[发明专利]检测外来入侵藻类生物的基因芯片

说明书

技术领域

本发明涉及藻类生物的分子学检测，具体涉及检测外来入侵藻类生物的基因芯 片。

背景技术

为使船舶处于稳定适航状态，在船舶底舱注入的适量水体，压舱水含有大量有害 藻类，因在新环境中缺少天敌，这些入侵物种会迅速蔓延，威胁停靠国海洋生态系统的平 衡，给海洋环境、海洋渔业和海水养殖业造成严重危害。据国际海事组织统计，全世界船只 每年约携带100亿吨压舱水在世界各地往来，每天压舱水中至少有700种至1万多种海洋微 生物和动植物在全球流动，凡是具有海岸线或大陆水域的国家都需要监控和检测有害藻 类。藻类传统检测主要采用形态学观察，这种检测方法费时费力，而且需要专业的分类专家 来区分某些藻类和浮游植物。由于赤潮和绿潮的发生频率和持续周期在全球范围内有所上 升，需要开发新的技术来快速检测有害藻类，各种基于PCR的方法已经开发出来，并在有害 藻类单一物种的鉴别方面显示出其可靠性。但是，具有特定引物的PCR方法在使用时一次只 可以鉴别一种物种，如甲藻。在分析特定样品中的多个藻类物种时，需要借助多个PCR检测 方法才能完成，这使得此类方法有些费时费力。这些成功开发的芯片方法大多数用于产生 赤潮的微藻物种识别。

发明内容

本发明所要解决的技术问题是提供一种涉及检测外来入侵藻类生物的基因芯片； 该基因芯片能快速检测判读多个属或种的入侵藻类生物。

本发明解决上述技术问题所采取的技术方案为：检测外来入侵藻类生物的基因芯 片，包括化学修饰的固相载体，在所述固相载体上点阵分布有检测探针和质控探针，所述检 测探针包括待测塔玛亚历山大藻(Alexandriumtamarense)；条纹环沟藻(Gyrodinium instriatum)；赤潮异弯藻(Heterosigmaakashiwo)；东海原甲藻(Prorocentrum donghaiense)；微小原甲藻(Prorocentrumminimum)；扁浒苔(Ulvacompressa)；米氏凯伦 藻(Kareniamikimotol)；石蒓属藻(Ulvaohnoi)；浒苔属藻(Ulvaprolifera)的特异性 18S序列、28S序列、rbcl序列及ITS序列，所述质控探针为芯片固定阳性对照的核苷酸序列： SEQIDNO1所示，芯片杂交阳性对照的核苷酸序列：SEQIDNO2所示，芯片杂交阴性对照 的核苷酸序列：SEQIDNO3所示，芯片杂交空白对照，塔玛亚历山大藻的检测探针序列为： SEQIDNO4、SEQIDNO5所示，条纹环沟藻的检测探针序列为：SEQIDNO6、SEQIDNO 7、SEQIDNO8、SEQIDNO9、SEQIDNO10、SEQIDNO11、SEQIDNO12、SEQIDNO 13、SEQIDNO14、SEQIDNO15、SEQIDNO16所示，赤潮异弯藻的检测探针序列为：SEQ IDNO17、SEQIDNO18、SEQIDNO19、SEQIDNO20、SEQIDNO21、SEQIDNO22、SEQ IDNO23、SEQIDNO24、SEQIDNO25、SEQIDNO26、SEQIDNO27、SEQIDNO28、SEQ IDNO29、SEQIDNO30、SEQIDNO31所示，东海原甲藻的检测探针序列为：SEQIDNO 32、SEQIDNO33、SEQIDNO34、SEQIDNO35所示，微小原甲藻的检测探针序列为：SEQ IDNO36、SEQIDNO37所示，扁浒苔的检测探针序列为：SEQIDNO38、SEQIDNO39、 SEQIDNO40所示，米氏凯伦藻的检测探针序列为：SEQIDNO41所示，石蒓属藻的检测探 针序列为：SEQIDNO42、SEQIDNO43所示，浒苔属藻的检测探针序列为：SEQIDNO44、 SEQIDNO45所示。