[发明专利]用于基于模型的疗法计划的体外诊断

说明书

技术领域

本发明涉及体外诊断设备和方法。更具体而言，本发明涉及用于评价治疗对通道病变例如心脏通道病变的作用的体外诊断设备和方法。

背景技术

通道病变是由离子通道基因、离子通道相关基因的突变或离子通道的紊乱功能引起的疾病。心脏通道病变是这些类型的疾病的特别隐蔽形式。心脏通道病变可引起心脏性猝死，且包括疾病如长QT综合征(LQTS)、短QT综合征(SQTS)、Brugada综合征(BrS)和儿茶酚胺源性多形性室性心动过速(CPVT)。心脏通道病变的常见形式是LQTS，其中所谓的心跳的QT期被延长。LQTS的携带者可能对心律失常和心脏性猝死更敏感。相应地，增加的死亡率与突变相关。存在超过160种QT延长药物，其视为LQT综合征患者的危险药物。

数目不断增加的具有不同渗透程度的未覆盖的遗传变异连同额外的风险因素例如与一般人群相比加剧的药物不良反应、副作用或并存病可妨碍疾病的诊断、风险分层和治疗。很大的问题在于这一事实，即许多通道病变在药物开发中不能被考虑，因为由于安全原因，几乎没有任何新的重要药物被引入市场(由于关于患有通道病变的患者的可能不良反应)。另一方面，希望考虑到充分包括通道病变携带者的所有群体组。

关于心脏通道病变的更多信息的需求很高，因为2000人中的1人可能患有心脏通道病变，并且存在许多不同的潜在突变，这在常规药物开发期间不会也不能全部加以考虑。在常规药物开发期间要求的高安全标准可阻碍新的和重要的药物的市场性。为了帮助保护这个特异性心脏通道病变群体，需要灵敏和特异性的诊断和风险分层。

然而，单独的遗传测试不是解决方案，因为个体的突变通常是独特的并且相同突变基于个体的遗传背景可引起不同作用。通道病变的遗传测试可为科学上有用的，但对生命维持治疗策略具有有限的应用，因为遗传测试具有概率性质，而不是机械性的或基于直接关联。出版物“HRS/EHRA expert consensus statement on the state of genetic testing for the channelopathies and cardiomyopathies”(Ackermann等人，Europace2011Aug；13(8)1077-1090，所述参考文献以引用的方式并入，如同在本文中完全阐述一样)陈述遗传检查未提供用于通道病变疾病的诊断、预测和治疗的足够证据。

因此，存在关于更预测性的诊断和个体兼容性的体外测试的需要。具体地，存在关于已经使用的疗法和药物的体外测试的需要。此类测试的结果可提供可用于作出更佳的治疗决策的信息。

发明内容

在某些实施例中，紧凑型体外诊断(IVD)设备用于提供体外基于模型的诊断和用于基于模型的疗法计划的基础。IVD设备和相关程序可用于评价药物或药物组合对突变的离子通道或者对患者的同基因心肌细胞或任何其他患者来源的细胞的动作电位的作用。在某些实施例中，作用在临床环境中进行评价。在某些实施例中，关于患者的评价的信息(例如对于患者获得的药物基因组学知识)提供给评价结果的数据库。数据库可收集关于多个患者的评价结果和其他患者数据(例如医疗史、遗传背景等)，并且可用于帮助未来的治疗决策(例如基于模型的疗法计划)。

在某些实施例中，IVD设备基于膜片钳仪器。例如，IVD设备可基于CytoPatch^TM(Cytocentrics,Inc.)膜片钳仪器。在某些实施例中，IVD设备通过使用膜片钳诊断程序用于诊断药物或药物组合可对患者具有的作用，以评价药物或药物组合对来源于患者特异性的诱导的多能干细胞(ps-iPSC)的心肌细胞(CM)的电生理表型的体外作用。在一些实施例中，IVD设备和诊断程序用于评价来源于ps-iPSC的CM的体外电生理表型和患者的临床症状和/或医疗史之间的关联。

附图说明

当与附图结合考虑时，本发明的方法和器械的特征和优点将通过参考根据本发明目前优选但是举例说明性实施例的下述详述得到更全面理解，在所述附图中：

图1描述了关于体外诊断程序的一个实施例的流程图。

图2描述了示例性计算机系统的一个实施例的方框图。

图3描述了计算机可访问的存储介质的一个实施例的方框图。