[发明专利]转录因子GATA3调控鸡肠道内糖转运蛋白SGLT1和GLUT5表达的方法在审
申请号: | 201510983849.X | 申请日: | 2015-12-24 |
公开(公告)号: | CN105463017A | 公开(公告)日: | 2016-04-06 |
发明(设计)人: | 张利环;李慧锋;朱芷葳;张瑜;李玲香 | 申请(专利权)人: | 山西农业大学 |
主分类号: | C12N15/85 | 分类号: | C12N15/85;C12N15/67 |
代理公司: | 太原晋科知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 14110 | 代理人: | 郑晋周 |
地址: | 030800 山西*** | 国省代码: | 山西;14 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 转录 因子 gata3 调控 肠道 转运 蛋白 sglt1 glut5 表达 方法 | ||
1.一种转录因子GATA3调控鸡肠道内糖转运蛋白SGLT1和GLUT5表达的方法,其特征在 于:首先对鸡小肠上皮细胞的体外分离培养及鉴定,获得培养细胞,然后利用生物信息学软 件寻找SGLT1和GLUT5基因5¢上游GATA3基因的结合位点,构建转录因子GATA3的真核表达载 体pcDNA3.1-GATA3,运用脂质体转染法将构建的真核表达载体pcDNA3.1-GATA3转染鸡小 肠上皮细胞,转染后收集鸡小肠上皮细胞并获得cDNA,最后利用实时荧光定量PCR检测cDNA 中目的基因GATA3、SGLT1和GLUT5的绝对表达量。
2.根据权利要求1所述的一种转录因子GATA3调控鸡肠道内糖转运蛋白SGLT1和GLUT5 表达的方法,其特征在于:具体包括如下步骤:
1).对鸡小肠上皮细胞的体外分离培养及鉴定:取15日龄的鸡胚,无菌操作取出小肠, 去除肠系膜分离小肠并清洗干净小肠组织块;采用嗜热菌蛋白酶HEPES消化液进行酶消化 组织块,使其形成细胞悬液,采用相差贴壁法培养鸡小肠上皮细胞,培养好鸡小肠上皮细胞 接种于细胞培养板,至于40℃7%CO2培养箱内培养;将培养好的鸡小肠上皮细胞采用倒置 相差显微镜进行形态学鉴定,通过免疫组化进行细胞鉴定,获得培养细胞;
2).构建转录因子GATA3的真核表达载体pcDNA3.1-GATA3:
A.引物设计:NCBI中查找鸡转录因子GATA3的基因序列信息,按查到的基因序列应用 Primer3.0进行在线引物设计,所设计的引物为GATA3基因PCR克隆引物和GATA3基因荧光定 量PCR引物,引物信息见表1;
表1PCR引物
B.PCR扩增相应的基因片段:使用表1中引物对GATA3基因片段进行PCR扩增反应,
C.纯化回收的PCR产物进行连接转化,制备真核表达载体pcDNA3.1-GATA3:通过凝 胶电泳,对PCR产物的进行割胶回收,纯化得到的PCR产物连接转化至DH5α感受态细胞,菌体 扩大培养,培养好的菌液进行PCR测序鉴定,测序正确的菌液提取GATA3质粒,获得真核表达 载体pcDNA3.1-GATA3;
3).绝对荧光定量PCR反应体系的建立:测序正确的菌液提取GATA3质粒,用微量核酸和 蛋白测定仪测定质粒DNA的浓度和纯度,利用公式(1)计算出质粒拷贝数:
质粒拷贝数(copies/μL)=质粒浓度(g/μL)×6.02×1023(/mol)/质粒的摩尔质量(g/ mol)公式(1);查找到所得质粒的相对分子质量,稀释质粒,将稀释的质粒作为绝对荧光定 量PCR标准曲线的模板,进行绝对荧光定量PCR扩增反应,获得标准曲线和溶解曲线;
4).GATA3生物信息学分析:通过ModuleMaster、TFbind软件预测GATA3转录因子对两种 糖类转运蛋白基因GLUT5、SGLT1上游1500bp的调控区内的结合位点,然后采用脂质体转染 法将真核表达载体转染至鸡小肠上皮细胞;
5).转染后鸡小肠上皮细胞RNA的提取及RT-PCR检测:首先收集转染后的鸡小肠上皮细 胞,用37℃水浴30min预热好不含Ca2+和Mg2+的PBS缓冲液反复冲洗的收集好的转染后的 鸡小肠上皮细胞,然后提取细胞RNA,用琼脂糖凝胶电泳检测RNA的完整性和稳定性,然后将 RNA反转录合成cDNA;
6).荧光定量PCR检测GATA3、GLUT5及SGLT1的表达量:用绝对荧光定量PCR测定 pcDNA3.1-GATA3转染试验中空白对照组、阴性对照组细胞目的基因GATA3、GLUT5及SGLT1 的表达量;
7).数据统计分析:应用SPSS17.0统计软件中的Duncans方法对数据进行多重比较,分 析GATA3基因的过表达对GLUT5及SGLT1基因的表达的影响。
3.根据权利要求2述的一种转录因子GATA3调控鸡肠道内糖转运蛋白SGLT1和GLUT5表 达的方法,其特征在于:所述GLUT5和SGLT1荧光定量PCR的引物为表2;
表2:SGLT1和GLUT5荧光定量PCR的引物
。
4.根据权利要求2述的一种转录因子GATA3调控鸡肠道内糖转运蛋白SGLT1和GLUT5表 达的方法,其特征在于:所述提取GATA3质粒是利用大提质粒盒提取得到GATA3质粒。
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