[发明专利]楸树扦插生根率主效QTL位点qRR5的分子标记方法

说明书

本发明提供了楸树扦插生根率主效QTL位点qRR5的分子标记方法，属于分子遗传学领域。利用70对SSR分子标记确定楸树87份无性系材料的基因型结合其扦插生根率进行全基因组关联连锁分析，检测到楸树扦插生根率主效QTL位点qRR5，解释13.35%表型变异，SSR分子标记CB252与之极显著相关。本发明不但有助于解决我国楸树育种进展迟缓的问题，而且有助于解决现有育种技术对提高楸树扦插生根率成本高、时间长、稳定性低等技术难题，将加快我国楸树新品种培育与无性系林业发展。

技术领域

本发明提供了楸树扦插生根率主效QTL位点qRR5的分子标记方法，属于分子遗传学领域，专用于定向培育扦插易生根的楸树新品种。

背景技术

楸树(Catalpa bungei)属于紫葳科(Bignoniaceae)梓属(Catalpa)的优良珍贵用材树种。随着工业的发展和世界人口的增长、木材需求与日剧增，木材短缺已成为世界性问题，我国尤为突出。发展无性系林业成为缓解我国木材短缺问题的有效途径，而扦插生根率是制约无性系林业发展的瓶颈。楸树为扦插生根率低的树种，扦插生根困难限制了楸树无性系林业的发展。因此挖掘与扦插生根率相关的标记位点对培育扦插易生根的楸树新品种具有重要的意义。

SSR分子标记是目前应用最广泛的分子标记技术之一，被广泛的应用于基因定位、QTL定位、标记辅助育种和遗传连锁图谱的构建等方面。陈永霞等(陈永霞, 张新全, 马啸,谢文刚. SSR标记与扁穗牛鞭草农艺性状关联分析. 湖北农业科学, 2011, 50(7):1494-1498.)选用10对SSR引物对44份外部形态差异较大的扁穗牛鞭草进行扫描，进行性状与SSR标记的关联分析，其中找到18个SSR标记与8个农艺性状显著相关，并筛选出优异种质，加快扁穗牛鞭草的育种进程。

前期研究发现不同楸树无性系间扦插生根能力存在显著差异，根据生根率、单株生根数和单株最长根长等3个指标可以将其分为生根能力较差、生根能力中等、生根能力较好和易生根类等4个组 (马玲玲, 王鹏, 张振宇, 李林芳, 杨如同, 李亚. 梓属植物嫩枝扦插生根能力的评价. 北方园艺, 2014, (15): 72-77.)。该研究结果表明利用此群体开展关联分析，可能检测到扦插生根率相关的QTL位点或分子标记。目前还未见开展相关研究的论文或专利。

发明内容

本发明的目的是公布楸树扦插生根率主效QTL位点及其分子标记。

本发明的目的是通过以下技术方案实现的：利用SSR分子标记引物CB252的正向引物序列5’-TCGATTCTTGTCTTCCCCAC-3’和反向引物序列5’-TTGTTTTCCGATACGGGTTC-3’结合PCR技术扩增楸树嫩叶的基因组DNA，如果能扩增出410 bp 的DNA片段，则标志着楸树扦插生根率主效QTL位点qRR5的存在，利用TASSEL2.1软件的GLM程序测得对楸树扦插生根率的贡献率为13.35%。

有益效果：本发明首次公布了一个楸树扦插生根率的主效QTL位点及其分子标记，该标记将有利于缩短楸树的育种周期，降低育种成本，定向培育扦插生根率高的楸树品种，进而加速楸树的推广，最终为在缓解我国的优质木材短缺的问题上发挥重要的作用。

具体实施方式