[发明专利]确定具有生物体的样品的感兴趣变量的值的方法和系统在审
申请号: | 201580047827.0 | 申请日: | 2015-07-07 |
公开(公告)号: | CN107155343A | 公开(公告)日: | 2017-09-12 |
发明(设计)人: | 瓦莱丽·罗比泰丽;科迪·安德鲁斯 | 申请(专利权)人: | 艾克斯波特西溶液公司 |
主分类号: | G01D5/26 | 分类号: | G01D5/26;A01K61/00;G01B11/00;G01J3/50;G01N15/02;G01N21/84;G01N21/88;G06M11/00 |
代理公司: | 广州华进联合专利商标代理有限公司44224 | 代理人: | 胡杰,王雯雯 |
地址: | 加拿大*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 确定 具有 生物体 样品 感兴趣 变量 方法 系统 | ||
1.用于确定与样品相关的感兴趣变量的方法,所述样品具有数个生物体、并被接收在容器中,所述方法包括以下步骤:
从相机获取所述容器中的样品的图像;和
使用所述图像确定与所述样品的相关的所述感兴趣变量的值。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述感兴趣变量是生物体数量,其中所述容器是具有从封闭底部向上延伸的轮廓壁的封闭容器,并且其中所述接收还包括在所述容器中接收所述样品,从而使得所述生物体在重力的作用下积聚而形成从所述封闭底部延伸到所述轮廓壁的给定水平的生物体深度;所述方法还包括以下步骤:
测量所述图像中与所述生物体深度所延伸到的所述轮廓壁的给定水平相对应的成像水平;和
基于校准数据,确定与所述成像水平相关联的所述生物体数量。
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述确定成像水平,进一步包括:基于将所述生物体深度的成像边缘与所述图像中的参考点分开的像素数量,来确定所述成像水平。
4.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,被确定的所述生物体数量是第二生物体数量,所述方法还包括在所述确定所述第二生物体数量之前,通过执行以下步骤来提供所述校准数据:
获取所述容器中的第一生物体数量的校准图像;
测量所述校准图像中与被确定的所述生物体数量所延伸到的轮廓壁水平相对应的成像水平,
获得所述第一生物体数量的值;
将所述第一生物体数量的值与对应的成像水平相关联。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述获得所述第一生物体数量的值的步骤包括:
从相机获取在容器中的、具有第一生物体数量的样品的图像,所述样品的深度使得所述生物体具有与其它生物体的区别特征不重叠的区别特征;
定位所述图像中的所述生物体的区别特征;和
基于在图像中定位的区别特征的计数,来确定与所述样品相关联的所述第一生物体数量的值。
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述提供校准数据还包括:重复获取、测量、获得至少一个其他生物体数量并与该至少一个其他生物体数量相关联。
7.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述容器具有已知尺寸,并且其中所述校准数据包括与所述生物体相关联的单位体积,所述方法还包括以下步骤:
基于所述轮廓壁的成像水平和所述容器的已知尺寸,推断所述容器内的所述生物体深度的体积的值;和
基于所述单位体积,确定与所述生物体深度的体积的值相关联的所述生物体数量。
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,所述校准数据还包括与所述生物体之间的空白量相关联的填充因子,所述方法还包括以下步骤:
基于所述填充因子,修改被确定的所述生物体数量。
9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,生物体之间的所述空白量,部分地填充有液体介质。
10.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,所述校准数据还包括变形因子,所述方法还包括:
基于所述变形因子,确定所述填充因子。
11.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,使用所述样品的图像,来估计与所述生物体相关联的所述校准数据的所述单位体积。
12.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述生物体是鱼卵。
13.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述生物体具有与其他生物体的区别特征不重叠的区别特征,所述方法还包括以下步骤:
在所述图像中定位所述生物体的所述区别特征;
其中所述确定与接收在容器中的样品相关联的感兴趣变量的值,是基于在所述图像中定位的区别特征而进行的。
14.根据权利要求13所述的方法,其特征在于,所述样品所具有的深度适于避免出现与所述其它生物体的区别特征相重叠的生物体区别特征,还包括基于所述生物体的尺寸调整所述样品的深度,所述尺寸基本上平行于所述深度。
15.根据权利要求14所述的方法,其特征在于,所述深度小于所述生物体尺寸的约两倍,优选小于所述生物体尺寸的约1.5倍,更优选小于所述生物体尺寸。
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