015-12-04 |
公开(公告)号: | CN105441542A | 公开(公告)日: | 2016-03-30 |
发明(设计)人: | 姚协丰;羊杏平;李苹芳;徐锦华;张曼;刘广;任润生 | 申请(专利权)人: | 江苏省农业科学院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/645 |
代理公司: | 南京经纬专利商标代理有限公司 32200 | 代理人: | 唐循文 |
地址: | 210014 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 可视化 检测 不同 基因型 病菌 引物 及其 应用 | ||
1.一种可视化检测不同基因型蔓枯病菌的引物,其特征在于由正向内引物DB17RG-FIP、反向内引物DB17RG-BIP、正向外引物DB17RG-F3、反向外引物DB17RG-B3和反向环引物DB17RG-LB组成;各引物序列具体如下:
DB17RG-FIP:5′-GTGAGGGCCCTGAGATGTTTG-AATTATTCGCCTACAAGCCGC-3′;
DB17RG-BIP:5′-CCGCATCCGACATCACCCTT-GCTTCGCCTTCCTCATCG-3′;
DB17RG-F3:5′-AGACCGCACTTTCGAGCT-3′;
DB17RG-B3:5′-GCGAACTGGCCAATGTGT-3′;
DB17RG-LB:5′-TCCACAAGGTCCCGCAAT-3′。
2.权利要求1所述引物在广谱检测RGI和RGII两种基因型蔓枯病菌中的应用。
3.一种可视化检测不同基因型蔓枯病菌的试剂盒,其特征在于含有权利要求1所述的引物。
4.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于包含1mL检测溶液,所述的检测溶液包含:40μM正向内引物DB17RG-FIP、40μM反向内引物DB17RG-BIP、5μM正向外引物DB17RG-F3、5μM反向外引物DB17RG-B3、20μM环引物DB17RG-LB、10mMdNTPs、20mMTris-HCl(pH8.8)、10mMKCl、10mM(NH4)2SO4、8mMMgSO4、0.1%TritonX-100、BstDNApolymerase352单位,8μM钙黄绿素(Calcein),0.3mMMnCl2。
5.权利要求3所述试剂盒广谱可视化检测不同基因型蔓枯病菌的方法,其特征在于以提取的DNA为模板,利用所述引物进行环介导恒温扩增反应;观察反应溶液颜色变化,黄绿色为蔓枯病菌;棕褐色则无蔓枯病菌。
6.根据权利要求5所述试剂盒广谱可视化检测不同基因型蔓枯病菌的方法,其特征在于:提取待检微生物的DNA,取2μLDNA模板,加入23μL试剂盒中的反应液中进行环介导恒温扩增反应,反应程序为:63℃,40min。
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