[发明专利]一种病理图像细胞核快速定位方法有效
申请号: | 201610044876.5 | 申请日: | 2016-01-22 |
公开(公告)号: | CN105741266B | 公开(公告)日: | 2018-08-21 |
发明(设计)人: | 姜志国;郑钰山;张浩鹏;麻义兵 | 申请(专利权)人: | 北京航空航天大学 |
主分类号: | G06T7/00 | 分类号: | G06T7/00 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 100191*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 病理 图像 细胞核 快速 定位 方法 | ||
1.一种病理图像细胞核快速定位方法,应用于数字病理图像中细胞核的快速定位,其特征在于包括以下步骤:
(1)用切片扫描仪将用于组织活检的病理切片扫描到电子计算机中,以RGB三通道形式存储为数字图像矩阵;
(2)利用颜色反卷积矩阵,计算反卷积映射表;
(3)利用步骤(2)中的颜色反卷积映射表提取数字病理切片中的细胞核成分,得到细胞核成分图像;
(4)对步骤(3)中获得的细胞核成分进行混合高斯滤波,得到滤波后图像:
其中,Gj(σj)表示均值为0,标准差为σj的高斯模板,代表卷积运算,n是所用高斯滤波器的数量;
(5)在步骤(4)中得到的滤波后图像中查找局部最大值,获得细胞核的候选位置,对于第i个像素而言,只需考虑与其最近邻的8个像素在Hf中的响应值,如果最近邻的8个像素的响应值均小于第i个像素的响应值,则可初步判断第i个像素为某个细胞核的中心,得到细胞核候选位置;
(6)根据步骤(4)中得到滤波后图像计算自适应阈值,用其对步骤(5)中得到的候选区域进行判断,完成细胞核位置的最终定位,其方法是采用公式:
T=λ·max(Hf)
其中,max(Hf)表示图像Hf中响应的最大值,λ为比例参数;
最终大于阈值T的位置被确定为最终的细胞核定位结果。
2.根据权利要求1所述的一种病理图像细胞核快速定位方法,其特征是:所述步骤(2)利用颜色反卷积矩阵,计算反卷积映射表,其方法是采用公式
hi=hir+hig+hib+hi0 (1)
hir=-m11log ri (2)
hig=-m12log gi (3)
hib=-m13log bi (4)
hi0=(m11+m12+m13)log 255 (5)
其中ri,gi和bi表示病理图像中第i个像素的红,绿和蓝通道的数据,公式(2)(3)和(4)中hir,hig和hib的所有可能取值在对病理图像进行细胞核成分提取前被预先计算,并与ri,gi和bi之间建立一一对应,即建立ri到hir,gi到hig以及bi到hib的映射表;
反卷积矩阵
M的第一行代表苏木精染色成分与RGB三通道光 密度间的运算关系。
3.根据权利要求2所述的一种病理图像细胞核快速定位方法,其特征是:所述步骤(3)利用步骤(2)中预先计算的ri到hir,gi到hig以及bi到hib的颜色反卷积映射表,结合公式hi=hir+hig+hib+hi0提取数字病理切片中的细胞核成分H。
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