[发明专利]一种酵母RAPD图谱的分析方法在审
申请号: | 201510957219.5 | 申请日: | 2015-12-21 |
公开(公告)号: | CN105368973A | 公开(公告)日: | 2016-03-02 |
发明(设计)人: | 张穗生 | 申请(专利权)人: | 张穗生 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 530226 广西壮族自*** | 国省代码: | 广西;45 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 酵母 rapd 图谱 分析 方法 | ||
1.一种酵母RAPD图谱的分析方法,其特征在于包括以下步骤:
1)收集具有酵母RAPD实验结果的文献;
2)在这些文献中选取相同随机引物的RAPD实验图谱;
3)将选取出的图谱进行合并分析,构建进化树,以进化树的形式,显示出不同文献酵母 菌株间的分子遗传相似性。
2.按权利要求1所述的方法,其中所述收集具有酵母RAPD实验结果的文献通过以下 步骤得到:检索国内外公开发表或公布的期刊论文、会议论文、毕业论文、研究报道、专利 和实验数据,检索到的文献经过筛选,获得具有RAPD实验结果的文献。
3.按权利要求1和权利要求2所述的方法,其中所述RAPD图谱为RAPD实验的核酸 电泳图谱。
4.按权利要求1所述的方法,其中所述相同随机引物为不同文献RAPD实验中采用的 核酸序列相同的引物。
5.按权利要求1所述的方法,其中所述的将选取出的图谱进行合并分析,构建进化树通 过以下步骤得到:利用电泳图谱处理软件,处理不同文献中相同随机引物的RAPD实验图谱, 通过与各RAPD图谱的DNA分子量marker大小比较,得到各图谱中不同样品RAPD产物的 DNA片段大小。按照DNA片段大小,将各菌株对应的RAPD扩增谱带转换成“1”和“0” 进行统计,如某条带出现,记为“1”,无该条带则记为“0”,这样将相同随机引物扩增产生 的各菌株RAPD产物转换为1,0矩阵,再利用得到的1,0矩阵建立进化树,通过建立进化 树软件得到进化树。
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