[发明专利]一种柯萨奇病毒CA10型荧光定量PCR检测试剂盒在审
申请号: | 201510920462.X | 申请日: | 2015-12-11 |
公开(公告)号: | CN105331748A | 公开(公告)日: | 2016-02-17 |
发明(设计)人: | 戴立忠;丁海;周雷;刘佳 | 申请(专利权)人: | 湖南圣湘生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12R1/93 |
代理公司: | 北京弘权知识产权代理事务所(普通合伙) 11363 | 代理人: | 逯长明;许伟群 |
地址: | 410600 湖南省长*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 柯萨奇 病毒 ca10 荧光 定量 pcr 检测 试剂盒 | ||
1.一种柯萨奇病毒CA10型荧光定量PCR检测试剂盒,其特征在于,包括以下各组分:RNA提取溶液、RNA洗脱液、RT-PCR增强剂、内标、PCR反应液、CA10阳性对照品、CA10阴性对照品,其中,所述内标为插入pUC18T载体的长为128碱基对的人工合成DNA序列的重组体,浓度为1.00E+04copies/ml~5.00E+04copies/ml;128碱基对的序列如下所示:
5'-GTCCAGTACTTTCAAAGCTCGATCCCGGTAACTACCAAATCGGTACGTACCGGTTTAAAACCACCGATCGCCTCTTCCCAACCTGTACGTACGTACGTACGTCCAAAAGTTTCCACGTACGATCGATC-3'。
2.根据权利要求1所述的检测试剂盒,其特征在于,所述RNA提取溶液包括如下组分:
RNA提取溶液I:十二烷基硫酸钠,质量/体积0.2%~1.0%、曲拉通,体积/体积1.0%~4.0%,异硫氰酸胍0.2mol/L~1.0mol/L、100μg/ml~400μg/ml的磁珠;
RNA提取溶液II:4-羟乙基哌嗪乙磺酸100mmol/L~300mmol/L、pH6.5±0.2,氯化钠100mmol/L~300mmol/L;
RNA提取溶液III:曲拉通,体积/体积0.1%~1.0%、氯化钠100mmol/L~300mmol/L;
RNA提取溶液IV:矿物油。
3.根据权利要求1所述的检测试剂盒,其特征在于,所述RNA洗脱液为Tris-HCl0.8mol/L~1.2mol/L、EDTA0.1mol/L~1.0mol/L。
4.根据权利要求1所述的检测试剂盒,其特征在于,所述RT-PCR增强剂为Mn(OAc)2,其浓度为100mmol/L~500mmol/L。
5.根据权利要求1所述的检测试剂盒,其特征在于,所述PCR反应液包括5×PCR反应缓冲液,0.2mmol/L脱氧核糖核苷三磷酸,1U/μl~5U/μlTthDNA聚合酶,1U/μl~5U/μlH-TaqDNA聚合酶,0.2μmol/L~0.4μmol/L用于靶多核苷酸扩增的上游引物以及下游引物,0.2μmol/L~0.4μmol/L用于靶多核苷酸检测的探针,0.1μmol/L~0.2μmol/L用于扩增内标的上游引物以及下游引物,0.05μmol/L~0.2μmol/L用于检测内标的探针。
6.根据权利要求5所述的检测试剂盒,其特征在于,所述所述用于靶多核苷酸扩增的上下游引物及用于靶多核苷酸检测的探针,其碱基对序列分别为:
上游引物:5'-AGAGCTATTAGCAGTGCTACAAATG-3';
下游引物:5'-TCCAGTCTCTAATCGGTGTGAAC-3';
探针1:5'FAM-TGAATCCGCAGCCAACACCACTCC-BHQ13'。
7.根据权利要求5所述的检测试剂盒,其特征在于,所述用于扩增内标的上游引物以及下游引物以及用于检测内标的探针,其碱基对序列分别为:
上游引物:5'-GCTCGATCCCGGTAACTACCA-3';
下游引物:5'-GTACGTGGAAACTTTTGGACG-3';
探针:5'HEX-TCGGTACGTACCGGTTTAAAACCACC-BHQ13'。
8.根据权利要求1所述的检测试剂盒,其特征在于,所述CA10阳性对照品为CA10病毒基因体外转录RNA,其浓度为1.00~5.00E+05copies/ml。
9.根据权利要求1所述的检测试剂盒,其特征在于,所述CA10阴性对照品为经过灭菌处理的生理盐水。
10.使用根据权利要求1-9任一项所述的检测试剂盒用于检测样本中CA10-RNA的方法,包括如下步骤:
(1)试剂准备;
按照提取试剂1200μl~1ml/人份,CA10-内标1μl/人份的比例,取相应量的RNA提取溶液I及CA10-内标,充分混匀得提取溶液1-mix,瞬时离心后备用;
根据待测样本、阴性对照、阳性对照的数量,按照PCR反应液49μl/人份,RT-PCR增强剂1μl/人份的比例,取相应量的PCR反应液及RT-PCR增强剂,充分混匀,得PCR-mix,瞬时离心后备用;
(2)RNA提取:磁珠法提取CA10-RNA;
S01裂解病毒:准备无核酸酶的1.5mL离心管,每管加入200μl~1mlRNA提取溶液1-mix,然后加入100μl~1ml待测样本,盖上管盖,震荡混匀,瞬时离心后备用;
S02磁珠吸附核酸:在步骤S01瞬时离心后备用的溶液中加入50μl~400μlRNA提取溶液II,震荡混匀,室温静置10~30分钟;
S03去除杂质:静止结束后瞬时离心后,将离心管置于磁珠分离器上,2~5分钟后缓慢将溶液吸出弃用,保留磁珠备用;
S04洗涤:在备用的磁珠内加入400μl~1mlRNA提取溶液III和100μl~500μlRNA提取溶液IV,震荡混匀,瞬时离心后将离心管再次置于分离器上;
S05静止2~5分钟后,上清液分为两层,将吸头插入离心管底部,从底部开始缓慢将液体完全吸出丢弃,静置,将管底残余液体完全吸出丢弃,磁珠保留备用;
S06在上述保留备用的磁珠中加入10μl~100ulRNA洗脱液,将离心管壁上磁珠洗脱到管底,吸打混匀,室温静置5~30分钟后将离心管再次置于分离器上2~5分钟,然后将洗脱下来的RNA吸至新的1.5ml灭菌离心管中;
S07根据待测样本、阴性对照、阳性对照的数量,每个0.2mLPCR反应管加入45μlPCR-mix,并吸取步骤S06的新的灭菌离心管中已处理的样本RNA、阴性对照、阳性对照各5μl加入PCR-mix中,盖好管盖,形成待测样品;
(3)荧光PCR反应和结果分析:
选择FAM通道(Reportere:FAM,Quencher:None)检测CA10;选择HEX或VIC通道(Reporter:VIC,Quencher:None)检测内标;利用仪器自带的软件进行自动分析或者手动调节基线的开始值、结束值以及阈值线值进行分析,然后记录样本Ct值结果,根据各样本Ct值大小,判断检测结果。
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