[发明专利]黄瓜果实栅栏状表皮细胞基因Pe的Indel标记及其应用在审
申请号: | 201510953053.X | 申请日: | 2015-12-17 |
公开(公告)号: | CN105420235A | 公开(公告)日: | 2016-03-23 |
发明(设计)人: | 张圣平;顾兴芳;苗晗;张松;王烨 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院蔬菜花卉研究所 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/68 |
代理公司: | 北京海虹嘉诚知识产权代理有限公司 11129 | 代理人: | 吴泳历 |
地址: | 100081 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 黄瓜 果实 栅栏 表皮 细胞 基因 pe indel 标记 及其 应用 | ||
1.一种与黄瓜果实栅栏状表皮细胞基因Pe紧密连锁的Indel标记Indelpe02的引物,其特征在于:具有如下核苷酸序列:
Indelpe02-F/Indelpe02-R:
TCTCCTCCTATACATTCTCA/GAAGATTATGAGGATGAGAG
所述引物扩增的与黄瓜果实栅栏状表皮细胞基因Pe连锁的特征条带为125bp,其核苷酸序列如SeqIDNo.1所示;
所述引物扩增的与黄瓜果实扁平状表皮细胞基因pe连锁的特征条带为130bp,其核苷酸序列如SeqIDNo.2所示。
2.用于筛选包含果实栅栏状表皮细胞基因Pe的黄瓜材料的试剂盒,其特征在于,包括权利要求1所述的Indel标记Indelpe02的引物。
3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括进行PCR反应和/或电泳所需的试剂。
4.用于筛选具有果实栅栏状表皮细胞基因Pe的黄瓜材料的方法,其特征在于,采用权利要求1所述的Indel标记Indelpe02的引物和/或权利要求2或3所述的试剂盒进行如下步骤:
(1)采用所述Indel标记Indelpe02的引物对待选黄瓜材料的基因组DNA进行PCR扩增;
(2)对扩增结果进行凝胶电泳检测;
(3)从检测结果中筛选出现与黄瓜果实栅栏状表皮细胞基因Pe连锁的Indel标记特征条带一致的材料,所述与黄瓜果实栅栏状表皮细胞基因Pe连锁的Indel标记特征条带为125bp,其核苷酸序列如SeqIDNo.1所示。
5.根据权利要求4所述的方法,其中,所述PCR扩增的反应体系为:1.5ng/μlDNA模板,所述引物正向和反向各5ng/μl,0.5μl/μlGoGreenMasterMix,其余为双蒸水。
6.根据权利要求4或5所述的应用,其中,所述PCR扩增的反应程序为:94℃预变性4分钟;94℃变性15秒,55℃退火15秒,72℃延伸30秒,35个循环;72℃保温5分钟,16℃保存。
7.根据权利要求4所述的应用,其中所述凝胶电泳检测指,采用6%的非变性聚丙烯酰胺凝胶,于150V恒功率电泳分离,最后银染显色。
8.权利要求2或3所述的试剂盒的制备方法,其特征在于,组装试剂盒的试剂中包括权利要求1所述的Indel标记Indelpe02的引物,或
在标有筛选含果实栅栏状表皮细胞基因Pe的黄瓜材料的用途的包装内装有权利要求1所述的Indel标记Indelpe02的引物。
9.根据权利要求8所述的制备方法,其特征在于,组装试剂盒的试剂中还包括PCR反应和/或电泳所需的试剂,或
在标有筛选含果实栅栏状表皮细胞基因Pe的黄瓜材料的用途的包装内装有PCR反应和/或电泳所需的试剂。
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