[发明专利]用于鉴定普通狗牙根和弯穗狗牙根的SRAP分子标记引物及其方法和应用在审
申请号: | 201610039736.9 | 申请日: | 2016-01-21 |
公开(公告)号: | CN105420406A | 公开(公告)日: | 2016-03-23 |
发明(设计)人: | 黄春琼;刘国道;白昌军 | 申请(专利权)人: | 中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 深圳市千纳专利代理有限公司 44218 | 代理人: | 马庆文 |
地址: | 57173*** | 国省代码: | 海南;66 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 鉴定 普通 牙根 弯穗狗 srap 分子 标记 引物 及其 方法 应用 | ||
1.一种SRAP分子标记引物,其特征在于,选自下述引物组合之一:E1M4、E1M5、E1M6、E1M7、E1M8、E2M3、E2M4、E2M5、E2M6、E2M7、E3M1、E3M3、E3M4、E3M6、E3M9、E4M1、E4M3、E4M4、E4M5、E4M6、E5M9、E6M1、E6M2、E6M3、E6M4、E6M7、E6M8、E6M9、E7M2、E7M3、E7M4、E7M5、E7M7、E10M9,其中,
E1为反向引物,序列如SEQIDNO:1所示;
E2为反向引物,序列如SEQIDNO:2所示;
E3为反向引物,序列如SEQIDNO:3所示;
E4为反向引物,序列如SEQIDNO:4所示;
E5为反向引物,序列如SEQIDNO:5所示;
E6为反向引物,序列如SEQIDNO:6所示;
E7为反向引物,序列如SEQIDNO:7所示;
E10为反向引物,序列如SEQIDNO:10所示;
M1为正向引物,序列如SEQIDNO:11所示;
M2为正向引物,序列如SEQIDNO:12所示;
M3为正向引物,序列如SEQIDNO:13所示;
M4为正向引物,序列如SEQIDNO:14所示;
M5为正向引物,序列如SEQIDNO:15所示;
M6为正向引物,序列如SEQIDNO:16所示;
M7为正向引物,序列如SEQIDNO:17所示;
M8为正向引物,序列如SEQIDNO:18所示;
M9为正向引物,序列如SEQIDNO:19所示。
2.根据权利要求1所述的SRAP分子标记引物,其特征在于,选自下述引物组合之一:E2M3、E2M4、E2M5、E2M7、E3M3、E3M6、E4M3、E4M4、E4M5、E4M6、E5M9、E6M1、E6M2、E6M4、E6M7、E6M8、E6M9、E7M3、E7M4、E7M5、E7M7、E10M9。
3.权利要求1或2中所述的SRAP分子标记引物在鉴定普通狗牙根和弯穗狗牙根中的应用。
4.一种利用SRAP分子标记引物组合鉴定普通狗牙根和弯穗狗牙根的方法,其特征在于,采用权利要求1或2中所述的SRAP分子标记引物,对普通狗牙根和弯穗狗牙根DNA进行扩增、检测和分析。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,DNA提取步骤如下:
1)液氮保护下磨样成粉;
2)立刻加入预冷的CTAB-free缓冲液,冰浴5~15min;
3)离心,去掉上清液;
4)加入预热至50-80℃的3×CTAB提取缓冲液,50-80℃的水浴30-50min;
5)离心,取上清液,加入有机溶剂洗涤后,取水层,干燥。
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,每100ml的3×CTAB提取缓冲液中含有:3%CTAB(W/V)2~4g,NaCl8~10g,EDTA2~3mmol和Tris-HCl8~12mmol,pH为7.5~8.5。
7.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,每100ml的CTAB-free缓冲液中含有:NaCl1~2g,ddH2O40~60ml,EDTA4~6mmol和Tris-HCl18~22mmol,β-巯基乙醇0.8~1.2ml,PVP1.5~2.5g,pH为7.5~8.5。
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