[发明专利]用于类风湿性关节炎的生物标记物及其用途有效
| 申请号： | 201580053212.9 | 申请日： | 2015-07-07 |
| 公开（公告）号： | CN108064272B | 公开（公告）日： | 2021-07-09 |
| 发明（设计）人： | 冯强;张东亚;贾慧珏;王东辉;王俊 | 申请（专利权）人： | 深圳华大生命科学研究院 |
| 主分类号： | C12Q1/6883 | 分类号： | C12Q1/6883 |
| 代理公司： | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 | 代理人： | 赵天月 |
| 地址： | 518083 广东*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 用于 类风湿性关节炎 生物 标记 及其 用途 | ||
1.一种系统，其包括：
处理器；和
存储介质，所述存储介质包含用于由所述处理器执行的程序指令，所述程序指令使所述处理器执行包括以下的步骤：
(a)接受代表生物样品中生物标记物的测量值的生物标记物数据，所述生物样品选自由所述受试者的粪便样品、牙齿样品和唾液样品组成的组；
(b)分析所述生物标记物数据以获得对应于所述生物样品的宏基因组连锁群(MLG)集的相对丰度谱；
(c)将所述相对丰度谱和参考相对丰度谱输入模型中；以及
(d)执行所述模型以将类风湿性关节炎的疾病概率或治疗后类风湿性关节炎的改善概率分配给所述受试者；
其中，所述宏基因组连锁群(MLG)集包括选自由以下组成的组至少之一：
(i)对应于所述粪便样品的由MLG ID NO:5635、3869、3850、180、4602、2297、4183和5303组成的MLG集；
(ii)对应于所述牙齿样品的由MLG ID NO:8374、16124、15172、13815、6211和16306组成的MLG集；
(iii)对应于所述唾液样品的由MLG ID NO:32522和14组成的MLG集；
(iv)对应于撰述粪便样品的由MLG ID NO:3868、351、7851、693、3144、5250、5303和194组成的MLG集；和
(v)对应于所述牙齿样品的由MLG ID NO:15852、2、1749、1930、1689、1345、16032、16043、31490、652、1649、1815、1366、14778、1847、4016和16124组成的MLG集，
MLG ID NO:3869由具有SEQ ID NO:1～297的多核苷酸序列的基因组成；
MLG ID NO:180由具有SEQ ID NO:298～531的多核苷酸序列的基因组成；
MLG ID NO:2297由具有SEQ ID NO:532～721的多核苷酸序列的基因组成；
MLG ID NO:5635由具有SEQ ID NO:722～989的多核苷酸序列的基因组成；
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MLG ID NO:652由具有SEQ ID NO:20189～23098的多核苷酸序列的基因组成；
MLG ID NO:4016由具有SEQ ID NO:23099～23223的多核苷酸序列的基因组成；
MLG ID NO:1649由具有SEQ ID NO:23224～24603的多核苷酸序列的基因组成；以及
MLG ID NO:1366由具有SEQ ID NO:24604～24956的多核苷酸序列的基因组成。
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