[发明专利]一种DNA探针组合和试剂盒在审
申请号: | 201610019618.1 | 申请日: | 2016-01-13 |
公开(公告)号: | CN105462972A | 公开(公告)日: | 2016-04-06 |
发明(设计)人: | 张晶珠;毛瑜 | 申请(专利权)人: | 深圳市坤健创新药物研究院 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/68 |
代理公司: | 北京思创毕升专利事务所 11218 | 代理人: | 韦庆文 |
地址: | 518063 广东省深圳*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 dna 探针 组合 试剂盒 | ||
技术领域
本发明涉及生物检测领域,更具体地,涉及一种DNA探针组合和包括该DNA探针组合的试剂盒。
背景技术
微小RNA(miRNA)是一类小分子调控RNA,在肿瘤的发生与控制方面发挥着重要的作用。已经发现在肿瘤患者的循环核酸中存在源自肿瘤的miRNA分子,这一现象提示循环miRNA分子可能成为无创诊断癌症的一个有效的方法。研究表明miR-21,miR-145,miR-222,miR-223,miR-29a,miR-10b在肝癌肿瘤患者血清中明显过度表达,是评估疗效的潜在生物标志物。miR-16的表达稳定,可作为内参。
目前已有的血清中miRNA的检测方法主要是实时荧光定量PCR(QuantitativeReal-timePCR),所谓实时荧光定量PCR技术,是指在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。
但是这个方法需要先对miRNA进行逆转录,并且RT-PCR的过程需要完成高温变性,低温复性,适温延伸的热循环。操作繁琐,并且需要使用大型昂贵的仪器。
发明内容
本发明的目的是克服现有技术的上述缺陷,提供一种DNA探针组合和包括该DNA探针组合的试剂盒。
本发明的发明人拟利用RCA技术对血清中miRNA进行检测,DNA滚环扩增(RCA)技术是一种等温信号扩增方法,可在室温下进行,使用两个引物就可实现指数滚环扩增,可用于极微量生物标记物的检测。RCA能直接扩增DNA或者RNA分子,所以将其用于血清中miRNA的检测具有快速、灵敏、特异的特点。此外,发明人发现如果只对某一特定的miRNA表达量进行分析,很容易出现假阳性或假阴性的结果。
基于此,本发明提供一种DNA探针组合,该DNA探针组合包括:
(1)miR-223探针,所述miR-223探针为40-80nt的通过以下DNA序列5’端和3’端连接而成的环状DNA模板:
5’-GACAAACTGACA(SEQIDNO:1)X1TGGGGTATTT-3(SEQIDNO:2)’,X1为任意序列的DNA片段;
和(2)miR-16探针,所述miR-16探针为40-80nt的通过以下DNA序列5’端和3’端连接而成的环状DNA模板:
5’-TACGTGCTGCTA(SEQIDNO:3)X2CGCCAATATT(SEQIDNO:4)-3’,X2为任意序列的DNA片段;
以及以下探针中的至少两种:
(3)miR-21探针,所述miR-21探针为40-80nt的通过以下DNA序列5’端和3’端连接而成的环状DNA模板:
5’-TGATAAGCTA(SEQIDNO:5)X3TCAACATCAGTC(SEQIDNO:6)-3’,X3为任意序列的DNA片段;
(4)miR-29a探针,所述miR-29a探针为40-80nt的通过以下DNA序列5’端和3’端连接而成的环状DNA模板:
5’-AGATGGTGCTA(SEQIDNO:7)X4TAACCGATTTC(SEQIDNO:8)-3’,X4为任意序列的DNA片段;
(5)miR-222探针,所述miR-222探针为40-80nt的通过以下DNA序列5’端和3’端连接而成的环状DNA模板:
5’-CAGATGTAGCT(SEQIDNO:9)X5ACCCAGTAGC(SEQIDNO:10)-3’,X5为任意序列的DNA片段;
(6)miR-145探针,所述miR-145探针为40-80nt的的通过以下DNA序列5’端和3’端连接而成的环状DNA模板:
5’-GGAAAACTGGAC(SEQIDNO:11)X6AGGGATTCCTG(SEQIDNO:12)-3’,X6为任意序列的DNA片段;
(7)miR-10b探针,所述miR-10b探针为40-80nt的通过以下DNA序列5’端和3’端连接而成的环状DNA模板:
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