[发明专利]一种检测诊断主动脉夹层病致病基因的DNA文库及其应用有效

专利信息
申请号: 201610004089.8 申请日: 2016-01-05
公开(公告)号: CN105442052B 公开(公告)日: 2018-05-18
发明(设计)人: 汪道文;李宗哲 申请(专利权)人: 华中科技大学同济医学院附属同济医院
主分类号: C40B40/06 分类号: C40B40/06;C12Q1/6883;C12Q1/6874
代理公司: 北京中政联科专利代理事务所(普通合伙) 11489 代理人: 谢磊
地址: 430030 湖*** 国省代码: 湖北;42
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摘要:
搜索关键词: 一种 检测 诊断 主动脉 夹层 致病 基因 dna 文库 及其 应用
【权利要求书】:

1.一种基于Ion TorrentTM高通量测序技术诊断主动脉夹层的DNA文库,其特征在于,该文库包括33个主动脉夹层致病相关基因,其中,所述33个主动脉夹层致病相关基因如下表所示:

2.权利要求1所述的DNA文库在制备诊断试剂盒中的应用,其特征在于,所述试剂盒用于诊断主动脉夹层。

3.权利要求1所述的DNA文库在制备诊断装置中的应用,其特征在于,所述诊断装置用于诊断主动脉夹层。

4.如权利要求3所述的应用,其特征在于,所述诊断装置是测序芯片。

5.如权利要求2-4任一权利要求所述的应用,其特征在于,所述应用包括下列步骤:

(1)提供受试者样本的基因组DNA;

(2)利用权利要求1所述的DNA文库从Ion TorrentTM高通量测序平台自动合成覆盖全部33个致病基因的扩增引物文库,对目标区域进行超多重PCR扩增;

(3)对步骤(2)得到的扩增产物进行酶切;

(4)对步骤(3)得到的酶切产物加Barcode接头;

(5)对步骤(4)得到的连接产物进行纯化;

(6)对步骤(5)得到的纯化产物用通用引物进行二次扩增;

(7)对步骤(6)得到的二次扩增产物进行片段选择及浓度测定,即建成患者目标区域扩增文库;

(8)对步骤(7)所得到的文库经过油包水PCR扩增反应后,将待测序目的片段连接于ISP珠子,得到反应液;

(9)将步骤(8)得到的包含ISP珠子的反应液点入芯片,上Ion TorrentTM高通量测序进行测序;

(10)将步骤(9)得到的碱基序列信息进行生物信息学比对处理,得到与疾病相关的突变位点;

(11)对步骤(10)得到的突变位点进行Sanger测序法验证。

6.如权利要求5所述的应用,其特征在于,所述样本来自受试者的外周血、体液、组织器官样本。

7.一种诊断试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括权利要求1所述的DNA文库。

8.一种诊断装置,其特征在于,所述装置包括权利要求1所述的DNA文库。

9.如权利要求8的诊断装置,其特征在于,所述诊断装置是测序芯片。

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