[发明专利]乙肝相关肝硬化分类的系统有效
申请号: | 201510964983.5 | 申请日: | 2015-12-21 |
公开(公告)号: | CN106909767B | 公开(公告)日: | 2021-11-05 |
发明(设计)人: | 李亦学;张卫红;侯婷;靳文静;王振;孙翔英 | 申请(专利权)人: | 北京旷博生物技术股份有限公司 |
主分类号: | G16H50/70 | 分类号: | G16H50/70;G06K9/62 |
代理公司: | 北京尚诚知识产权代理有限公司 11322 | 代理人: | 龙淳;顾小曼 |
地址: | 100176 北京市大兴区亦庄经*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 乙肝 相关 肝硬化 分类 系统 | ||
本发明提供了一种用逻辑回归数学模型进行的基于血浆microRNA标志物表达水平的乙肝相关肝硬化分类方法,利用血浆7个microRNA分子标志物组合的表达值,简单准确地诊断乙肝相关肝硬化。其系统的技术方案为:通过收集大量慢性乙型肝炎、乙肝相关肝硬化和健康样本血浆microRNA表达值建立数据库模块,存储用作训练集的原始数据库,及后续盲测数据;建立质量控制模块,去除由于实验误差导致的极端值;建立模型分类模块,通过特征选择等方式构建并优化逻辑回归模型,经评估选择准确率最优的模型建立最终分类方法,采用两层分类模型(健康和肝病(慢性乙型肝炎/肝硬化),慢性乙型肝炎和乙肝相关肝硬化)判定盲测样本分类。
技术领域
本发明涉及乙肝相关肝硬化的分类方法和系统,具体来说涉及用逻辑回归数学模型进行基于血浆microRNA标志物表达水平的乙肝相关肝硬化分类的方法和系统。
背景技术
我国是病毒性肝炎大国,尤以乙肝患者人数居多。其中乙肝携带者约占总人口的8-10%,其中约有25%发展为慢性乙型肝炎、乙肝相关肝硬化,10%左右发展为肝细胞肝癌(HCC)。乙型肝炎病毒的感染不仅给人民带来了严重的健康危害,而且治疗等疾病相关费用也给患者和国家、社会带来巨大经济负担。
目前肝硬化临床诊断手段主要包括组织病理活检、FibroScan、彩色多普勒超声、CT、胃镜、血浆学指标等。但是这些单一技术或指标的临床应用都存在一些局限性和不足,均不能准确、及时诊断肝硬化进展程度,使得对肝硬化的分期诊断仍有赖于肝穿活检病理标准,临床迫切需要一个/一组方便、及时、无创的肝纤维化、肝硬化分级诊断指标。
microRNA(miRNA)最初发现于1993年,随着高通量测序技术的发展,近年来逐渐成为研究热点。microRNA能够结合于基因序列的侧翼区域阻遏或抑制靶mRNA的翻译,且具有高度的保守性、时序性和组织特异性。近年来的研究表明,肝炎病毒感染、慢性肝炎、肝硬化和microRNA密切相关,microRNA可以通过作用于病毒本身或作用于免疫系统从而影响疾病进程。研究表明,病毒感染的肝病患者microRNA表达谱和健康人组织的microRNA表达谱有明显不同。研究者们还发现在人类血清/血浆中存在大量稳定的小的核糖核酸分子,即microRNA,这为临床上通过检测血清/血浆中microRNA分子表达量诊断肝硬化奠定了基础。
综上所述,研究者们虽然已在该领域进行了研究,但是仍面临许多困难和挑战,均未能准确、及时诊断肝硬化进展程度。运用血清/血浆中microRNA标志物表达水平高低,为肝硬化诊断研究提供了新的思路。但目前尚未有关于肝硬化 microRNA标志物或其组合表达变化的深入研究,仍需寻找可有效判断肝硬化的 microRNA标志物或其组合,特别是能将乙肝相关肝硬化与慢性乙型肝炎区别开来的microRNA标志物或其组合,以及基于得到的microRNA标志物组合表达水平,用数学模型构建一种合适且准确的乙肝相关肝硬化分类方法和系统。与传统的肝硬化以及乙型肝炎的诊断方法相比,使用microRNA标志物或其组合的方法具有更快速准确的优点。
发明内容
本发明的一个目的是提供了一种用逻辑回归数学模型进行基于血浆 microRNA标志物表达水平的乙肝相关肝硬化分类的方法,包括以下步骤:
a)使用训练集数据,建立原始数据库;
b)将上述训练集采用两层分类模型;
c)通过对上述训练集进行特征选择和数据优化构建并优化所述的逻辑回归数学模型;
d)进行预测评估;
e)根据预测评估结果选择最优模型并建立最终的分类方法;
f)收集独立的测试集样本用于模型的检验和评估。
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