[发明专利]一种油菜转基因成分的检测方法在审
申请号: | 201610061083.4 | 申请日: | 2016-01-29 |
公开(公告)号: | CN105624298A | 公开(公告)日: | 2016-06-01 |
发明(设计)人: | 高利芬;彭海;张静;李丽丽 | 申请(专利权)人: | 江汉大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 北京三高永信知识产权代理有限责任公司 11138 | 代理人: | 徐立 |
地址: | 430056 湖北省武汉市*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 油菜 转基因 成分 检测 方法 | ||
1.一种油菜转基因成分的检测方法,其特征在于,所述方法包括:
确定待测样品中需要检测的转基因成分、所述待测样品中的内源标准基因和所述待测 样品的外源标准基因,所述待测样品为油菜植株或所述油菜植株的一部分;
制备用于扩增所述转基因成分、所述内源标准基因和所述外源标准基因的测试区域的 多重扩增引物;
对所述待测样品进行抽样并混合,得到混合样品;
提取所述混合样品的基因组;
向所述混合样品的基因组中加入所述外源标准基因,得到混合核酸;
利用所述多重扩增引物对所述混合核酸进行扩增,得到扩增产物,利用所述扩增产物 构建高通量测序文库;
对所述高通量测序文库进行高通量测序,得到测序片段组;
分析所述测序片段组,获得所述待测样品中所述转基因成分的测序片段的数量、所述 内源标准基因的测序片段的数量和所述外源标准基因的测序片段的数量;
根据所述外源标准基因的测序片段的数量,判断实验是否成功;
若所述实验成功,则计算所述待测样品种中所述转基因成分的含量;
根据所述转基因成分的含量判断所述待测样品中是否含有转基因成分。
2.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述转基因成分为外源功能基因、抗 性标记基因、启动子、终止子和外源插入旁侧序列中的至少一种。
3.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述内源标准基因为所述待测样品的 基因组中的单拷贝基因。
4.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述外源标准基因不存在于所有生物 中。
5.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述判断实验是否成功的方法为:当 所述外源标准基因的测序片段的数量和所述内源标准基因的测序片段的数量均≥α1时,则 实验成功;当所述外源标准基因的测序片段的数量或所述内源标准基因的测序片段的数量 <α1时,则实验失败;其中,α1为判定阈值。
6.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述判定所述待测样品是否含有转基 因成分的方法为:当需要检测的任意一种所述转基因成分的含量≥α2时,判定所述待测样 品含有转基因成分;当所有所述转基因成分的含量<α2时,判定所述待测样品不含有转基因 成分;其中,α2为判定阈值。
7.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,计算所述待测样品种中所述转基因成 分的含量的方法为:第m种所述转基因成分的含量的计算公式为其中,i为所述第m种转基因成分的第i个所述测试区域,n1为所述第m种转基因成分的所述 测试区域的个数,bi为所述第m种转基因成分的第i个所述测试区域的所述测序片段的数 量,k为第k种所述内源标准基因,n3为所述内源标准基因的个数,j为第k种所述内源标准基 因的第j个测试区域,n2为所述第k种内源标准基因的所述测试区域的个数,aj为所述第k种 内源标准基因的第j种所述测试区域的所述测序片段的数量;N为所有所述内源标准基因的 所述测试区域的总数。
8.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述外源标准基因的质量与所述混合 样品的基因组的总质量的比例大于1/100000。
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