[发明专利]一种代谢混合物MS/MS质谱的仿真生成方法及系统有效

专利信息
申请号: 201610049964.4 申请日: 2016-01-25
公开(公告)号: CN105760708B 公开(公告)日: 2018-12-14
发明(设计)人: 周家锐;纪震;殷夫;朱泽轩 申请(专利权)人: 哈尔滨工业大学深圳研究生院
主分类号: G06F19/12 分类号: G06F19/12
代理公司: 深圳市君胜知识产权代理事务所(普通合伙) 44268 代理人: 王永文;刘文求
地址: 518055 广东省*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 代谢 混合物 ms 仿真 生成 方法 系统
【说明书】:

发明公开一种代谢混合物MS/MS质谱的仿真生成方法及系统。本发明不依赖于真实实验,可通过修改参数设定,大量产生所需的代谢混合物MS/MS仿真质谱,其成本极低,样本量不受采集条件限制。此外,当条件与环境变动时,也无需重新设计并进行实验;有助于提升代谢组学的研发效率。本发明使用非线性回归模型生成MS/MS仿真质谱,避免了传统算法中简单线性叠加所带来的准确性问题。此外,通过统计真实代谢质谱数据建立噪声概率模型,涵盖了现实应用中需要面临的复杂干扰情况。所生成的质谱数据更符合实际,可有效指导代谢组学的前期研发,并部分用于算法性能的验证。

技术领域

本发明涉及仿真领域,尤其涉及一种代谢混合物MS/MS质谱的仿真生成方法及系统。

背景技术

代谢物是生物体内完成代谢过程的小分子有机化合物总称,其包含了丰富的生理状态信息。代谢组学基于对代谢物的整体系统性研究,可有效揭示生理现象背后的真实机理,并更为全面地展示生命体的动态状态,因此获得了越来越多的重视,被广泛应用于诸多科研与实用领域中。质谱分析(Mass Spectrometry,MS)是代谢组学最为重要的研究工具之一。其中的二级质谱(MS/MS)因其可有效鉴别不同代谢物质,并准确衡量信号强度,近年来已成为主要的发展方向,其数据形式如图1和图2所示。在实际应用中,一般需分析包含多种代谢物的混合物质,其MS/MS质谱成为相关研究与开发的数据基础。

现有的代谢混合物MS/MS质谱主要由两种方法获得:

第一种是直接通过实际实验,使用质谱仪取得特定混合物样本的MS/MS质谱,这一方法可得到真实的谱线数据,是代谢组学最为重要的信息来源与支撑。但其成本较高,在不同混合物与参数条件下的质谱差异较大,难以满足相关研究的需求。

第二种是使用计算机仿真技术,根据已知的单一代谢物MS/MS质谱及理化知识,生成推定的谱数据(Putative Spectra)。此方法成本较低,可大量产生特定参数条件下的代谢混合物仿真质谱。但准确度不高,用于研究开发可能导致错误结果。

在现有的代谢组学研究中,一般使用计算机仿真所生成的MS/MS质谱数据进行初期研发,而后再基于实验数据验证其真实性能。仿真质谱的准确程度决定了相关研究的质量与速度。

现有基于实验的代谢混合物MS/MS质谱生成方法,其缺点在于:

第一,混合物中的各种化学分子在进行二级质谱分析时会相互影响,所产生的MS/MS数据并非各单一物质谱线的简单叠加。且质谱仪参数设置不同,谱线分布也会有所差异。因此实验数据往往难以重复利用,需针对特定的研发项目,重新设计并采集所有的质谱信息,所需成本极高。

第二,某些特定的代谢混合物,例如糖尿病人的血液样本等,采集难度较大、成本较高。且在每个个体上仅能获得有限的样本量,其总数难以保证。影响了后续研究的进行。

现有基于计算机仿真的混合物MS/MS质谱生成方法,其缺点在于:

第一,现有算法往往基于各单一代谢物质谱的线性叠加,与实际情况中的非线性混合状况差异较大。当用于代谢组学研究时,容易导致模型过于简化。在真实的混合物MS/MS质谱上的分析性能不佳。

第二,现有方法所使用的噪声模型过于简单,一般为与生物信息无关的高斯噪声或编辑误差等,所生成的MS/MS仿真质谱难以反映实际情况。

因此,现有技术还有待于改进和发展。

发明内容

鉴于上述现有技术的不足,本发明的目的在于提供一种代谢混合物MS/MS质谱的仿真生成方法及系统,旨在解决现有的代谢混合物MS/MS质谱生成方法要么成本高、采集难度大、要么分析性能不佳、误差大等问题。

本发明的技术方案如下:

一种代谢混合物MS/MS质谱的仿真生成方法,其中,包括步骤:

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