[发明专利]一种鉴定或辅助鉴定大豆籽粒脂肪含量的方法及其应用

说明书

技术领域

本发明涉及生物技术领域，尤其涉及一种鉴定或辅助鉴定大豆籽粒脂肪含量的方 法及其应用。

背景技术

大豆(Glycinemax)是世界上重要的油料粮食作物，其种子油是人类与动物营养 以及食品加工业植物食用油的重要来源。大豆油用量占全世界食用油的31％(Kim andKrishnan，2004)。如何能有效的提高大豆品种的籽粒脂肪含量，满足大豆生产和加工的 需求是大豆育种的主要研究方向之一。

由于大豆籽粒脂肪含量是受多基因控制的数量性状且易受环境影响，特别是地理 纬度对大豆籽粒脂肪含量有显著影响，利用传统表型鉴定和常规育种方法来提高大豆籽粒 脂肪含量不但需要花费很长的时间，而且难于成功，改良空间有限，已经不能够满足当前优 质大豆育种的需求。随着分子标记的开发和使用，分子标记辅助选择(Molecularmarker- assistedselection，MAS)成为可以节约人力、物力和加速育种进程的有效方法(Cregan etal.1999)。分子标记辅助选择的最大优点为在不需要评估表型特征的情况下，通过确认 是否带有目标基因而鉴定出高脂肪含量的植株。

大豆种质资源中蕴藏着丰富的基因，从育种的物质基础—种质资源中发掘所需要 的优异资源及基因可有效促进大豆品种改良。作为栽培大豆起源地，我国的大豆种质资源 在世界上最为丰富，现保存在国家种质资源库的就有3万余份，在大豆籽粒脂肪含量上变异 广泛(刘兴媛等，作物品种资源，1998)。为了有效的研究和利用我国大豆资源，邱丽娟等(作 物学报，2009)构建了可代表我国大豆种质资源多样性的核心种质，为深入发掘种质资源中 蕴藏的优异基因、有效拓宽大豆遗传基础奠定了材料基础。

关联分析，又称关联作图(AssociationMapping)，是一种以LD(Linkage Disequlibrium)分析为基础，直接对基因型变异和表型变异进行分析，从而把那些与性状 有关联的基因鉴定出来(Khushetal.2001)的基因定位方法，已成为发掘与表型相关分子 标记的强有力工具。新型分子标记—SNP因为具有在基因组中数量多、分布广泛、可高通量 检测等优点而在近年广泛用于鉴定多基因控制的复杂性状。随着SNP标记数量的不断增多， 高通量的SNP分型平台相继推出，包括GoladenGate和BeadArray(Illumina)，GenomeLab SNPstream(Beckman)和MegAllele(Affymetrix)等，其中Illumina公司的BeadArray芯片 鉴定技术具有高效、高通量、成本低、准确性好等优点，适合位点数从几十到几千的中等通 量基因分型研究，实验成功率>99％，是理想的中高通量基因分型检测的解决方案，目前已 被广泛用于人类、拟南芥、水稻等物种的SNP分型。

发明内容

本发明的目的是鉴定或辅助鉴定大豆籽粒脂肪含量性状，和/或，筛选或辅助筛选 具有不同脂肪含量的大豆籽粒。

为解决上述技术问题，本发明首先提供了一种鉴定或辅助鉴定大豆籽粒脂肪含量 性状的方法，可包括如下步骤a1)或a2)：

a1)检测待测大豆基因组中基于Map-6077SNP位点的基因型(基于反义DNA分子描 述)，如果为AA纯合型、待测大豆籽粒为候选的具有高脂肪含量性状的大豆籽粒，如果为GG 纯合型、待测大豆籽粒为候选的具有低脂肪含量性状的大豆籽粒；

a2)检测待测大豆基因组中基于Map-6077SNP位点的基因型(基于正义DNA分子描 述)，如果为TT纯合型、待测大豆籽粒为候选的具有高脂肪含量性状的大豆籽粒，如果为CC 纯合型、待测大豆籽粒为候选的具有低脂肪含量性状的大豆籽粒。

为解决上述技术问题，本发明还提供了一种筛选或辅助筛选具有不同脂肪含量的 大豆籽粒的方法，可包括如下步骤b1)或b2)：

b1)检测待测大豆基因组中基于Map-6077SNP位点的基因型(基于反义DNA分子描 述)，如果为AA纯合型、待测大豆籽粒为候选的具有高脂肪含量性状的大豆籽粒，如果为GG 纯合型、待测大豆籽粒为候选的具有低脂肪含量性状的大豆籽粒；