[发明专利]检测FIX基因全外显子的方法和引物在审

专利信息
申请号: 201511023610.4 申请日: 2015-12-30
公开(公告)号: CN105506106A 公开(公告)日: 2016-04-20
发明(设计)人: 李文静;林有升;王淑一 申请(专利权)人: 杭州艾迪康医学检验中心有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 浙江杭州金通专利事务所有限公司 33100 代理人: 黄素萍;徐关寿
地址: 310030 浙江省杭州市西湖区振*** 国省代码: 浙江;33
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摘要:
搜索关键词: 检测 fix 基因 全外显子 方法 引物
【权利要求书】:

1.检测FIX基因全外显子的引物,其特征在于,包括:扩增覆盖检测FIX基因全外显子的正、反向引物;其碱基序列为:

FIX-1-F:TGTAAAACGACGGCCAGTGTACAACTAATCGACCTTACCACTT

FIX-1-R:AACAGCTATGACCATGCGTGCTGGCTGTTAGACTCT

FIX-2+3-F:TGTAAAACGACGGCCAGTCCCTAAAGAGAAATTGGCTTTCAG

FIX-2+3-R:AACAGCTATGACCATGGAATTGCTTACCAACATACTGCTTC

FIX-4F:TGTAAAACGACGGCCAGTTGGCTTCCAGGTCAGTAGTT

FIX-4R:AACAGCTATGACCATGAGGTGAGTCGGAACATCATTATTAC

FIX-5F:TGTAAAACGACGGCCAGTCACTCTTATTTCAAGGCTCCAA

FIX-5R:AACAGCTATGACCATGAAGGAAGCAGATTCAAGTAGGA

FIX-6F:TGTAAAACGACGGCCAGTGCTTGAGACTCTATTCACTGATTAG

FIX-6R:AACAGCTATGACCATGCATCCCAATAGGTCTGTCTAGTA

FIX-7F:TGTAAAACGACGGCCAGTGCCAGCACCTAGAAGCCAATA

FIX-7R:AACAGCTATGACCATGCCCTTCTGCCTTTAGCCCAAT

FIX-8F:TGTAAAACGACGGCCAGTGGTGAACATAATATTGAGGAGACAG

FIX-8R:AACAGCTATGACCATGTTAGTTAGTGAGAGGCCCTGTTAA。

2.如权利要求1至2之一所述的引物,其特征在于,所述7对正、反向引物的使用浓度比为:FIX-1F:FIX-1R=1:1;FIX-2+3F:FIX-2+3R=1:1;FIX-4F:FIX-4R=1:1;FIX-5F:FIX-5R=1:1;FIX-6F:FIX-6R=1:1;FIX-7F:FIX-7R=1:1;FIX-8F:FIX-8R=1:1。

3.一种检测检测FIX基因全外显子序列的方法,其包括如下步骤:

(1)提取样品DNA;

(2)利用7对扩增引物FIX-1F与FIX-1R;FIX-2+3F与FIX-2+3R;FIX-4F与FIX-4R;FIX-5F与FIX-5R;FIX-6F与FIX-6R;FIX-7F与FIX-7R;FIX-8F与FIX-8R。对(1)中的DNA分别进行扩增,获得覆盖检测FIX基因全外显子的扩增产物;

(3)利用1对测序引物M13-F与M13-R对(2)中的扩增产物分别进行正向和反向测序,获得所述扩增产物的基因序列;

(4)将(3)中的基因序列与野生型FIX序列进行比较,确定突变位点是否存在;

其中所述引物序列为:

FIX-1-F:TGTAAAACGACGGCCAGTGTACAACTAATCGACCTTACCACTT

FIX-1-R:AACAGCTATGACCATGCGTGCTGGCTGTTAGACTCT

FIX-2+3-F:TGTAAAACGACGGCCAGTCCCTAAAGAGAAATTGGCTTTCAG

FIX-2+3-R:AACAGCTATGACCATGGAATTGCTTACCAACATACTGCTTC

FIX-4F:TGTAAAACGACGGCCAGTTGGCTTCCAGGTCAGTAGTT

FIX-4R:AACAGCTATGACCATGAGGTGAGTCGGAACATCATTATTAC

FIX-5F:TGTAAAACGACGGCCAGTCACTCTTATTTCAAGGCTCCAA

FIX-5R:AACAGCTATGACCATGAAGGAAGCAGATTCAAGTAGGA

FIX-6F:TGTAAAACGACGGCCAGTGCTTGAGACTCTATTCACTGATTAG

FIX-6R:AACAGCTATGACCATGCATCCCAATAGGTCTGTCTAGTA

FIX-7F:TGTAAAACGACGGCCAGTGCCAGCACCTAGAAGCCAATA

FIX-7R:AACAGCTATGACCATGCCCTTCTGCCTTTAGCCCAAT

FIX-8F:TGTAAAACGACGGCCAGTGGTGAACATAATATTGAGGAGACAG

FIX-8R:AACAGCTATGACCATGTTAGTTAGTGAGAGGCCCTGTTAA

M13-F:TGTAAAACGACGGCCAGT

M13-R:AACAGCTATGACCATG。

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