[发明专利]一种用于检测HBV-B/C的数字PCR绝对定量分型检测试剂盒有效
申请号: | 201610060572.8 | 申请日: | 2016-01-28 |
公开(公告)号: | CN105441595B | 公开(公告)日: | 2018-11-16 |
发明(设计)人: | 唐小龙;程龙强;刘新矿;高毅;吴汉霞;蔡霞;段舒婷;王倩倩;陈锐;李运超;金少鹏;李辉;屈爱军;石磊;铁牛 | 申请(专利权)人: | 安徽理工大学 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6851 |
代理公司: | 重庆博凯知识产权代理有限公司 50212 | 代理人: | 张先芸;李华华 |
地址: | 23200*** | 国省代码: | 安徽;34 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 检测 hbv 数字 pcr 绝对 定量 试剂盒 及其 方法 | ||
1.一种用于检测HBV-B/C的数字PCR绝对定量分型检测试剂盒,其特征在于,包括DNA提取液、数字PCR反应缓冲液A、数字PCR反应缓冲液B、HBV-B病毒基因阳性质控、HBV-C病毒基因阳性质控、阴性质控和内标溶液;
所述数字PCR反应缓冲液A中包括有HBV-B型的引物及探针和HBV-C型的引物及探针;所述数字PCR反应缓冲液B中包括有内标的引物及探针;所述HBV-B型、HBV-C型和内标的引物及探针如下所示:
HBV-B型和HBV-C型通用上游引物:
ctagactcgtggtggacttctc;
HBV-B型和HBV-C型通用下游引物:
atgaggcatagcagcaggat;
HBV-B型探针:tcgcagtcccaaatctccagtcactc;
HBV-C型探针:tcgcagtccccaacctccaatca;
内标上游引物:ctgccgttactgccctgtg;
内标下游引物:ttggtctccttaaacctgtcttg;
内标探针:accaccaacttcatccacgttcacc;
所述HBV-B型探针5’端荧光报告基因为FAM,HBV-C型探针5’端荧光报告基团为VIC,内标探针5’端荧光报告基团为VIC,所有探针3’端淬灭基团均为BHQ;
所述HBV-B病毒基因阳性质控为HBV-B的标准质粒溶液;所述HBV-C病毒基因阳性质控为HBV-C的标准质粒溶液;
所述阴性质控为灭菌生理盐水;
所述内标溶液为β-globin的标准质粒溶液;
所述试剂盒具体使用方法包括如下步骤:
(1)受检样品处理:将待测样品用无菌生理盐水洗涤并离心弃去上清液后,加入灭菌水震荡混匀,向震荡混匀后的溶液中加入所述试剂盒中的DNA提取液和内标溶液,剧烈震荡混匀,并于100 ~ 105℃恒温处理10 ~ 16分钟,再于12,000 ~ 14,000rpm/min离心5 ~ 10分钟,取上清液,获得PCR扩增样品DNA模板;
(2)质控品的处理:分别取所述试剂盒中的HBV-B病毒基因阳性质控、HBV-C病毒基因阳性质控和阴性质控,按照与步骤(1)相同的方法处理,分别得到HBV-B病毒基因阳性质控、HBV-C病毒基因阳性质控和阴性质控的DNA模板;
(3)配制数字PCR反应混合液:向步骤(1)和步骤(2)处理后得到的样品DNA模板、HBV-B病毒基因阳性质控DNA模板、HBV-C病毒基因阳性质控DNA模板和阴性质控DNA模板中分别加入灭菌水和所述试剂盒中的数字PCR反应缓冲液,分别配制得到样品、HBV-B病毒基因阳性质控、HBV-C病毒基因阳性质控和阴性质控的数字PCR反应混合液;其中,阳性质控和阴性质控的数字PCR反应混合液均采用数字PCR反应缓冲液A配制,样品的数字PCR反应混合液分为两种,分别采用数字PCR反应缓冲液A和数字PCR反应缓冲液B配制;
(4)将步骤(3)制备的样品、HBV-B病毒基因阳性质控、HBV-C病毒基因阳性质控和阴性质控的数字PCR反应混合液分别制作为油包水PCR微反应液滴,生成的微反应液滴数量为10,000 ~ 20,000个,然后对所述微反应液滴进行PCR扩增反应;
(5)读取荧光信号:步骤(4)PCR扩增后,将PCR反应板放入荧光读取仪器中,分别在FAM和/或VIC通道中进行HBV-B和/或HBV-C的分型检测,通过Quanta soft软件进行定量分析,计算出HBV-B型和/或HBV-C型的拷贝数。
2.根据权利要求1所述用于检测HBV-B/C的数字PCR绝对定量分型检测试剂盒,其特征在于,所述DNA提取液的成分包括50mM pH 8.3的Tris-HCl、0.5M的NaCl、5 mM 的EDTA、质量浓度2.5%的CTAB和2 mM的DTT。
3.根据权利要求1所述用于检测HBV-B/C的数字PCR绝对定量分型检测试剂盒,其特征在于,所述数字PCR反应缓冲液A的成分包括4 mM MgCl2 、50mM pH8.3的Tris-HCl、300 mMdNTP、900 nM所述HBV-B型和HBV-C型通用上游引物、900 nM所述HBV-B型和HBV-C型通用下游引物、250 nM所述HBV-B探针和250 nM所述HBV-C探针。
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