[发明专利]与乙型肝炎肝硬化相关的IL-6基因rs10499563位点标志物及其应用有效
申请号: | 201610116342.9 | 申请日: | 2016-03-01 |
公开(公告)号: | CN105586425B | 公开(公告)日: | 2020-08-07 |
发明(设计)人: | 郑敏;陈智;夏彩霞;刘艳宁;陈峰;黄春红;楼国华;朱伟 | 申请(专利权)人: | 浙江大学 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12N15/11 |
代理公司: | 杭州中成专利事务所有限公司 33212 | 代理人: | 朱莹莹 |
地址: | 310058 浙江*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 乙型肝炎 肝硬化 相关 il 基因 rs10499563 标志 及其 应用 | ||
本发明涉及乙型肝炎肝硬化患者的个体易感性。具体地,本发明涉及与乙型肝炎肝硬化相关的易感基因IL‑6的rs10499563位点标志物在乙型肝炎肝硬化患者评估中的应用。本发明提供了一种与乙型肝炎肝硬化相关的IL‑6基因rs10499563位点标志物及其检测试剂和检测方法。本发明还提供了与乙型肝炎肝硬化患者评估相关的IL‑6基因的SNP位点,即IL‑6基因rs10499563位点T等位基因及其在乙型肝炎肝硬化患者评估中的应用。
技术领域
本发明涉及乙型肝炎肝硬化患者的个体易感性。具体地,本发明涉及与乙型肝炎肝硬化相关的易感基因IL-6的rs10499563位点标志物在乙型肝炎肝硬化患者评估中的应用。
背景技术
2015年WHO更新的数据显示,全球慢性乙型肝炎病毒(HBV)感染者约2亿4000万人。全世界更有每年超过78万的人死于乙型肝炎的各种并发症,包括肝硬化和肝癌。我国是病毒性肝炎高发区,现有的慢性HBV感染者约9300万人,其中慢性乙型肝炎(CHB)患者约2000万人。一般慢性乙型肝炎是渐进发展引起并发症,但是部分病人并没有经历明显的慢性乙型肝炎的过程就突然出现肝硬化的症状和体征,有些患者甚至到了失代偿阶段才被发现。于是,对慢性乙型肝炎肝硬化科学地预警预测和早期诊断早期干预对于控制病情发展和降低病死率至关重要。
IL-6是由184个氨基酸组成的经典的细胞因子,它的基因位于7号染色体上。IL-6有2个受体:IL-6受体(IL-6R)和gp130。IL-6R有2种形式,膜型IL-6R和可溶性IL-6R(sIL-6R)。IL-6通过膜型IL-6R介导的是经典的信号通路,通过sIL-6R介导的是反式信号通路。对于健康人来说,血浆水平的IL-6几乎测不到。但是,在慢性炎症性疾病中,比如慢性乙型肝炎,可以检测到异常分泌的血浆IL-6水平。有研究显示,IL-6水平在慢性乙型肝炎(CHB)病人中比在健康人中显著升高,并且相比CHB病人,IL-6水平在晚期肝病(肝硬化或者肝癌)病人中表达的更显著。而该基因的多态性可能改变其表达或者结合活性,从而影响肝损伤和疾病严重程度。因此,IL-6基因多态性分析对于CHB患者病情转归的判断和预警具有重要价值,特别是对于慢性乙型肝炎进展为肝硬化的预警更有不可替代的意义。
发明内容
为了解决以上问题,本发明提供了一种与乙型肝炎肝硬化相关的IL-6基因rs10499563位点标志物及其检测试剂和检测方法。
与乙型肝炎肝硬化相关的IL-6基因rs10499563位点标志物,IL-6基因的rs10499563位点表现为T等位基因。
一种试剂,用于检测IL-6基因rs10499563位点的试剂。
一种试剂盒,包含用于检测IL-6基因rs10499563位点的试剂和PCR技术常用的试剂。
一种检测IL-6基因rs10499563位点标志物的方法,采用Taqman探针法,包括如下步骤:
1)于ABI公司购买用于IL-6基因rs10499563位点的检测引物和Taqman探针,并对样本基因组DNA在Roche LC480ⅡPCR仪上进行特异性PCR扩增,所述Taqman探针被两种荧光染料Vic、Fam双标记,该探针分别是针对双等位SNP的不同基因型,只有完全匹配的探针才能扩增出各自对应的基因型;
2)按下列条件进行反应:起始95℃预热10min,然后95℃变性10s,60℃退火和延伸30s,循环45次;产物在Roche LC480Ⅱ型荧光定量PCR仪上扫描读取数据,分析得出研究对象的基因型。
用于检测IL-6基因rs10499563位点的试剂在制备用于乙型肝炎肝硬化诊断试剂盒中的应用。
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