[发明专利]一种苹果褪绿叶斑病毒检测试剂盒及检测方法在审
申请号: | 201610125355.2 | 申请日: | 2016-03-07 |
公开(公告)号: | CN105543417A | 公开(公告)日: | 2016-05-04 |
发明(设计)人: | 魏芳 | 申请(专利权)人: | 魏芳 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 050011 河*** | 国省代码: | 河北;13 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 苹果 叶斑 病毒 检测 试剂盒 方法 | ||
技术领域
本发明涉及微生物检测领域,具体地说,本发明涉及一种苹果褪 绿叶斑病毒检测试剂盒及检测方法。
背景技术
苹果属蔷微科苹果属,多年生落叶果树,原产于亚洲中部、欧洲 东南及新疆西部。苹果病毒是导致苹果果树传染病的主要因素,大多 通过嫁接、修剪等传染。若病毒在植株体内长年积累,将会引发严重 后果。由于病毒是专性寄生,当其大量繁殖时,会干扰果树正常繁殖 代谢,引起树体长势减弱、叶片萎缩翻卷和果实畸形、风味变劣,果 树提早枯死,甚至绝产,严重影响苹果的产量。因此,早期对苹果果 树进行病毒检测以及时采取防控措施,已迫在眉睫。
苹果褪绿叶斑病毒(Applechloroticleafspotvirus,ACLSV)是果 树传染病的最主要病原体之一,又名苹果潜隐病毒1,属于纤毛病毒 属(Trichovirus),主要侵染苹果、梨、核果类果树及蔷藻科观赏品 种等。被苹果褪绿叶斑病毒侵染的果树植株,树体长势日趋衰退,叶 片上会出现褪绿色如黄色斑点或条状斑,卷缩变小或向对侧弯曲,严 重影响叶片的光合作用面积。
苹果褪绿叶斑病毒是一种正义单链RNA病毒,为弯曲柔软的纤 维状条形,无鞘膜,其碱基长度约为7.5kb,核酸分子量大概是 2500kDa,外壳蛋白由多肽组装而成,分子量约为22kDa。目前对苹 果褪绿叶斑病毒的检测,多采用传统的肉眼观察、血清学法以及分子 生物学检测方法,如RT-PCR。然而,传统方法耗时长,灵敏度不高, 特异性差,对检测人员的水平要求相对较高;血清学方法费用昂贵, 操作步骤多,耗时较长,且样品中可能存在与抗体发生非特异性反应 的杂质,易出现假阳性结果,因此只适合于初筛;而常规RT-PCR的 特异性和灵敏度也不高。为了适应产业发展需求,有必要开发一种能 够更加快速、准确地对苹果褪绿叶斑病毒进行检测的方法。
环介导恒温扩增技术(loop-mediatedisothermalamplification, LAMP)是近些年发展起来的一种新型的核酸扩增方法(见文献 NotomiT,OkayamaH,MasubuchiH,YonekawaT,WatanabeK,Amino N,HaseT.Loop-mediatedisothermalamplificationofDNA.Nucleic AcidsRes.2000Jun15;28(12):E63)。与常规PCR相比,LAMP无需 模板的热变性、温度循环、电泳及紫外观察等过程,短时间内即可实 现大量拷贝数的核酸扩增,且无需高端的仪器设备,具有特异性强、 灵敏度高、易于判读、可定性定量等优势。
逆转录-环介导恒温扩增技术(RT-LAMP)是基于LAMP建立的 RNA检测技术,其灵敏度是普通RT-PCR的100倍。RT-LAMP扩增 原理与LAMP相同,但在反应体系中增加了逆转录酶,使RNA的逆 转录和cDNA的LAMP扩增在同一试管中一步完成。
发明内容
本发明的目的在于提供一种苹果褪绿叶斑病毒检测试剂盒及检 测方法。
为了实现本发明的目的,在一个方面中,本发明提供了一种苹果 褪绿叶斑病毒检测试剂盒,其特征在于包括4条特异性引物:外引物 F3,其序列如SEQIDNO:1所示;外引物B3,其序列如SEQIDNO:2 所示;内引物FIP,其序列如SEQIDNO:3所示;内引物BIP,其序 列如SEQIDNO:4所示。引物序列具体如下:
外引物F3:ATGGAGGATCAGAAAGTGAT(SEQIDNO:1)
外引物B3:TGGTTGTAAAGAGGTTTGTGA(SEQIDNO:2)
内引物FIP:TGGGTCCGAAGATGTAGTCTTGA-GTCATACA ATCTGAAGGAGGT(SEQIDNO:3)
内引物BIP:TCAGCAACATGACTTTCCGTCAG-CCTTTATAC TTCAATTTCACCAAC(SEQIDNO:4)。
优选所述外引物F3和B3的浓度均为5pmol/μl,所述内引物FIP 和BIP的浓度均为40pmol/μl。
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