[发明专利]茄子SmHY5蛋白及其编码基因有效
申请号: | 201511004882.X | 申请日: | 2015-12-28 |
公开(公告)号: | CN105440115B | 公开(公告)日: | 2019-02-22 |
发明(设计)人: | 陈火英;蒋明敏;刘杨;任丽 | 申请(专利权)人: | 上海交通大学 |
主分类号: | C07K14/415 | 分类号: | C07K14/415;C12N15/29;C12Q1/68;C12N15/11;C12N15/82;A01H5/00;A01H6/82 |
代理公司: | 上海汉声知识产权代理有限公司 31236 | 代理人: | 郭国中;陈少凌 |
地址: | 200240 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 茄子 smhy5 蛋白 及其 编码 基因 | ||
本发明公开一种茄子SmHY5(Long Hypocotyl 5)基因及其功能分析,所述基因的cDNA具有SEQ ID NO.1中所示的核苷酸序列。所述基因编码的氨基酸序列如SEQ ID NO.2中所示。该基因在根、茎、叶、花、果皮、果肉均有表达,且在各组织中的表达量均无显著差异。本发明为今后利用基因工程技术改良植物品质提供理论依据,具有很大的应用价值。
技术领域
本发明属于生物技术领域,涉及茄子光信号通路中的关键酶及其编码基因,具体涉及一种茄子SmHY5(Long Hypocotyl 5)蛋白及其编码基因。
背景技术
HY5是最早被发现的正调控光形态建成的转录因子,其编码的蛋白序列分析显示,HY5属于基本的亮氨酸型拉链(b-ZIP)型转录因子,它定位于细胞核,能够与多种光调控基因的启动子直接结合来调控这些基因的表达。对HY5蛋白水平的研究发现,HY5蛋白积累受到光的调控,持续黑暗条件下生长的拟南芥幼苗体内的HY5蛋白大部分被降解,几乎检测不到HY5蛋白的积累;而在照光条件下,HY5蛋白可以迅速积累;这种HY5的降解依赖于26S泛素蛋白酶体降解途径,而调控HY5降解的E3泛素连接酶正是光形态建成负调控因子COP1。黑暗条件下由于COP1定位在细胞核,降解了体内大部分的HY5蛋白,而在光照条件下,COP1由细胞核转移到细胞质,对HY5的降解得到解除而大量积累,这样HY5就可以行使功能了。
目前已从很多植物中克隆得到HY5基因,如拟南芥、葡萄、苹果、玉米等。茄子是重要的蔬菜作物,但相关研究相对比较滞后。目前,未有任何与茄子HY5基因及其编码蛋白的相关文献报道。
发明内容
针对现有技术中的缺陷,本发明的目的在于填补茄子HY5基因的空白。本发明提供了一种茄子HY5的cDNA以及氨基酸序列;进一步地,本发明提供了茄子SmHY5基因在不同组织器官的表达模式。
本发明的目的是通过以下技术方案实现的:
第一方面,本发明提供一种茄子HY5蛋白,包括SEQ ID No.2所示的氨基酸序列。
第二方面,本发明提供一种编码茄子HY5蛋白的基因核酸序列,所述基因的cDNA序列包括:
(a)如SEQ ID NO.1第1~477位所示的碱基序列;或
(b)与SEQ ID NO.1第1~477位所示的碱基序列具有至少70%的同源性的碱基序列;或
(c)能与SEQ ID NO.1第1~477位所示的碱基序列进行杂交的碱基序列。
优选地,所述cDNA序列包括SEQ ID NO.1第1~477位所示的核酸序列中1~90个核苷酸的缺失、插入和/或取代,以及在5′和/或3′端添加60个以内核苷酸。
第三方面,本发明提供一种用于扩增所述基因的引物对,所述引物对的碱基序列如SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.4所示。
第四方面,本发明提供一种编码茄子SmHY5蛋白的基因的荧光定量PCR分析的引物对,所述引物对的碱基序列如SEQ ID NO.5、SEQ ID NO.6所示。
第五方面,本发明提供一种编码茄子SmHY5蛋白的基因在基因工程调控植物在光下生长状况的用途。
优选地,所述植物包括拟南芥。
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