[发明专利]基于变异位点检测的EB病毒分型试剂盒

说明书

本发明涉及选自EB病毒基因组的变异位点的组合在制备EB病毒分型试剂盒中的用途，以及基于这些变异位点检测的EB病毒分型试剂盒。本发明所述的选自EB病毒基因组的5个变异位点的组合在制备EB病毒分型试剂盒中的用途，所述变异位点为：loc613、loc632、loc7048、loc44531和loc146628。本发明所述的基于变异位点检测的EB病毒分型试剂盒，该试剂盒包括针对EB病毒基因组的5个变异位点的组合的PCR扩增引物和单碱基延伸引物，所述变异位点为：loc613、loc632、loc7048、loc44531和loc146628。本发明所述的试剂盒可以建立EB病毒亚型分类标准，估算个体罹患鼻咽癌的相对风险程度，适合鼻咽癌高发区人群筛查，对于肿瘤预防、肿瘤早诊早治、提升预后都有积极的指导意义和重要的应用价值。

技术领域

本发明属于PCR检测试剂盒领域，涉及选自EB病毒基因组的变异位点的组合在制备EB病毒分型试剂盒中的用途，以及基于这些变异位点检测的EB病毒分型试剂盒。

背景技术

随着人类平均寿命的延长和生活行为方式等的改变，恶性肿瘤已成为严重威胁人类健康的重要疾病和全球重大的公共卫生问题。近年来，中国恶性肿瘤呈高发态势，每年的新增病例占全球新增病例的20％以上，据统计，中国每年新发癌症病例约达350万，死亡病例超过200万，是我国民众的重要死亡原因。通过实施以证据为基础的癌症预防、早期发现和癌症患者管理策略，可使癌症得以减少和控制。

鼻咽癌是我国常见的恶性肿瘤之一，每年新增病例约占全球的80％，多见于华南地区的广东、广西、海南、福建、湖南、江西等省份。鼻咽癌的病因学研究表明，遗传、环境与EB病毒感染是其发病的主要原因。由于鼻咽腔位置隐蔽、早期症状不明显，以致早期诊断率较低，较大地影响了鼻咽癌患者的生存率，而筛查是目前为止提高鼻咽癌患者早诊率、降低其死亡率的较好方法。

EB病毒是第一个被发现与人类肿瘤发生相关的病毒，其在全球人群中广泛感染，感染率达到90％，多以无症状感染方式潜伏于个体B淋巴细胞；除鼻咽癌外，EB病毒感染还与多种肿瘤发生有关，包括伯基特淋巴瘤、霍奇金淋巴瘤、NK/T细胞性淋巴瘤以及部分胃癌等。EB病毒演变和特定亚型选择并最终导致鼻咽癌等疾病局部高发的机制仍有待解释。然而，EB病毒分型是标识病毒基因序列差异、发现疾病特异病毒亚型的基础。以往大量研究工作主要根据EB病毒基因组个别位点或区域的基因序列信息来对EB病毒进行分类，对于鼻咽癌来说，其中某些分型并不特异，同一区域的正常对照人群与鼻咽癌患者存在相近的EB病毒亚型感染率，并且这种穷举策略，相对于约172Kb的EB病毒基因组而言，大大降低了检出鼻咽癌相关的EB病毒亚型的可能性。

目前，尚无特效的针对鼻咽癌的EB病毒疫苗，鉴定出鼻咽癌相关的EB病毒变异和亚型对于疫苗的研发设计十分重要，同时也给鼻咽癌治疗的靶点研究及个体化诊疗提供重要参考。因此，在全基因组水平对EB病毒序列进行分析，鉴定出鼻咽癌相关的病毒变异位点及病毒亚型，可用于鼻咽癌高发区人群筛查、鼻咽癌发病高危人群早诊早治及疾病治疗研究，并最终使鼻咽癌患者得到及时诊断和有效治疗，改善患者预后，减轻个人、家庭和社会的肿瘤负担。

发明内容

本发明的第一个目的是提供了选自EB病毒基因组的变异位点的组合在制备EB病毒分型试剂盒中的用途，具体是选自EB病毒基因组的5个变异位点的组合在制备EB病毒分型试剂盒中的用途，所述变异位点为：loc613、loc632、loc7048、loc44531和loc146628。

优选地，所述变异位点为：loc613C/G、loc632C/G、loc7048A/C、loc44531C/T和loc146628C/T。

本发明的第二个目的是提供了一种基于变异位点检测的EB病毒分型试剂盒，可以建立EB病毒亚型分类标准，估算个体罹患鼻咽癌的相对风险程度，适合鼻咽癌高发区人群筛查，对于肿瘤预防、肿瘤早诊早治、提升预后都有积极的指导意义和重要的应用价值。