[发明专利]癌症标志物及癌症的判定方法

说明书

技术领域

本发明涉及癌症标志物及使用该癌症标志物判定癌症的方法。

背景技术

将一类具有叉头或翼螺旋DNA结合域的转录因子称为叉头框(Forkhead box，FOX)，在人体中存在约50种。FOX主要作为生长调节因子、组织特异性调节因子、细胞周期调节因子发挥作用，但是，许多FOX的作用几乎尚未阐明。其中，已报告了FOXB2在非洲爪蟾中参与形成胚胎神经，然而，其在哺乳动物中的功能还尚未明确。

另一方面，已知DNA的甲基化与癌变有关，在日本特开2008-283947中记载有一种基于FOXB2基因的CpG岛(CpG二核苷酸：-CG-序列)中的甲基化率检测食道癌的方法。

现有技术文献

专利文献

专利文献1：日本特开2008-283947。

发明内容

发明所要解决的问题

上述专利文献1记载了癌细胞的CpG二核苷酸中的胞嘧啶多发生甲基化，并且，还记载了采用BAMCA法(Bacterial Artificial chromosome array-based Methylated CpG island Amplification，细菌人工染色体的甲基化CpG岛扩增阵列法)测定食道癌的FOXB2基因并确认了CpG二核苷酸中的胞嘧啶被甲基化。然而，由于BAMCA法测定CCCGGG序列的甲基化，因此，其测定位点非常有限。另一方面，本发明人对癌细胞中CpG二核苷酸的胞嘧啶的甲基化进行了悉心研究，其结果发现：并不是癌细胞中的全部CpG二核苷酸均被甲基化，另外，其甲基化率因CpG二核苷酸的位置不同而不同。因此，如BAMCA法那样根据多个位点的甲基化判定癌症的精度低，人们期待一种更高精度地判定细胞癌变的方法。

另外，癌症发生于多种细胞中，人们期待一种癌症的判定方法，其能够应用于各种细胞，而不仅是判定特定的细胞的癌变。于是，本发明的课题是提供一种能够高精度地判定细胞的癌变并且能够判定各种细胞的癌变的癌症的判定方法及癌症标志物。

解决问题的技术方案

本发明人鉴于上述情况而进行悉心研究，其结果，以来自于各种正常细胞、健康人的血液以及各种癌细胞的基因组DNA为模板，采用亚硫酸氢盐法，对FOXB2基因的特定区域进行分析时发现，该特定区域中CpG二核苷酸的胞嘧啶在各种正常细胞和健康人全血基因组DNA中呈非甲基化状态，而在各种癌细胞中呈甲基化状态。于是，本发明人根据该结果而完成了本发明。

即，本发明涉及“癌症标志物，由来自细胞的FOXB2基因中的由序列号1表示的碱基序列中的一部分或全部组成，至少包含由序列号3表示的碱基序列，碱基序列内存在的-CG-序列中的胞嘧啶的30％以上被甲基化”、“癌症标志物，由来自细胞的FOXB2基因中的由序列号1表示的碱基序列中的一部分或全部组成，至少包含由序列号2表示的碱基序列，碱基序列内存在的-CG-序列中的胞嘧啶的30％以上被甲基化”以及“判定细胞癌变的方法，对来自细胞的FOXB2基因中的由序列号1表示的碱基序列内存在的-CG-序列中的胞嘧啶的一部分或全部，通过亚硫酸氢盐反应，测定胞嘧啶的甲基化率，并基于该甲基化率判定细胞的癌变”。

发明效果

通过以本发明的癌症标志物为指标并且采用本发明的方法，无论何种细胞，均能够对各种细胞判定细胞的癌变。进一步地，由于本发明的方法测定特定区域的CpG二核苷酸中的胞嘧啶的甲基化率，因此，能够高精度地判定细胞的癌变。

附图说明

图1是表示对于实施例1的hiPS(人正常皮肤成纤维细胞)中的FOXB2基因而言，CpG二核苷酸中的胞嘧啶是非甲基化胞嘧啶还是甲基化胞嘧啶的图。

图2是表示对于实施例1的HDF(人正常皮肤成纤维细胞)中的FOXB2基因而言，CpG二核苷酸中的胞嘧啶是非甲基化胞嘧啶还是甲基化胞嘧啶的图。

图3是表示对于实施例1的WI-38(人正常肺成纤维细胞)中的FOXB2基因而言，CpG二核苷酸中的胞嘧啶是非甲基化胞嘧啶还是甲基化胞嘧啶的图。

图4是表示对于实施例1的CCD-8Lu(正常人肺二倍体细胞)中的FOXB2基因而言，CpG二核苷酸中的胞嘧啶是非甲基化胞嘧啶还是甲基化胞嘧啶的图。

图5是表示对于实施例1的HE23(正常人胚胎细胞)中的FOXB2基因而言，CpG二核苷酸中的胞嘧啶是非甲基化胞嘧啶还是甲基化胞嘧啶的图。