[发明专利]快速鉴别东白眉长臂猿和北白颊长臂猿的分子生物学方法有效
申请号: | 201610116375.3 | 申请日: | 2016-03-02 |
公开(公告)号: | CN106636319B | 公开(公告)日: | 2020-08-25 |
发明(设计)人: | 李青青;李有龙;王昌命;郭爱伟;杨亚晋;陈粉粉;唐杨春;冯林贵;张健;陈敏 | 申请(专利权)人: | 西南林业大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888 |
代理公司: | 昆明协立知识产权代理事务所(普通合伙) 53108 | 代理人: | 谢嘉 |
地址: | 650224 *** | 国省代码: | 云南;53 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 快速 鉴别 东白眉 长臂猿 北白颊 分子生物学 方法 | ||
1.一种快速鉴别东白眉长臂猿和北白颊长臂猿的分子生物学方法,包括下述顺序的步骤:
(1)从待测对象中分离提取基因组DNA;
(2)利用两组PCR引物对待测对象的COI基因全序列进行PCR扩增:
所述的两组PCR引物的引物序列分别为:
P1F:5'-AACCGAACGCAAATCA-3',
P1R:5'-AAAGTGTAGCCCGAGA-3';
P2F:5'-TCCGCTGGCAGGAAACT-3',
P2R:5'-GGCGTGGTCGTGGAAAG-3';
以步骤(1)得到的基因组DNA为模板,以所述的P1F和P1R为引物对进行PCR,得到片段APCR产物;以所述的P2F和P2R为引物对进行PCR,得到片段B PCR产物;
(3)将扩增良好的片段A PCR产物和片段B PCR产物送生物公司测序后,将片段A和片段B拼接,截去COI基因全序列前后多余的碱基,即得到待测对象的COI基因全序列;
(4)依据下表所列的核苷酸序列特征变异位点进行物种鉴别:
东白眉长臂猿和北白颊长臂猿的核苷酸序列特征变异位点
表中位点的序号以COI基因全序列位置为基准;表中字母“M”为东白眉长臂猿的简写;字母“J”为北白颊长臂猿的简写;相关的简并碱基代码为R=A/G,Y=C/T。
2.根据权利要求1所述的快速鉴别方法,其特征在于:步骤(2)所述的PCR,其反应体系为50μl,其中模板DNA 25ng,1×PCR buffer,2.5mM Mgcl2,1mM dNTP,2μg/μl BSA,正、反向引物各2pM,TaqDNA聚合酶1个单位;具体操作为,加去离子水调至终体积50μl,以石蜡油封盖体系;PCR反应条件如下:95℃预变性3分钟,94℃变性1分钟,50℃退火1分钟,72℃延伸1分钟;35个循环后,72℃再延伸10分钟。
3.根据权利要求1所述的快速鉴别方法,其特征在于:所述的待测对象包括动物的静脉血、粪便、毛发或尿液样品。
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