[发明专利]sRNA分析系统及方法在审
申请号: | 201610124755.1 | 申请日: | 2016-03-04 |
公开(公告)号: | CN105740652A | 公开(公告)日: | 2016-07-06 |
发明(设计)人: | 郑洪坤;孔关义;刘翔 | 申请(专利权)人: | 北京百迈客生物科技有限公司 |
主分类号: | G06F19/22 | 分类号: | G06F19/22;G06F19/24 |
代理公司: | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人: | 李相雨 |
地址: | 101300 北京市顺*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | srna 分析 系统 方法 | ||
技术领域
本发明涉及生物信息分析技术领域,特别涉及一种sRNA分析系统及方法。
背景技术
随着高通量测序技术在医疗、健康、医药、环境、能源等相关领域的广泛应用,生物大数据时代已经到来。SmallRNA是一种小的非编码RNA,长度为18-30个核苷酸,几乎存在于所有的生物体中,包括:miRNA、siRNA和piRNA。SmallRNA通过多种多样的作用途径,包括mRNA降解、翻译抑制、异染色质形成以及DNA去除,来调控生物体的生长发育和疾病发生,在人、动植物的转录和转录后调控过程中起着重要的作用。
sRNA测序得到的高通量原始数据是长度不等的序列,要通过生物信息学工具把这些序列比对到已有的基因组或者相近物种基因组序列上,并进一步分析得到有生物学意义的结果。在传统的测序公司分析流程中,客户的分析需求需要在客户、测序公司的客服及生物信息分析人员之间进行沟通交流,以确定分析方案。最后客户得到分析结果后又会产生进一步的分析需求,但大部分客户限于专业知识及分析条件,没有计算资源,无法独立完成需要的分析,需要再次与测序公司沟通,进行更进一步的分析。
因此在现有的分析流程下,客户的分析需求可能由于中间的沟通环节被误解甚至丢失,并且数据分析的周期也被拉的很长,数据处理效率低,用户无法灵活的处理自己的测序数据。
发明内容
为解决上述技术问题,本发明一方面提出了一种sRNA分析系统,所述系统包括:
用户请求分析模块,用于获取用户的sRNA分析请求以及指定分析数据,并根据所述sRNA分析请求以及指定分析数据进行分析,以获取sRNA分析的流程定制分析结果;
数据挖掘展示模块,用于根据所述流程定制分析结果进行sRNA分析,并以文字及图表形式展示所述sRNA分析的结果。
优选地,还包括:
云端数据库,用于存储测序数据以及所述sRNA分析的结果数据;
所述sRNA分析请求用于从所述云端数据库中选择指定的数据作为sRNA分析使用数据。
优选地,所述用户请求分析模块包括:
任务生成模块,用于接收所述sRNA分析请求中用户设定的分析内容,根据该分析内容生成对所述sRNA分析使用数据进行分析的操作任务。
优选地,所述系统还包括:
分析软件库,用于存储各种分析软件;
相应地,所述数据挖掘展示模块还包括:
任务调度模块,用于接收所述操作任务,并调用所述分析软件库中的相应分析软件执行所述操作任务。
优选地,所述指定分析数据包括原始sRNA高通量测序数据以及对所述原始sRNA高通量测序数据进行一种或多种处理或分析之后得到的结果数据。
另一方面,本发明还提供了一种sRNA分析方法,所述方法包括:
获取用户的sRNA分析请求以及指定分析数据,并根据所述sRNA分析请求以及指定分析数据进行分析,以获取sRNA分析的流程定制分析结果;
根据所述流程定制分析结果进行sRNA分析,并以文字及图表形式展示所述sRNA分析的结果。
优选地,所述获取用户的sRNA分析请求以及指定分析数据,并根据所述sRNA分析请求以及指定分析数据进行分析,以获取sRNA分析的流程定制分析结果之前,所述方法还包括:
设置用于存储测序数据以及所述sRNA分析的结果数据的云端数据库;
所述sRNA分析请求用于从所述云端数据库中选择指定的数据作为sRNA分析使用数据。
优选地,所述获取用户的sRNA分析请求以及指定分析数据,并根据所述sRNA分析请求以及指定分析数据进行分析,以获取sRNA分析的流程定制分析结果,包括:
接收所述sRNA分析请求中用户设定的分析内容,根据该分析内容生成对所述sRNA分析使用数据进行分析的操作任务。
优选地,所述根据所述流程定制分析结果进行sRNA分析,并以文字及图表形式展示所述sRNA分析的结果之前,所述方法还包括:
设置存储各种分析软件的分析软件库;
相应地,所述根据所述流程定制分析结果进行sRNA分析,并以文字及图表形式展示所述sRNA分析的结果,还包括:
接收所述操作任务,并调用所述分析软件库中的相应分析软件执行所述操作任务。
优选地,所述指定分析数据包括原始sRNA高通量测序数据以及对所述原始sRNA高通量测序数据进行一种或多种处理或分析之后得到的结果数据。
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