[发明专利]一种基于Ion Torrent测序平台的乳腺癌基因BRCA的DNA文库构建方法在审
申请号: | 201610140822.9 | 申请日: | 2016-03-11 |
公开(公告)号: | CN105696089A | 公开(公告)日: | 2016-06-22 |
发明(设计)人: | 杜宝珠;蔡乐靖;钱飞箭;卢灵潇;丁志远;陈帼婧;陈贤丰 | 申请(专利权)人: | 浙江圣庭生物科技有限公司 |
主分类号: | C40B50/06 | 分类号: | C40B50/06;C40B40/08;C12Q1/68 |
代理公司: | 北京华仲龙腾专利代理事务所(普通合伙) 11548 | 代理人: | 李静 |
地址: | 318020 浙江省台州*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 ion torrent 平台 乳腺癌 基因 brca dna 文库 构建 方法 | ||
1.一种基于IonTorren测序平台的乳腺癌基因BRCA的DNA文库构建方法,其特征在于, 具体步骤如下:
(1)目标区域扩增:将待测样本的DNA以及多重PCR引物,经多重PCR反应,得到第一样 本;
(2)引物清除:取第一样本与引物清除试剂混合进行反应,得到第二样本;
(3)接头连接:将第二样本与接头P1进行接头连接反应,得到第三样本;
(4)磁珠纯化:将第三样本进行磁珠纯化,得到第四样本;
(5)文库扩增:将第四样本加入扩增酶Mix和扩增引物进行PCR扩增,并进行磁珠纯化, 得到目的DNA文库;
(6)文库检测:将得到的文库采用Qubit和11~13%的聚丙烯酰胺凝胶电泳检测文库浓 度、文库片段大小及文库质量,即得;
所述11~13%的PAGE配方为:水,3~4mL;30%丙烯酰胺,2022~2062μL;5*TBE,1.2~ 1.8mL;9~11%AP,100~120μL;TEMED,9~11μL。
2.根据权利要求1所述的基于IonTorren测序平台的乳腺癌基因BRCA的DNA文库构建 方法,其特征在于,步骤(1)中的多重PCR引物为IonAmpliSeqTMBRCA1andBRCA2Panel。
3.根据权利要求1所述的基于IonTorren测序平台的乳腺癌基因BRCA的DNA文库构建 方法,其特征在于,步骤(1)中的反应体系为10μL体系,反应体系的组成成分具体为:
4.根据权利要求1所述的基于IonTorren测序平台的乳腺癌基因BRCA的DNA文库构建 方法,其特征在于,步骤(1)中PCR反应的循环数为18。
5.根据权利要求1所述的基于IonTorren测序平台的乳腺癌基因BRCA的DNA文库构建 方法,其特征在于,步骤(2)中的引物清除试剂为FuPaReagentTM,加入量为每个上述10μL PCR体系加入0.9~1.1μL引物清除试剂。
6.根据权利要求1所述的基于IonTorren测序平台的乳腺癌基因BRCA的DNA文库构建 方法,其特征在于,步骤(3)的接头P1为:
5'CCACTACGCCTCCGCTTTCCTCTCTATGGGCAGTCGGTGAT3'
5'ATCACCGACTGCCCATAGAGAGGAAAGCGGAGGCGTAGTGGTT3'。
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