[发明专利]裸鼹鼠微卫星标记位点、引物及其应用

说明书

本发明属于生物技术检测领域，具体涉及裸鼹鼠微卫星标记位点、引物及其应用。本发明建立的裸鼹鼠微卫星位点达45个，可用于裸鼹鼠群落的遗传多态性检测，为裸鼹鼠的微卫星多态性检测奠定坚实的基础。

技术领域

本发明属于生物技术检测领域，具体涉及裸鼹鼠微卫星标记位点，该些微卫星标记位点引物，为裸鼹鼠封闭群遗传多态性的鉴定奠定了基础。

背景技术

作为一种新型实验动物，近年来裸鼹鼠得到国际上的广泛重视。已有报道表明，人工饲养野外捕获的裸鼹鼠中，百分之八十的寿命超过24年，即使16岁的年龄段以后，其死亡率也没有显著的上升，而且没发现有癌症的发生。与大多数别的哺乳动物不同，1岁到24岁之间的裸鼹鼠骨密度没有明显的变化。且在5岁到20岁的年龄这段时间，裸鼹鼠的基本代谢，胃肠道吸收，身体组成成分并没有随年龄的增加而发生变化。裸鼹鼠的生理学特征表明裸鼹鼠具有显著的抗衰老能力和抗肿瘤能力。目前对于裸鼹鼠的研究报道来自中国、美国、日本、英国、非洲等，各个地方的裸鼹鼠遗传背景不同，势必对研究结果造成影响。因此研究裸鼹鼠的遗传背景，使其规范化使用迫在眉睫。但是目前对于裸鼹鼠的遗传学报道较少。至今为止，裸鼹鼠的微卫星位点仅见12个位点的报道，远远不能满足裸鼹鼠的遗传多态性鉴定需要。

微卫星DNA是由2-6bp碱基组成的一个多次串联重复序列，又称为短序列重复(short tandemrepeat，STR)、简单重复序列(Single sequencerepeats，SSR)，普遍存在于真核生物的基因组中，平均每10kb就出现一个STR位点。通过其可以对多态信息含量(PIC)、群体杂合度分析、遗传距离分析等进行准确的测定，已广泛应用于群体遗传学分析、基因图谱分析及亲缘关系等研究。

目前微卫星位点检测方法有琼脂糖凝胶电泳、聚丙烯酰胺凝胶电泳、毛细管电泳。其中毛细管电泳最为灵敏，且可实现高通量检测，操作过程相对简单，结果可靠，是判断的最终标准。近年来本实验室在建立裸鼹鼠封闭群并进行一系列生物学特性研究的基础上，进一步筛选裸鼹鼠高度多态性微卫星位点，为裸鼹鼠的遗传学检测奠定基础。

发明内容

为了解决上述检测技术的不足，本发明筛选并建立了多个具多态性的裸鼹鼠微卫星标记位点，以及相应的微卫星引物，为鉴定裸鼹鼠封闭群遗传多态性程度奠定了基础。

本发明的目的通过以下技术方案来实现：

本发明的第一目的在于提供一种裸鼹鼠微卫星标记位点，使用多态性较高的SMMU2016001等45个位点构成种群检测体系，所述微卫星标记位点在UCSC基因库中对应的编号位置如下所示，

本发明的第二目的在于提供上述45个微卫星标记位点对应的引物对，核苷酸序列如下：

SMMU2016001F：5’-ATACCCTGGTTTCCTGAT-3’，SEQ ID NO：1；

SMMU2016001R：5’-GAATGGTTTTATTGCATAG-3’，SEQ ID NO：2；

SMMU2016002F：5’-TTACTGCTGGTGTTCTGA-3’，SEQ ID NO：3；

SMMU2016002R：5’-ACCGCTGACTTACATTCC-3’，SEQ ID NO：4；

SMMU2016003F：5’-GGGTAGCAGGGCCAAGTT-3’，SEQ ID NO：5；

SMMU2016003R：5’-GGTAAAGGTCCTCGCATC-3’，SEQ ID NO：6；

SMMU2016004F：5’-AACGACGCAAGTTCAATC-3’，SEQ ID NO：7；