[发明专利]检测FIX基因全外显子的方法和引物在审
申请号: | 201511023610.4 | 申请日: | 2015-12-30 |
公开(公告)号: | CN105506106A | 公开(公告)日: | 2016-04-20 |
发明(设计)人: | 李文静;林有升;王淑一 | 申请(专利权)人: | 杭州艾迪康医学检验中心有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 浙江杭州金通专利事务所有限公司 33100 | 代理人: | 黄素萍;徐关寿 |
地址: | 310030 浙江省杭州市西湖区振*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 fix 基因 全外显子 方法 引物 | ||
1.检测FIX基因全外显子的引物,其特征在于,包括:扩增覆盖检测FIX基因全外显子的正、反向引物;其碱基序列为:
FIX-1-F:TGTAAAACGACGGCCAGTGTACAACTAATCGACCTTACCACTT
FIX-1-R:AACAGCTATGACCATGCGTGCTGGCTGTTAGACTCT
FIX-2+3-F:TGTAAAACGACGGCCAGTCCCTAAAGAGAAATTGGCTTTCAG
FIX-2+3-R:AACAGCTATGACCATGGAATTGCTTACCAACATACTGCTTC
FIX-4F:TGTAAAACGACGGCCAGTTGGCTTCCAGGTCAGTAGTT
FIX-4R:AACAGCTATGACCATGAGGTGAGTCGGAACATCATTATTAC
FIX-5F:TGTAAAACGACGGCCAGTCACTCTTATTTCAAGGCTCCAA
FIX-5R:AACAGCTATGACCATGAAGGAAGCAGATTCAAGTAGGA
FIX-6F:TGTAAAACGACGGCCAGTGCTTGAGACTCTATTCACTGATTAG
FIX-6R:AACAGCTATGACCATGCATCCCAATAGGTCTGTCTAGTA
FIX-7F:TGTAAAACGACGGCCAGTGCCAGCACCTAGAAGCCAATA
FIX-7R:AACAGCTATGACCATGCCCTTCTGCCTTTAGCCCAAT
FIX-8F:TGTAAAACGACGGCCAGTGGTGAACATAATATTGAGGAGACAG
FIX-8R:AACAGCTATGACCATGTTAGTTAGTGAGAGGCCCTGTTAA。
2.如权利要求1至2之一所述的引物,其特征在于,所述7对正、反向引物的使用浓度比为:FIX-1F:FIX-1R=1:1;FIX-2+3F:FIX-2+3R=1:1;FIX-4F:FIX-4R=1:1;FIX-5F:FIX-5R=1:1;FIX-6F:FIX-6R=1:1;FIX-7F:FIX-7R=1:1;FIX-8F:FIX-8R=1:1。
3.一种检测检测FIX基因全外显子序列的方法,其包括如下步骤:
(1)提取样品DNA;
(2)利用7对扩增引物FIX-1F与FIX-1R;FIX-2+3F与FIX-2+3R;FIX-4F与FIX-4R;FIX-5F与FIX-5R;FIX-6F与FIX-6R;FIX-7F与FIX-7R;FIX-8F与FIX-8R。对(1)中的DNA分别进行扩增,获得覆盖检测FIX基因全外显子的扩增产物;
(3)利用1对测序引物M13-F与M13-R对(2)中的扩增产物分别进行正向和反向测序,获得所述扩增产物的基因序列;
(4)将(3)中的基因序列与野生型FIX序列进行比较,确定突变位点是否存在;
其中所述引物序列为:
FIX-1-F:TGTAAAACGACGGCCAGTGTACAACTAATCGACCTTACCACTT
FIX-1-R:AACAGCTATGACCATGCGTGCTGGCTGTTAGACTCT
FIX-2+3-F:TGTAAAACGACGGCCAGTCCCTAAAGAGAAATTGGCTTTCAG
FIX-2+3-R:AACAGCTATGACCATGGAATTGCTTACCAACATACTGCTTC
FIX-4F:TGTAAAACGACGGCCAGTTGGCTTCCAGGTCAGTAGTT
FIX-4R:AACAGCTATGACCATGAGGTGAGTCGGAACATCATTATTAC
FIX-5F:TGTAAAACGACGGCCAGTCACTCTTATTTCAAGGCTCCAA
FIX-5R:AACAGCTATGACCATGAAGGAAGCAGATTCAAGTAGGA
FIX-6F:TGTAAAACGACGGCCAGTGCTTGAGACTCTATTCACTGATTAG
FIX-6R:AACAGCTATGACCATGCATCCCAATAGGTCTGTCTAGTA
FIX-7F:TGTAAAACGACGGCCAGTGCCAGCACCTAGAAGCCAATA
FIX-7R:AACAGCTATGACCATGCCCTTCTGCCTTTAGCCCAAT
FIX-8F:TGTAAAACGACGGCCAGTGGTGAACATAATATTGAGGAGACAG
FIX-8R:AACAGCTATGACCATGTTAGTTAGTGAGAGGCCCTGTTAA
M13-F:TGTAAAACGACGGCCAGT
M13-R:AACAGCTATGACCATG。
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