[发明专利]基于宏基因技术从霉变的甘蔗叶中筛选β-葡萄糖苷酶基因的方法在审
申请号: | 201510903621.5 | 申请日: | 2015-12-08 |
公开(公告)号: | CN105462999A | 公开(公告)日: | 2016-04-06 |
发明(设计)人: | 姚健;陈庆隆;张诚;钟国祥;桂伦;王洪秀;马吉平;陈柳萌 | 申请(专利权)人: | 江西省农业科学院农业应用微生物研究所 |
主分类号: | C12N15/56 | 分类号: | C12N15/56;C12N9/42;C12N15/10;C12Q1/68;C12Q1/34 |
代理公司: | 北京汇捷知识产权代理事务所(普通合伙) 11531 | 代理人: | 李宏伟 |
地址: | 330200 江西*** | 国省代码: | 江西;36 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 宏基 技术 霉变 甘蔗 筛选 葡萄 糖苷酶 基因 方法 | ||
1.一种β-葡萄糖苷酶基因,其特征在于,其核苷酸序列如SEQIDNO.1所示。
2.一种重组β-葡萄糖苷酶,其特征在于,其氨基酸序列如SEQIDNO.2所示。
3.一种重组β-葡萄糖苷酶的筛选方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)、霉变甘蔗叶微生物宏基因组DNA的提取:收集霉变的甘蔗叶10g,并将其剪至1-3cm长度,放入250ml三角瓶中;加入富集培养液,30℃震荡培养72h;离心收集菌体,菌体重悬于1.35mlDNA抽提buffer,混匀后加入0.15ml20%SDS,65℃水浴2h,期间每隔20min上下颠倒10次并液氮冷冻2min;6000g离心10min,收集上清,加入等v的氯仿,上下颠倒混匀;6000g离心10min,收集上清,加入0.6v的异丙醇,室温沉淀2h;16000g离心20min,弃上清,沉淀用75%的乙醇洗涤两次后,用ddH2O溶解,即得粗提液;
2)、构建宏基因组文库:用1%琼脂糖凝胶电泳检测DNA片段的大小,用核酸电泳检测仪检测DNA的浓度及纯度,对DNA进行纯化,并用限制性内切酶BamHI部分酶切总DNA,回收3-10kb的酶切片段;构建宏基因组文库;
3)、从宏基因组文库中筛选出β-葡萄糖苷酶基因,其核苷酸序列如SEQIDNO.1所示;
4)、对获得的β-葡萄糖苷酶基因进行克隆、表达,得到β-葡萄糖苷酶重组蛋白,其氨基酸序列如SEQIDNO.2所示。
4.根据权利要求3所述的重组β-葡萄糖苷酶的筛选方法,其特征在于,所述步骤1)中富集培养液包括以下组分:羧甲基纤维素钠5g/L;NaNO32g/L;K2PO31g/L;KCl0.5g/L;MgSO40.5g/L;FeSO40.01g/L,余量为水,以上总量为100ml。
5.根据权利要求3所述的重组β-葡萄糖苷酶的筛选方法,其特征在于,所述步骤1)中DNA抽提buffer包括以下组分:100mMTris-HCl,100mMEDTA-Na2,100mM磷酸缓冲液,1.5MNaCl,1%CTAB,以上组分总量为1.35ml,其中,Tris-HCl的pH为8.0,EDTA-Na2的pH为8.0,磷酸缓冲液的pH为8.0。
6.根据权利要求3所述的重组β-葡萄糖苷酶的筛选方法,其特征在于,所述步骤2)中构建宏基因组文库具体为:将回收得到的酶切片段和pUC118/BamHI(BAP)载体连接过夜,连接产物用PCR产物纯化试剂盒进行纯化后与电转化感受态细胞混合,冰上放置5min,转移DNA/细胞混合物至预冷的2mm电穿孔容器中,在电压为2,500V的条件下对电穿孔容器进行脉冲,立即添加900μl的LB至电穿孔容器中,37℃,180r/min,震荡培养30min,转化产物涂布到含有100μg/ml氨苄青霉素,0.5mM异丙基-β-D-硫代半乳糖吡喃糖苷和100μΜ5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D-半乳糖苷的平板上,平板倒置放入37℃培养箱中,培养15-18h;由此构建一个库容量达100000个转化子、多样性好的宏基因组文库。
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