[发明专利]与绵羊角表型相关的RXFP2基因SNP标记组合及其应用有效
申请号: | 201511023518.8 | 申请日: | 2015-12-31 |
公开(公告)号: | CN105483125B | 公开(公告)日: | 2018-07-03 |
发明(设计)人: | 储明星;潘章源;刘秋月;狄冉;胡文萍;王翔宇;曹晓涵 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/6888 |
代理公司: | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人: | 王文君 |
地址: | 100193 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 绵羊角 表型 突变 国家生物技术 表型特征 地方品种 信息中心 畜牧生产 遗传进化 最新版本 基因 纯系 角型 位点 绵羊 数据库 科研 应用 研究 | ||
1.检测绵羊RXFP2基因上RXFP2-SNP1和RXFP2-SNP2两个SNP标记的引物在绵羊角表型鉴定中的应用,其特征在于,所述引物包括SEQ ID NO.3-4所示的扩增引物对和SEQ IDNO.5-6所示的延伸引物;
所述SNP标记RXFP2-SNP1为SEQ ID NO.1所示序列的互补序列的第1999位的C→T突变,所述SNP标记RXFP2-SNP2为SEQ ID NO.1所示序列的互补序列的第1957位的C→T突变;
当检测到SEQ ID NO.1所示序列的互补序列的第1999位为CT基因型,第1957位为CT基因型时绵羊具有螺旋并向两边延伸的角型;
当检测到SEQ ID NO.1所示序列的互补序列的第1999位为TT基因型,第1957位为CC基因型时绵羊具有螺旋并向两边延伸的角型;
当检测到SEQ ID NO.1所示序列的互补序列的第1999位为TT基因型,第1957位为CT基因型时绵羊具有螺旋并向两边延伸的角型;
当检测到SEQ ID NO.1所示序列的互补序列的第1999位为TT基因型,第1957位为TT基因型时绵羊具有螺旋并向两边延伸的角型;
当检测到SEQ ID NO.1所示序列的互补序列的第1999位为CC基因型,第1957位为CC基因型时绵羊无角或具有紧贴脸部旋转的角型;
当检测到SEQ ID NO.1所示序列的互补序列的第1999位为CT基因型,第1957位为CC基因型时绵羊无角或具有紧贴脸部旋转的角型。
2.根据权利要求1所述的应用,所述绵羊为藏羊、蒙古羊或小尾寒羊。
3.鉴定绵羊角表型的方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:
步骤一:以待测绵羊基因组DNA为模板,利用SEQ ID NO.3-4所示的扩增引物对和SEQID NO.5-6所示的延伸引物进行PCR扩增获得PCR产物;
步骤二:对PCR产物进行测序,根据测序结果判断绵羊角表型;
当检测到SEQ ID NO.1所示序列的互补序列的第1999位为CT基因型,第1957位为CT基因型时绵羊具有螺旋并向两边延伸的角型;
当检测到SEQ ID NO.1所示序列的互补序列的第1999位为TT基因型,第1957位为CC基因型时绵羊具有螺旋并向两边延伸的角型;
当检测到SEQ ID NO.1所示序列的互补序列的第1999位为TT基因型,第1957位为CT基因型时绵羊具有螺旋并向两边延伸的角型;
当检测到SEQ ID NO.1所示序列的互补序列的第1999位为TT基因型,第1957位为TT基因型时绵羊具有螺旋并向两边延伸的角型;
当检测到SEQ ID NO.1所示序列的互补序列的第1999位为CC基因型,第1957位为CC基因型时绵羊无角或具有紧贴脸部旋转的角型;
当检测到SEQ ID NO.1所示序列的互补序列的第1999位为CT基因型,第1957位为CC基因型时绵羊无角或具有紧贴脸部旋转的角型。
4.检测绵羊RXFP2基因上RXFP2-SNP1和RXFP2-SNP2两个SNP标记的的引物在纯系藏羊鉴定中的应用,其特征在于,当SEQ ID NO.1所示序列的互补序列的第1999位为TT基因型并且第1957位为TT基因型时,绵羊为纯系藏羊;
所述引物包括SEQ ID NO.3-4所示的扩增引物对和SEQ ID NO.5-6所示的延伸引物。
5.检测绵羊RXFP2基因上RXFP2-SNP1和RXFP2-SNP2两个SNP标记的的引物在绵羊育种中的应用,其特征在于,所述引物包括SEQ ID NO.3-4所示的扩增引物对和SEQ ID NO.5-6所示的延伸引物;利用所述引物对绵羊进行鉴定,选择SEQ ID NO.1所示序列的互补序列的第1999位为TT基因型并且第1957位为TT基因型的绵羊进行育种。
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