[发明专利]检测DOCK2基因多态热点突变情况的引物和方法在审

专利信息
申请号: 201511025636.2 申请日: 2015-12-30
公开(公告)号: CN105506107A 公开(公告)日: 2016-04-20
发明(设计)人: 林筱剑;林有升;王淑一 申请(专利权)人: 杭州艾迪康医学检验中心有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 浙江杭州金通专利事务所有限公司 33100 代理人: 黄素萍;徐关寿
地址: 310030 浙江省杭州市西湖区振*** 国省代码: 浙江;33
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摘要:
搜索关键词: 检测 dock2 基因 热点 突变 情况 引物 方法
【说明书】:

技术领域

发明属生命科学和生物技术领域,特别涉及检测DOCK2基因多态热点突 变情况的引物和方法。

背景技术

联合免疫缺陷病是一种多基因遗传病,其可分为:x性联遗传、常染色体隐 性遗传型和散发型。联合免疫缺陷病将导致淋巴样干细胞先天性分化异常,婴儿 出生后缺乏T细胞和B细胞,使体液免疫和细胞免疫均发生缺陷,不能合成自 己的免疫球蛋白,从而导致患者对细菌、真菌、病毒等缺乏抵抗力,易发侵袭性 感染。患儿在出生后1-2个月内发病,如得不到有效治疗,多于1岁内死亡。目 前国外已经将该病列为“急诊病例”,一旦诊断明确立即进行造血干细胞移植, 能及时为患儿赢得新生。

DOCK2基因位于人类第5号染色体上,总长446136bp,共52个外显子。 DOCK2基因编码的蛋白质属于CDM蛋白家族。它在造血细胞中特异性表达, 主要在外周血白细胞,并通过活化Rac来参与淋巴细胞的迁移所需的肌动蛋白细 胞骨架重构。当DOCK2基因发生突变,Rac1的活化受损,趋化因子诱导的迁 移和肌动蛋白的聚合在T细胞、B细胞和NK细胞中发生缺陷。缺乏这种基因的 小鼠在淋巴细胞的迁移和引导中表现出严重的损伤。近来Dobbs等人报道,其 在5名联合免疫缺陷病的患者体内发现胞质分裂2基因(DOCK2)的等位基因 突变,其中3名患者通过干扰素或DOCK2表达治疗后正常化。提示Dock2的突 变情况对联合免疫缺陷病有重要意义。对DOCK2的突变检测无疑能对联合免疫 缺陷病的早诊断和及时的针对性治疗起重要作用。

发明内容

本发明的目的是提供一种检测DOCK2基因多态突变热点的引物,采用PCR 技术,可用于快速检测骨髓增生异常综合征患者体内DOCK2基因多态位点的突 变情况。所述检测DOCK2基因多态热点突变情况的引物,包括:

扩增DOCK2基因的引物,其碱基序列为:

DOCK2-1F:TGTAAAACGACGGCCAGTTTATGGGTTGTTTCTTGTCTCCT

DOCK2-1R:AACAGCTATGACCATGCCATCGGAAGTAGGTTAAATGAG

DOCK2-2F:TGTAAAACGACGGCCAGTCTTTAACCTTTGATTGAATGCCT

DOCK2-2R:AACAGCTATGACCATGTAGGTTGGATTCTTGAGCTGTTT

DOCK2-3F:TGTAAAACGACGGCCAGTCGTCGCCGAACTGTTTTAT

DOCK2-3R:AACAGCTATGACCATGGAGAAAGAGGCTAAGCAAATACA

DOCK2-4F:TGTAAAACGACGGCCAGTGTTATCCAGGGAGGAGGACTTT

DOCK2-4R:AACAGCTATGACCATGCTCTTCAACTTGCTGTGAGGC

DOCK2-5F:TGTAAAACGACGGCCAGTGCTTACTGGCTGCTTTACGAG

DOCK2-5R:AACAGCTATGACCATGTATGATGAGGGCTATTGACTGG

DOCK2-6F:TGTAAAACGACGGCCAGTTTGCAATATTTATTCTGCTTTCG

DOCK2-6R:AACAGCTATGACCATGGTCTCCTTTTTAAAGTCAAAGGG

进一步地,还包括测序引物,其碱基序列为:

检测DOCK2基因的测序引物碱基序列为:

M13F:TGTAAAACGACGGCCAGT

M13R:AACAGCTATGACCATG

进一步地,引物序列DOCK2-1F和DOCK2-1R是扩增DOCK2基因第6外 显子序列的引物,引物序列DOCK2-2F和DOCK2-2R是扩增DOCK2基因第 22外显子序列的引物,引物序列DOCK2-3F和DOCK2-3R是扩增DOCK2基 因第33外显子序列的引物,引物序列DOCK2-4F和DOCK2-4R是扩增DOCK2 基因第37外显子序列的引物,引物序列DOCK2-5F和DOCK2-5R是扩增 DOCK2基因第40外显子序列的引物,引物序列DOCK2-6F和DOCK2-6R是 扩增DOCK2基因第44外显子序列的引物。

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