[发明专利]接近性保留性转座有效
申请号: | 201580068116.1 | 申请日: | 2015-10-16 |
公开(公告)号: | CN107969137B | 公开(公告)日: | 2021-10-26 |
发明(设计)人: | F.J.斯蒂莫斯;K.L.冈德森;张帆;J.R.贝特利;N.A.戈姆利;W.穆尔曼;J.韦尔;A.约安努;G.詹金斯;R.杰克逊;N.莫雷尔;D.K.波科洛克;S.J.诺伯格;M.何;A.基亚;I.戈里辛;R.潘托加 | 申请(专利权)人: | 伊卢米纳剑桥有限公司 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 北京市柳沈律师事务所 11105 | 代理人: | 张文辉 |
地址: | 英国*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 接近 保留 性转座 | ||
1.组合物,其包含
多个转座体复合物,其中每个所述转座体复合物包含一个或多个转座子和一个或多个转座酶,其中所述转座子各包含转移链和非转移链,且其中每个转座体复合物中的所述转座子中的至少一个包含衔接头序列;和
多个固体支持物,
其中每个所述固体支持物包含多个固定化的寡核苷酸;并且
其中给定固体支持物上的每个所述寡核苷酸包含:
(a)互补捕捉序列,其与所述多个转座体复合物之一的所述转座子上的所述衔接头序列的至少一部分杂交,以在所述固体支持物上固定化在靶核酸的连续连接转座后与靶核酸结合的多个转座体复合物之一,其中由所述多个转座体复合物的转座酶创建的所述靶核酸的片段的接近性由与所述靶核酸结合的所述转座体复合物的转座酶维持;
(b)第一条形码序列,其中来自所述多个固体支持物中的每个固体支持物的所述第一条形码序列不同于来自所述多个固体支持物中的其它固体支持物的所述第一条形码序列;和
(c) 引物结合位点。
2.权利要求1的组合物,其中所述固定化寡核苷酸进一步包含(a)第二条形码序列或(b)第二条形码序列和第三条形码序列。
3.权利要求1的组合物,其中所述固体支持物是微球、珠或颗粒。
4.权利要求1的组合物,其中每个固定化寡核苷酸的引物结合位点是P5或P7引物结合位点或其互补物。
5.权利要求1-4中任一项的组合物,其中所述多个固体支持物内的给定固体支持物上的固定化寡核苷酸包含部分双链结构和部分单链结构。
6.权利要求5的组合物,其中所述固定化寡核苷酸的一条链在所述固体支持物上固定化,并且另一条链与所述固体支持物上固定化的链部分互补并且包含所述互补捕捉序列。
7.权利要求1的组合物,其中所述互补捕捉序列与所述转座子的所述衔接头序列连接。
8.权利要求1的组合物,其中所述转座子包含转移链和非转移链,并且所述衔接头序列在所述转座子的所述转移链上。
9.权利要求8的组合物,其进一步包含与所述转座子的所述转移链的3’端连接的靶核酸的片段。
10.权利要求1的组合物,其中所述转座酶是Tn5转座酶。
11.权利要求1的组合物,其中所述靶核酸包含多个片段,并且所述转座体复合物与所述靶核酸的至少一个片段结合。
12.权利要求1的组合物,其中所述转移链插入所述靶核酸中以形成片段,在所述片段中所述转移链与所述转座子的所述转移链的3’端连接。
13.权利要求12的组合物,其中所述转移链在维持所述靶核酸的接近性的情况下插入所述片段的至少一条链的5’端中。
14.权利要求5的组合物,其中所述多个固体支持物内的给定固体支持物上的固定化寡核苷酸包含单链结构。
15.权利要求14的组合物,其中所述固定化寡核苷酸在所述寡核苷酸的5’端经由接头固定化到所述固体支持物,并且所述互补捕捉序列在所述固定化寡核苷酸的3’端。
16.权利要求1的组合物,其中所述互补捕捉序列与所述转座子的所述衔接头序列连接。
17.权利要求16的组合物,其中所述转座子包含转移链和非转移链,并且所述衔接头序列在所述转座子的非转移链上。
18.权利要求17的组合物,其中所述互补捕捉序列与所述非转移链上的所述衔接头序列杂交。
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