[发明专利]使用滑动装置的自动印迹

说明书

提供了用于对来自生物样品的分析物执行分离、固定、印迹和/或检测的装置、系统、方法和套件。在某些实施例中，这些装置由表面接触的两个固态基材构成。这些装置包括由这些表面中的凹痕形成的多个通道。这些凹痕能横跨所述基材之间的界面彼此对准，并且通过使一个基材相对于另一个基材移位或滑动而再对准。在某些实施例中，这些装置由固态基材的三层构成。在装置的中间层中的分离通道首先用于分析物分离。然后可以使中间层相对于顶层和/或底层滑动，从而对准分离通道与印迹膜。然后可以使用在顶层和底层中的电极将分析物转移到膜。

相关申请的交叉引用

本申请要求保护名称为“MICRO FLUIDIC WESTERN BLOT(微流体western印迹)”并且在2014年3月7日提交的美国临时申请第61/949,632号和名称为“AUTOMATED BLOTTINGUSING SLIDING DEVICE WITH INTEGRATED MEMBRANE(使用带有一体膜的滑动装置的自动印迹)”并且在2014年10月23日提交的美国临时申请第62/067,915号的优先权。每个优先权申请的全部内容以引用的方式并入到本文中以用于所有目的。

背景技术

电印迹广泛地用于生物技术中。这种技术涉及向基质两端施加电位差，带电分析物诸如DNA、RNA或蛋白质分布于基质中。电位差造成分析物从基质迁移出来并且变得沉积到一表面上或紧邻基质‘印迹’，它们被固定在那里。然后通可以使用荧光、化学发光、放射性或其它现象，通过利用一个或多个可检测的结合配偶体探测分析物来检测分析物。

电印迹常常成对进行，并且在诸如电泳的技术之后立即执行，电泳基于大小或电荷在基质中分离出分析物。因此，电印迹提供与基于电泳能提供的特征正交或互补的特征来查询生物样品。例如，蛋白质样品能在聚丙烯酰胺凝胶中经受电泳并且然后通过电印迹转移到硝化纤维膜。蛋白质在凝胶中的迁移速率能反映其分子量，并且这些蛋白质对于膜上的结合配偶体的亲和力能反映出蛋白质是否包含特定序列基序。因为电印迹在电泳之后并且能保留电泳实现的分析物的分离，在印迹上对分析物的检测能展现关于分析物来源的样品的多个信息水平。

在本领中已知并且实践了各种类型的电印迹。当分析物是DNA片段时，将分析物从凝胶或其它基质转移出来到印迹上根据其创始人英国生物学家Edwin M.Southern被称作Southern印迹。用类推的方法，RNA片段的转移被称作northern印迹，并且蛋白质或多肽的转移被称作western印迹。另外的示例为用于翻译后修饰的“eastern”印迹和用于蛋白质相互作用的“far western”印迹。这些印迹技术中的某些能在不施加电位差的情况下执行，其中，替代地通过毛细管作用来驱动分析物从基质转移到印迹。

为了以通常实践的方式来执行电印迹，需要复杂的程序。在例如通过电泳分离出基质中的分析物后，基质与印迹必须精确地并置以便于转移分析物。之后，电极和其它设备必须绕基质和印迹组装。该设备可以包括缓冲剂储器、海绵或湿纸以允许电流在这些电极之间流动。然后在电极之间施加电位差并且发生转移。然而，在检测分析物之前，该设备必须拆卸并且该印迹必须从基质移除并且进行进一步处理。该处理需要使印迹上的相关分析物以受控制的方式暴露于结合配偶体。例如，在western印迹的情况下，能利用非特异性地结合到印迹的阻断蛋白质、特异性地结合到相关分析物的一抗和结合到一抗的标记的二抗来孵育印迹。这些孵育中的每一个将印迹浸没于不同的溶液中。然后检测涉及将印迹紧邻一片薄膜或者对于结合配偶体之一上的标记敏感的光学扫描仪放置。

电印迹程序在若干水平上成本较高。该程序是耗时的，在某些程度上发生数天，并且不易于自动化。印迹必须以多种不同方式进行机械操纵，并且这些操纵需要关注以确保例如基质和印迹并不破裂或者印迹并不与污染物接触。因此，该程序需要高级技能、广泛培训的从业者才能成功地执行。电印迹在试剂方面也是成本较高的。印迹常常利用大量过剩结合配偶体来孵育以便以充分的敏感性来检测分析物，即使这些分析物仅占据印迹的表面积的较小部分。