[发明专利]一种DNA探针组合和试剂盒在审

专利信息
申请号: 201610019618.1 申请日: 2016-01-13
公开(公告)号: CN105462972A 公开(公告)日: 2016-04-06
发明(设计)人: 张晶珠;毛瑜 申请(专利权)人: 深圳市坤健创新药物研究院
主分类号: C12N15/11 分类号: C12N15/11;C12Q1/68
代理公司: 北京思创毕升专利事务所 11218 代理人: 韦庆文
地址: 518063 广东省深圳*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 dna 探针 组合 试剂盒
【说明书】:

技术领域

发明涉及生物检测领域,更具体地,涉及一种DNA探针组合和包括该DNA探针组合的试剂盒。

背景技术

微小RNA(miRNA)是一类小分子调控RNA,在肿瘤的发生与控制方面发挥着重要的作用。已经发现在肿瘤患者的循环核酸中存在源自肿瘤的miRNA分子,这一现象提示循环miRNA分子可能成为无创诊断癌症的一个有效的方法。研究表明miR-21,miR-145,miR-222,miR-223,miR-29a,miR-10b在肝癌肿瘤患者血清中明显过度表达,是评估疗效的潜在生物标志物。miR-16的表达稳定,可作为内参。

目前已有的血清中miRNA的检测方法主要是实时荧光定量PCR(QuantitativeReal-timePCR),所谓实时荧光定量PCR技术,是指在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。

但是这个方法需要先对miRNA进行逆转录,并且RT-PCR的过程需要完成高温变性,低温复性,适温延伸的热循环。操作繁琐,并且需要使用大型昂贵的仪器。

发明内容

本发明的目的是克服现有技术的上述缺陷,提供一种DNA探针组合和包括该DNA探针组合的试剂盒。

本发明的发明人拟利用RCA技术对血清中miRNA进行检测,DNA滚环扩增(RCA)技术是一种等温信号扩增方法,可在室温下进行,使用两个引物就可实现指数滚环扩增,可用于极微量生物标记物的检测。RCA能直接扩增DNA或者RNA分子,所以将其用于血清中miRNA的检测具有快速、灵敏、特异的特点。此外,发明人发现如果只对某一特定的miRNA表达量进行分析,很容易出现假阳性或假阴性的结果。

基于此,本发明提供一种DNA探针组合,该DNA探针组合包括:

(1)miR-223探针,所述miR-223探针为40-80nt的通过以下DNA序列5’端和3’端连接而成的环状DNA模板:

5’-GACAAACTGACA(SEQIDNO:1)X1TGGGGTATTT-3(SEQIDNO:2)’,X1为任意序列的DNA片段;

和(2)miR-16探针,所述miR-16探针为40-80nt的通过以下DNA序列5’端和3’端连接而成的环状DNA模板:

5’-TACGTGCTGCTA(SEQIDNO:3)X2CGCCAATATT(SEQIDNO:4)-3’,X2为任意序列的DNA片段;

以及以下探针中的至少两种:

(3)miR-21探针,所述miR-21探针为40-80nt的通过以下DNA序列5’端和3’端连接而成的环状DNA模板:

5’-TGATAAGCTA(SEQIDNO:5)X3TCAACATCAGTC(SEQIDNO:6)-3’,X3为任意序列的DNA片段;

(4)miR-29a探针,所述miR-29a探针为40-80nt的通过以下DNA序列5’端和3’端连接而成的环状DNA模板:

5’-AGATGGTGCTA(SEQIDNO:7)X4TAACCGATTTC(SEQIDNO:8)-3’,X4为任意序列的DNA片段;

(5)miR-222探针,所述miR-222探针为40-80nt的通过以下DNA序列5’端和3’端连接而成的环状DNA模板:

5’-CAGATGTAGCT(SEQIDNO:9)X5ACCCAGTAGC(SEQIDNO:10)-3’,X5为任意序列的DNA片段;

(6)miR-145探针,所述miR-145探针为40-80nt的的通过以下DNA序列5’端和3’端连接而成的环状DNA模板:

5’-GGAAAACTGGAC(SEQIDNO:11)X6AGGGATTCCTG(SEQIDNO:12)-3’,X6为任意序列的DNA片段;

(7)miR-10b探针,所述miR-10b探针为40-80nt的通过以下DNA序列5’端和3’端连接而成的环状DNA模板:

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