[发明专利]快速鉴别东白眉长臂猿和北白颊长臂猿的分子生物学方法有效

专利信息
申请号: 201610116375.3 申请日: 2016-03-02
公开(公告)号: CN106636319B 公开(公告)日: 2020-08-25
发明(设计)人: 李青青;李有龙;王昌命;郭爱伟;杨亚晋;陈粉粉;唐杨春;冯林贵;张健;陈敏 申请(专利权)人: 西南林业大学
主分类号: C12Q1/6888 分类号: C12Q1/6888
代理公司: 昆明协立知识产权代理事务所(普通合伙) 53108 代理人: 谢嘉
地址: 650224 *** 国省代码: 云南;53
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摘要:
搜索关键词: 快速 鉴别 东白眉 长臂猿 北白颊 分子生物学 方法
【权利要求书】:

1.一种快速鉴别东白眉长臂猿和北白颊长臂猿的分子生物学方法,包括下述顺序的步骤:

(1)从待测对象中分离提取基因组DNA;

(2)利用两组PCR引物对待测对象的COI基因全序列进行PCR扩增:

所述的两组PCR引物的引物序列分别为:

P1F:5'-AACCGAACGCAAATCA-3',

P1R:5'-AAAGTGTAGCCCGAGA-3';

P2F:5'-TCCGCTGGCAGGAAACT-3',

P2R:5'-GGCGTGGTCGTGGAAAG-3';

以步骤(1)得到的基因组DNA为模板,以所述的P1F和P1R为引物对进行PCR,得到片段APCR产物;以所述的P2F和P2R为引物对进行PCR,得到片段B PCR产物;

(3)将扩增良好的片段A PCR产物和片段B PCR产物送生物公司测序后,将片段A和片段B拼接,截去COI基因全序列前后多余的碱基,即得到待测对象的COI基因全序列;

(4)依据下表所列的核苷酸序列特征变异位点进行物种鉴别:

东白眉长臂猿和北白颊长臂猿的核苷酸序列特征变异位点

表中位点的序号以COI基因全序列位置为基准;表中字母“M”为东白眉长臂猿的简写;字母“J”为北白颊长臂猿的简写;相关的简并碱基代码为R=A/G,Y=C/T。

2.根据权利要求1所述的快速鉴别方法,其特征在于:步骤(2)所述的PCR,其反应体系为50μl,其中模板DNA 25ng,1×PCR buffer,2.5mM Mgcl2,1mM dNTP,2μg/μl BSA,正、反向引物各2pM,TaqDNA聚合酶1个单位;具体操作为,加去离子水调至终体积50μl,以石蜡油封盖体系;PCR反应条件如下:95℃预变性3分钟,94℃变性1分钟,50℃退火1分钟,72℃延伸1分钟;35个循环后,72℃再延伸10分钟。

3.根据权利要求1所述的快速鉴别方法,其特征在于:所述的待测对象包括动物的静脉血、粪便、毛发或尿液样品。

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