[发明专利]一种检测秦川牛FGF13基因拷贝数变异的方法及其应用有效
| 申请号： | 201511030627.2 | 申请日： | 2015-12-31 |
| 公开（公告）号： | CN105543352B | 公开（公告）日： | 2020-02-07 |
| 发明（设计）人： | 陈宏;蔡含芳;白跃宇;蓝贤勇;石涛;徐瑶;张良志;雷初朝 | 申请（专利权）人： | 西北农林科技大学 |
| 主分类号： | C12Q1/6851 | 分类号： | C12Q1/6851;C12Q1/6888 |
| 代理公司： | 61200 西安通大专利代理有限责任公司 | 代理人： | 徐文权 |
| 地址： | 712100 陕*** | 国省代码： | 陕西;61 |
| 权利要求书： | 查看更多 | 说明书： | 查看更多 |
| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 检测 秦川 fgf13 基因 拷贝 变异 方法 及其 应用 | ||
1.一种检测秦川牛FGF13基因拷贝数变异的方法，其特征在于：包括以下步骤：以秦川牛基因组DNA为模板，以引物对P1以及引物对P2为引物，分别通过实时定量PCR扩增FGF13基因的拷贝数变异区域以及作为对照的BTF3基因的部分片段，然后根据定量结果鉴定秦川牛FGF13基因的拷贝数变异类型；具有插入型拷贝数变异类型的个体在生长性状上显著优于具有正常型拷贝数变异类型的个体；
所述的FGF13基因的拷贝数变异区域位于FGF13基因参考基因组序列AC_000187.1的621003位至622778位；
所述的拷贝数变异类型是根据-ΔΔCt将定量结果分为的三类：插入型，-ΔΔCt>0.5；缺失型，-ΔΔCt<-0.5；正常型，-0.5≤-ΔΔCt≤0.5；
所述的引物对P1为：
上游引物F1：5’-AAGAGGGTGTTTGCTAT-3’
下游引物R1：5’-CAGTAACGCTGAAGAAG-3’；
所述的引物对P2为：
上游引物F2：5’-AACCAGGAGAAACTCGCCAA-3’
下游引物R2：5’-TTCGGTGAAATGCCCTCTCG-3’。
2.如权利要求1所述一种检测秦川牛FGF13基因拷贝数变异的方法，其特征在于：所述的实时定量PCR所用的扩增体系包括：50ng/μL模板DNA 2μL、10μmol/L的引物对P1或引物对P2所对应的上、下游引物各1μL以及Premix Ex TaqTMII 12.5μL。
3.如权利要求1所述一种检测秦川牛FGF13基因拷贝数变异的方法，其特征在于：所述的实时定量PCR所用的反应程序为：(1)95℃预变性1min；(2)95℃变性10s，60℃退火30s，共40个循环。
4.如权利要求1所述一种检测秦川牛FGF13基因拷贝数变异的方法，其特征在于：基于引物对P1扩增的PCR产物片段大小为236bp，基于引物对P2扩增的PCR产物片段大小为166bp。
5.如权利要求1-4中任意一项权利要求所述的方法在秦川牛分子标记辅助选择育种中的应用，其特征在于：具有插入型拷贝数变异类型的个体在生长性状上显著优于具有正常型拷贝数变异类型的个体，所述生长性状为体长或坐骨端宽。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息，商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于西北农林科技大学，未经西北农林科技大学许可，擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作，请联系【客服】
本文链接：http://www.vipzhuanli.com/pat/books/201511030627.2/1.html，转载请声明来源钻瓜专利网。
