[发明专利]用于鉴定凶小库蚊的DNA条形码标准基因及应用有效
申请号: | 201511012652.8 | 申请日: | 2015-12-31 |
公开(公告)号: | CN105420385A | 公开(公告)日: | 2016-03-23 |
发明(设计)人: | 宋锋林;程晓兰;靳木子;姜陆;高玉峰;万雪 | 申请(专利权)人: | 宋锋林;程晓兰 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 大连博晟专利代理事务所(特殊普通合伙) 21236 | 代理人: | 于忠晶 |
地址: | 116000 辽*** | 国省代码: | 辽宁;21 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 鉴定 凶小库蚊 dna 条形码 标准 基因 应用 | ||
技术领域
本发明属于生物技术领域,特别涉及一种用于鉴定凶小库蚊的DNA条形码标准基因及应用。
背景技术
目前,国内外对媒介生物的分类鉴定主要依靠传统的形态学分类手段。该方法主要针对成虫阶段,对卫生监管实际工作中捕获的其他发育阶段(幼虫、蛹等)的媒介生物则受到限制;对外部形态相似的近缘种媒介生物的鉴定,形态学分类方法的准确度偏低;另外,实际工作中经常会采集到不完整的样品,形态学方法对残缺样品的鉴定遇到很多困难。在口岸检疫工作中,如果截获的是幼虫、卵、蛹等非成虫虫态,通常需要将其培养成成虫后再进行鉴定,整个检疫鉴定过程时间长达数周,也经常会采集到不完整的样品,形态学方法对残缺样品的鉴定遇到很多困难,大大地加长了通关周期,影响贸易往来。
近代分子生物学技术的兴起,为古老的昆虫学科注入了新的活力。在昆虫学研究领域,分子生物学技术主要应用于系统演化及分类鉴定两方面。昆虫系统演化的研究是从分子水平上找出其种间的DNA序列的特异性差异,主要目的为探索昆虫种、属间的相对亲缘关系,同时也为昆虫的分子鉴定奠定了基础。
DNA分类是以生物的DNA序列的差异为依据,来区分生物物种并构建全新的分类学系统(Tautzetal.,2002)。在生物分类中,以DNA序列作为生物物种识别的方法最初应用于病毒、细菌和原生动物类群的研究中,后来这种方法广泛应用于物种多样性的调查研究中,并积累了大量的数据和文献。2003年,DNA条形码概念首次提出:鉴定物种就如同使用商品UPC条形码,使用扫描仪就能识别。它的原理是利用基因组DNA上一段标准的或者大家公认的基因片段,作为分子靶标来进行种级水平的种类鉴定。DNA条形码序列与整个基因组DNA相比要短得多,而且非常容易获得。因为COI基因的通用引物可以很容易获得绝大多数动物的5’端序列,加拿大圭尔夫大学的学者Hebert等提出利用COI的特定区段来做DNA条形编码的基础,用于物种识别(Hebertetal.,2003;Remigio&Herbert,2003)。理论上,DNA序列上的每个位点都有A、T、G、C四种可能,45个碱基的序列就可以区分开近10亿个物种,这远远超过现存物种的总数,即使由于自然选择的原因,某些位点已经被固定,导致组合数减少一些,但是现代分子技术可以很容易的扩增出几百个碱基的序列,足够区分所有的物种(肖金花等,2004)。而且DNA序列属于数字信息,方便管理又具有可重复性,易于交流和联合分析(Hebertetal.,2003)。
DNA条形码技术为物种的鉴定提供了新的手段,弥补了传统分类的诸多不足。尤其适用于难以用形态分类特征进行鉴定的幼虫、卵等虫态。利用分子标记进行种类鉴定国际上已有不少的尝试,国际上第一篇利用DNA条形码进行物种鉴定的是2003年Hebert,随后Ball等(2005)尝试用分子条形码鉴别了70多种水生蜉蝣,游中华等(2007)用线粒体COI鉴别了入侵害虫西花蓟马及其他8种常见蓟马。肖金花等中国卫生检验杂志2011年3月第21卷第3期ChineseJournalofHealthLaboratoryTechnology,Mar2011;Vol21No3615(2004)综述了线粒体COI片段在物种鉴定方面的独特优点,并指出DNA条形码技术为生物分类学的新动向。
但由于目前DNA条形码数据库中种类不全,缺乏多个物种的标准DNA条形码参考序列,致使DNA条形码鉴定技术达不到实际应用的目的。
凶小库蚊雌蚊吸人血或牛、猪、马血等,是北方重要骚扰蚊种之一。目前,对凶小库蚊的分类鉴定主要依靠传统的形态学分类手段。该方法主要针对成虫阶段,对卫生监管实际工作中捕获的其他发育阶段(幼虫、蛹等)的媒介生物则受到限制;对与凶小库蚊外部形态相似的近缘种媒介生物的鉴定,形态学分类方法的准确度偏低。在检验检疫现实工作中,经常会截获的是幼虫、卵、蛹等非成虫虫态,通常需要将其培养成成虫后再进行鉴定,整个检疫鉴定过程时间长达数周,也经常会采集到不完整的样品,形态学方法对残缺样品的鉴定遇到很多困难,大大地加长了通关周期。
发明内容
本发明的首要目的是克服上述不足问题,提供一种用于鉴定凶小库蚊的DNA条形码标准基因。
本发明的另一目在于提供一种用于鉴定凶小库蚊的DNA条形码标准基因的应用方法。
本发明为实现上述目的所采用的技术方案是:用于鉴定凶小库蚊的DNA条形码标准基因,其特征在于:所述用于鉴定凶小库蚊的DNA条形码标准基因的核苷酸序列如下所示:
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