[发明专利]细菌噬菌体基因组DNA提取试剂盒及方法有效
申请号: | 201610158262.X | 申请日: | 2016-03-18 |
公开(公告)号: | CN105567678B | 公开(公告)日: | 2020-04-24 |
发明(设计)人: | 罗鹏;刘秋婷;何香燕;胡超群;田雨顺 | 申请(专利权)人: | 中国科学院南海海洋研究所 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 广州科粤专利商标代理有限公司 44001 | 代理人: | 刘明星 |
地址: | 510301 *** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 细菌 噬菌体 基因组 dna 提取 试剂盒 方法 | ||
1.一种细菌噬菌体基因组DNA提取试剂盒,其特征在于,包括以下试剂:
(1)试剂A:氯仿;
(2)试剂B:用TE缓冲液配制的10-20mg/ml的DNase I;
(3)试剂C:用TE缓冲液配制的10-20mg/ml的RNase A;
(4)试剂D:含300-400mg/ml的聚乙二醇-8000和3M NaCl;
(5)试剂E:每升含有5.8g NaCl、1.23g MgSO4·7H2O、50ml的1M pH8.0的Tris-Cl和100ml 0.05mol EDTA;
(6)试剂F:150-200mg/ml的十二烷基苯磺酸钠;
(7)试剂G:用TE缓冲液配制的15-25mg/ml的蛋白酶K;
(8)试剂H:5-6M NaCl;
(9)试剂I:含6-7M异硫氰酸胍和100mM Tris,pH 6.4;
(10)试剂J:由5-10mM pH 8.0的Tris-Cl与无水乙醇按1:4的体积比混合而成;
(11)试剂K:5-10mM pH 8.0的Tris-Cl;
所述的TE缓冲液含有10mM三羟基甲基氨基四烷和1mM乙二酸四乙酸,pH 8.0;
所述的细菌噬菌体为溶藻弧菌噬菌体ФPE333、大肠杆菌噬菌体ФP1655或阴沟肠杆菌噬菌体ФPZJ02。
2.一种细菌噬菌体基因组DNA的提取方法,其特征在于,具体步骤如下:
(1)细菌菌体及其碎片去除:细菌过夜培养后,按体积分数2%接种于LB新鲜培养基,加入体积分数2%的噬菌体液,37℃振荡培养4-6小时,即获得细菌的噬菌体裂解物;取细菌的噬菌体裂解物10-20ml,加入试剂A使其终浓度为体积分数1%,4℃10000g离心10min;
(2)细菌核酸降解:小心取上清,用0.45μm滤膜过滤,取滤液向其中加入10-20μL试剂B及10-20μL试剂C,混匀,37℃温育30min;
(3)细菌噬菌体粒子沉淀:加入5-10ml试剂D,轻柔上下混合,冰上放置60min以上或4℃过夜放置;10000g,4℃离心10min,小心弃去上清,得细菌噬菌体粒子沉淀;
(4)细菌噬菌体衣壳蛋白结构破坏和水解:向细菌噬菌体粒子沉淀中依次加入250-500μL试剂E、50-100μL试剂F和1.5-3μL试剂G,50℃温育30min;
(5)杂质去除:加入100-200μL试剂H,轻柔混匀4-6次,12000g离心10min,取上清;
(6)DNA离液:加入步骤(5)所取上清二分之一体积的试剂I,上下轻轻颠倒混匀6-8次得混合液;
(7)DNA吸附:将DNA吸附柱放置在离心管中,将上述步骤(6)中的混合液移入DNA吸附柱,12000g离心1min,弃去过滤液;
(8)吸附DNA清洗:向DNA吸附柱中加入600-700μL试剂J,12000g离心1min,弃去过滤液;再次加入600-700μL试剂J,12000g离心1min,弃去过滤液,将DNA吸附柱室温放置2-5min;
(9)吸附DNA洗脱:将DNA吸附柱转移到一支新的离心管中,加入50-100μL试剂K于DNA吸附柱的膜中央,室温放置1-2min;12000g离心1min,取洗脱液即得到细菌噬菌体基因组DNA;所述的细菌噬菌体为溶藻弧菌噬菌体ФPE333、大肠杆菌噬菌体ФP1655或阴沟肠杆菌噬菌体ФPZJ02;
所述的试剂如下:
(1)试剂A:氯仿;
(2)试剂B:用TE缓冲液配制的10-20mg/ml的DNase I;
(3)试剂C:用TE缓冲液配制的10-20mg/ml的RNase A;
(4)试剂D:含300-400mg/ml的聚乙二醇-8000和3M NaCl;
(5)试剂E:每升含有5.8g NaCl、1.23g MgSO4·7H2O、50ml的1M pH8.0的Tris-Cl和100ml 0.05mol EDTA;
(6)试剂F:150-200mg/ml的十二烷基苯磺酸钠;
(7)试剂G:用TE缓冲液配制的15-25mg/ml的蛋白酶K;
(8)试剂H:5-6M NaCl;
(9)试剂I:含6-7M异硫氰酸胍和100mM Tris,pH 6.4;
(10)试剂J:由5-10mM pH 8.0的Tris-Cl与无水乙醇按1:4的体积比混合而成;
(11)试剂K:5-10mM pH 8.0的Tris-Cl;
所述的TE缓冲液含有10mM三羟基甲基氨基四烷和1mM乙二酸四乙酸,pH 8.0。
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