[发明专利]检测辣椒叶脉黄化病毒的RT-PCR引物及其方法在审

专利信息
申请号: 201610049511.1 申请日: 2016-01-25
公开(公告)号: CN105695626A 公开(公告)日: 2016-06-22
发明(设计)人: 唐前君;戴良英;刘茂炎;刘湘宁;李迅;刘双清;李魏 申请(专利权)人: 湖南农业大学
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 长沙正奇专利事务所有限责任公司 43113 代理人: 何为;袁颖华
地址: 410128 湖南*** 国省代码: 湖南;43
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摘要:
搜索关键词: 检测 辣椒 叶脉 黄化 病毒 rt pcr 引物 及其 方法
【说明书】:

技术领域

本发明涉及一种检测植物中辣椒叶脉黄化病毒的RT-PCR引物及其方法,具体而 言,涉及一种特异性检测茄科植物中的辣椒叶脉黄化病毒的RT-PCR引物及其方法。

背景技术

辣椒叶脉黄化病毒(Pepperveinyellowsvirus,PeVYV),是一种新型的黄症病 毒科(Luteoviridae)马铃薯卷叶病毒属(Polerovirus)病毒。PeVYV目前主要侵染的作物是 辣椒,在同属茄科植物龙葵上也有报导,经常在混合感染中发现,是一个引起脉黄病 (yellowveindisease)的重要的病原体,在西非地区是一种主要的辣椒病害。PeVYV是通 过棉蚜、嫁接等持续的方式传播,在辣椒上的症状主要有植物矮化、叶脉黄化、叶卷曲、叶片 变形、叶褶皱和节间缩短等。自1995年在日本首次确定以来,PeVYV在欧洲(包括西班牙、荷 兰和土耳其),亚洲(中国、中国台湾、泰国、印度、印度尼西亚、菲律宾和日本)和非洲(苏丹、 马里和突尼斯)等地区都有数据报导。这表明,PeVYV具有广泛的地域分布,对辣椒和其他茄 科植物构成了一个全球性的威胁。

目前,尚未有专门检测PeVYV的专利报导,譬如酶联免疫吸附法以及实时荧光RT- PCR等分子生物学检测方法并未见报导。这对PeVYV的检测来说,是一个重大的缺失,必然对 辣椒感染PeVYV的诊断及及时防控带来负面的影响。而辣椒上PeVYV的发生一般伴随着其他 病毒(比如TMV、CMV、BBWV、PVY等)的混合感染,而且PeVYV侵染发生的某些症状和其它病毒 病的感染症状类似,因此很难简单地从症状上进行区别鉴定;同时,在实验室条件下利用显 微技术对病毒粒子进行形态观察并不能做到有效精准地判断。在这种形势下,建立一种快 速、准确的检测辣椒中PeVYV的PCR方法是非常有必要的,而在这个方法中最关键的是找到 针对PeVYV的特异性高的PCR引物。

发明内容

本发明所要解决的技术问题是,针对上述现有技术的不足,提供一种检测辣椒叶 脉黄化病毒的RT-PCR引物及其方法,利用本发明的RT-PCR引物及方法能更快速、更准确地 直接检测出辣椒或龙葵中是否含有辣椒叶脉黄化病毒。

为解决上述技术问题,本发明提供的技术方案是:一种检测辣椒叶脉黄化病毒的 RT-PCR引物,其正向引物核苷酸序列如SEQIDNO.1所示,反向引物核苷酸序列如SEQID NO.2所示。

本发明同时还提供一种检测辣椒叶脉黄化病毒的RT-PCR方法,该方法是提取待测 样品总RNA,利用上述的引物进行RT-PCR扩增,然后对扩增产物进行电泳鉴定,当所述扩增 产物大小为504bp时,则判断该待测样品感染了辣椒叶脉黄化病毒。

所述待测样品为茄科植物辣椒或龙葵。进一步地,所述待测样品是辣椒叶片或龙 葵叶片。

与现有技术相比,本发明具有以下有益效果:

本发明中设计的特异引物是根据PeVYV核苷酸序列的高保守区所设计,与其它引 物相比较,除了特异性好之外,还具有对不同的PeVYV分离物覆盖率最高的特点,能有效检 测到不同的PeVYV分离物,检测结果更加准确,且检测时不需加辅助引物,更加方便。本发明 的检测方法适用于大批量辣椒作物叶子中PeVYV的直接检测,在降低了检测成本,减少了工 作量的同时,保留了快速、准确,以及灵敏度高等优势。

附图说明

图1是PeVYV正反向引物的Primer-BLAST结果。

图2为本发明正、反向引物与JX427532.1序列互补性对比图。

图中,A:正向引物;B:反向引物。

图3为本发明正、反向引物两引物之间互补性对比图。

图4为本发明引物扩增的琼脂糖凝胶电泳图。

图中,各泳道从左至右依次为TRANS2KPlusDNAMarker、携带PeVYV的辣椒叶 片、健康的辣椒叶片。

图5为本发明引物扩增电泳结果图。

图中,M:TRANS2KPlusDNAMarker;1:感染了PeVYV的辣椒病株叶片;2:感染了 PeVYV的辣椒病株种子;3:感染了蚕豆萎蔫病毒的辣椒病株;4:感染了小西葫芦黄花叶病毒 的南瓜病株。

具体实施方式

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