[发明专利]一种郁金香碎色病毒RT-LAMP检测试剂盒及检测方法在审
申请号: | 201511002790.8 | 申请日: | 2015-07-22 |
公开(公告)号: | CN105506178A | 公开(公告)日: | 2016-04-20 |
发明(设计)人: | 孔涛 | 申请(专利权)人: | 孔涛 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12R1/94 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 264205 山东省*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 郁金香 病毒 rt lamp 检测 试剂盒 方法 | ||
本发明是申请号为201510435866.X、申请日为2015年7月22日、发明名称为“一种 郁金香碎色病毒RT-LAMP检测试剂盒及检测方法”的专利的分案申请。
技术领域
本发明涉及微生物检测领域,具体地说,本发明涉及一种郁金香碎色病毒RT-LAMP 检测试剂盒及检测方法。
背景技术
郁金香是国际名花之一,以高贵、典雅为世界人民所宠爱,是欧亚等地区近20个国 家的国花。近年来,我国各地相继举办了郁金香花展,获得了较好的效益。虽然郁金香在我 国很早就有少量栽培,但大部分仍从荷兰等国家进口。20世纪80年代中后期以来,我国从国 外引进郁金香商品种球数量逐年成倍增长,其携带的一些有害生物也随之传入,包括真菌、 细菌、线虫和病毒等,潜在危害性很大。郁金香碎色病是种球常见感染之一,其造成种球退 化,严重影响了郁金香的生产。
引起郁金香碎色病的病原体是郁金香碎色病毒(Tulipabreakingvirus,TuBV), 病毒粒子大小为700nm×(12-13)nm。感染TuBV的主要症状是叶片出现浅绿色或灰白色条 斑,有时形成花叶,在红花和紫花品种上产生碎色花,花瓣上形成大小不等浅色斑点或条 斑,严重时植株生长不良,还可危害百合类花卉。
目前检测郁金香病毒多使用抗血清的ELISA法或RT-PCR法,然而这两种方法均存 在不足:ELISA法须制作抗血清,非特异反应多,易产生假阳性或假阴性结果,而RT-PCR灵敏 度和特异性不高。因此,有必要开发一种快速、准确的TuBV检测方法,以满足产业需求。
环介导恒温核酸扩增技术(loop-mediatedisothermalamplification,LAMP)是 近些年发展起来的一种新型的核酸扩增方法(见文献NotomiT,OkayamaH,MasubuchiH, YonekawaT,WatanabeK,AminoN,HaseT.Loop-mediatedisothermalamplification ofDNA.NucleicAcidsRes.2000Jun15;28(12):E63)。与常规PCR相比,LAMP无需模板的 热变性、温度循环、电泳及紫外观察等过程,短时间内即可实现大量拷贝数的核酸扩增,且 无需高端的仪器设备,具有特异性强、灵敏度高、易于判读、可定性定量等优势。
逆转录环介导等温扩增技术(RT-LAMP)是基于LAMP建立的RNA检测技术,其灵敏度 是普通RT-PCR的100倍。RT-LAMP扩增原理与LAMP相同,但在反应体系中增加了逆转录酶,使 RNA的逆转录和cDNA的LAMP扩增在同一试管中一步完成。
发明内容
本发明的目的在于提供一种郁金香碎色病毒RT-LAMP检测试剂盒及检测方法。
为了实现本发明的目的,在一个方面中,本发明提供一种郁金香碎色病毒RT-LAMP 检测试剂盒,其包括引物、反应缓冲液、AMV逆转录酶、BstDNA聚合酶和核酸染料,其中所述 引物的核苷酸序列如下所示:
外引物F3:TTAGCCATGCACTACTCTT(SEQIDNO:1)
外引物B3:CTTCGTAGTTCGTGAGTCA(SEQIDNO:2)
内引物FIP:CATCCCCATTGACAAAGTAACGG-TACACAT
GTTAAATCTGGAGTGT(SEQIDNO:3)
内引物BIP:ATTACTGGCTGTGCATCCTGA-TTCAAACCC
AACTGCTCG(SEQIDNO:4)。
优选地,所述外引物F3和所述外引物B3的浓度均为5pmol/μl,所述内引物FIP和所 述内引物BIP的浓度均为40pmol/μl。
优选地,所述反应缓冲液由10mMdNTP、10×ThermoPol反应缓冲液、5mM甜菜碱和 50mMMgSO4组成。
优选地,所述BstDNA聚合酶的浓度为8U/μl。
优选地,所述核酸染料为SYBRGreenI。
优选地,本发明的试剂盒进一步包括RNA提取试剂以及阳性对照和阴性对照。
在另一个方面中,本发明还提供一种郁金香碎色病毒RT-LAMP检测方法,其包括以 下步骤:
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