[发明专利]一种华鲮DNA条形码标准检测基因及其应用有效
申请号: | 201510970709.9 | 申请日: | 2015-12-22 |
公开(公告)号: | CN105483227B | 公开(公告)日: | 2018-10-12 |
发明(设计)人: | 朱志飞;章晋勇;石琼;马兴宇;王敏;吴菲菲 | 申请(专利权)人: | 华大(镇江)水产科技产业有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869;C12N15/53 |
代理公司: | 南京天华专利代理有限责任公司 32218 | 代理人: | 徐冬涛;李晓峰 |
地址: | 212132 江苏省镇江市镇江新*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 dna 条形码 标准 检测 基因 及其 应用 | ||
本发明公开了一种华鲮DNA条形码标准检测基因及其应用,该DNA条形码标准检测基因为COI基因,其核苷酸序列如SEQ ID NO.1。本发明的华鲮DNA条形码物种鉴定方法采用可靠的DNA分子鉴定技术,快速、准确的鉴定了华鲮。与传统的形态学鉴定方法相比,该方法获得的标准基因序列有利于实现华鲮的分子鉴定,能有效缩短鉴定时间。
技术领域
本发明属于动物分子生物学领域,具体涉及一种华鲮DNA条形码标准检测基因及其应用。
背景技术
华鲮,学名:(Sinilabeo rendahli)为辐鳍鱼纲鲤形目,鲤科,野鲮亚科,华鲮属。俗称:青龙棒,桃花棒,野鲮鱼,青衣子,是中国的特有物种。体长,略呈棒状,尾柄高而宽厚。吻钝圆而突出,口下位,横裂。上唇前部光滑,为游离的吻皮所遮盖,两侧则有细小的乳突;下唇游离部分的内缘有许多小乳状突,下唇与下颌分离,其间有一深沟相隔,上颌为上唇所包。有1对短颌须,吻须常退化。侧线鳞45-47个。体背及体侧青黑色,鳞片紫绿色夹有红色,并具金属光泽;腹部微黄,鳍灰黑色。华鲮分布于长江上游干流及各大支流中,栖息于水流较急的河流及山涧溪流中,尤以川东盆地水流湍急、水质清澈的山涧溪流为多,为底栖性鱼类,喜集群生活。常出没于岩石间隙中,在石砾底的基质上觅食,利用下颌锐利的角质边缘刮取着生藻类,也食高等植物的枝叶、碎屑等。入冬以后,华鲮则数十尾甚至上百尾集群在深水洞穴越冬,很少外出活动。2龄即可性成熟。亲鱼于4-6月集群进入支流产卵,产卵场为石砾底质的急流浅滩滩尾。华鲮生长较缓慢,一般个体为1-2公斤,最大个体可达5公斤,在产地产量较高,是四川省常见食用鱼类。其肉质坚实脆嫩、十分鲜美、富含油脂,与青鱼相似,被视为珍贵食品。华鲮及其相近种,除去内脏和鳞的肌肉称之为“竹鱼”。其鲜鱼肉入药,具有益气和中、除湿的功效,主治久病体虚、腰腿疼痛等症。
DNA条形码技术(DNA barcoding)是指用基因组内一段标准的、短的DNA片段来鉴定物种的一项分子鉴定新技术,可以快速、准确的进行物种鉴定。目前在动物中最常见的分子标记是线粒体细胞色素C氧化酶亚基I(cytochrome coxidase I,COI)基因的部分序列。DNA条形码具有广泛的应用前景,在物种鉴定、分子进化、种群遗传、濒危物种保护等研究领域具有一定的发展潜力。DNA条形码不同于以往的传统鉴别方法,对研究人员的专业技能并无较高要求,上至生物学家,下至普通生物爱好者,都可在短时间内掌握该技术。DNA条形码技术摆脱了传统形态鉴定方法依赖长期经验的障碍,可实现快速准确的鉴定,是分子鉴定方法学上的创新,操作简单、效率高、应用广等特点无疑将改变整个物种鉴定领域的发展方向。运用DNA条形码技术,可以很好的对华鲮进行快速、有效的鉴定。
物种鉴定一直是分类学乃至几乎所有生物领域上的研究至关重要的基础步骤。因此,准确的对物种鉴定,特别是对那些稀有物种和具有保护意义的种类,分类鉴定工作就显得尤其重要。自从2003年,加拿大科学家Hebert提出以COI基因做为DNA条形码以来,越来越多的研究表明DNA条形码在物种分类上具有高效可行性。大量的研究结果显示以COI基因为标记的DNA条形码能够准确的对各类动物进行物种鉴定,可以选用COI基因作为各种动物条形码数据库的标准条形码。
该方法与传统的分类学方法互为佐证,不仅可以解决形态学鉴定中因标本残缺不全无法准确鉴定等问题,而且鉴定时间也极大缩短。目前已有专门的鱼类数据库,其中包括1.5万多种鱼类的条形码数据。但是我国许多鱼类由于其特有性,没有足够的相关数据。也没有华鲮的相关基因序列。
发明内容
本发明的目的在于提供一种用于鉴定华鲮的DNA条形码标准检测基因。
本发明的另一目的在于提供上述用于鉴定华鲮的DNA条形码标准检测基因在鉴定待测标本中的应用。
本发明的又一目的在于提供一种华鲮DNA条形码物种鉴定方法,该方法有利于实现华鲮的快速准确鉴定,缩短鉴定时间。
本发明的目的可以通过以下技术方案实现:
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