[发明专利]基于NBDK的定点荧光标记方法有效
申请号: | 201610041992.1 | 申请日: | 2016-01-22 |
公开(公告)号: | CN105566440B | 公开(公告)日: | 2021-04-02 |
发明(设计)人: | 张贯京;陈兴明;张少鹏;高伟明;李慧玲;潘延超 | 申请(专利权)人: | 深圳市贝沃德克生物技术研究院有限公司 |
主分类号: | C07K1/13 | 分类号: | C07K1/13;C40B50/06 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 518063 广东省深圳市前海深港合作区前*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 nbdk 定点 荧光 标记 方法 | ||
1.一种基于NBDK的定点荧光标记方法,其特征在于,所述基于NBDK的定点荧光标记方法包括如下步骤:
S1:获得产甲烷厌氧菌的吡咯赖氨酸氨酰-tRNA合成酶(M.Barkeri PylRS)突变库;
S2:获得7-硝基苯并-2-氧杂-1,3-二唑-赖氨酸(NBDK);
S3:筛选特异识别NBDK的吡咯赖氨酸氨酰-tRNA合成酶突变体(NBDKRS),所述步骤S3包括:步骤S31,构建和转化用于正筛选作用的pylT-pREP质粒;步骤S32,构建用于表达验证的pylT-pBAD质粒,进行转化和筛选后获得用于特异识别NBDK的NBDKRS的菌株,所述pylT基因编码NBDK氨酰-tRNA合成酶;
S4:在鲸鱼肌红蛋白的4种密码子标签(Myoglobin-4TAG)中插入NBDK,验证筛选得到的NBDKRS能够实现目的蛋白的红色荧光标记;
所述步骤S1包括如下步骤:
S11:人工合成M.Barkeri PylRS的DNA序列;
S12:将上述合成的M.Barkeri PylRS的DNA序列连接到pBK质粒上,获得重组质粒A;
S13:设计定点突变引物,所述定点突变引物包括引物f-L260NNK和引物r-L260NNK、引物f-L270NNK和引物r-L270NNK、引物f-N311F313NNK和引物r-N311F313NNK、引物f-W382NNk和引物r-W382NNk,所述引物f-L260NNK的序列为aacNNKtgcctgcgtccgatgctggc,所述引物r-L260NNK的序列为ggcaMNNgtttttatccacgcgga,所述引物f-L270NNK的序列为accNNKtataactatctgcgtaaac,所述引物r-L270NNK的序列为tataMNNggtcggggccagcatcg,所述引物f-N311F313NNK的序列为catggttNNTtttNNTcaaatgggcagcggctgcacccgtgaaaac,所述引物r-N311F313NNK的序列为catttgANNaaaANNaaccatggtgaattcttccaggtgttctttg,所述引物f-W382NNk的序列为ccgNNKattggcgcgggttttggcctggaac,所述引物r-W382NNk的序列为caatMNNcggtttatcaatgccccattcac;
S14:以所述重组质粒A为模板,以所述引物f-L260NNK和引物r-L260NNK为引物,通过聚合酶链式反应,获得突变库1;
S15:以所述突变库1为模板,以所述引物f-L270NNK和引物r-L270NNK为引物,通过聚合酶链式反应,获得突变库2;
S16:以所述突变库2为模板,以所述引物f-N311F313NNK和引物r-N311F313NNK为引物,通过聚合酶链式反应,获得突变库3;
S17:以所述突变库3为模板,以所述引物f-W382NNk和引物r-W382NNk为引物,通过聚合酶链式反应,获得突变库4;
S18:将所述突变库1、突变库2、突变库3和突变库4混合,获得用于NBDK筛选用的M.Barkeri PylRS突变库。
2.如权利要求1所述的基于NBDK的定点荧光标记方法,其特征在于,所述突变库1、突变库2、突变库3和突变库4按照1:1:32:1的比例进行混合。
3.如权利要求1所述的基于NBDK的定点荧光标记方法,其特征在于,所述步骤S2包括如下步骤:
S21:取4-氯-7-硝基苯-2-氧-1,3-二唑(NBD-Cl)和赖氨酸,溶于乙酸乙酯和水的混合液中,并加热到30℃,滴加十六烷基三甲基溴化胺,反应2小时后即可得到NBDK1;
S22:取NBDK1经液相色谱分离,滤膜过滤除菌,得到NBDK2,所述NBDK2经过0.22微米滤膜过滤除菌,获得NBDK。
4.如权利要求1所述的基于NBDK的定点荧光标记方法,其特征在于,所述NBDKRS的突变位点为L260G,L270A,N311A,N313G,W382C。
5.如权利要求1所述的基于NBDK的定点荧光标记方法,其特征在于,所述步骤S4包括如下步骤:
S41:共转化NBDKRS-pBK和Myoglobin-4tag-pBAD至TOP10中;
S42:获得纯化的Myoglobin蛋白质;
S43:将S42中获得Myoglobin蛋白质在550nm激光激发下,发出红色荧光,即可验证筛选得到的NBDKRS能够实现目的蛋白的红色荧光标记。
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