[发明专利]检测TERT基因启动子C250T、C228T突变位点的方法、引物和试剂盒在审
申请号: | 201610165136.7 | 申请日: | 2016-03-22 |
公开(公告)号: | CN105695596A | 公开(公告)日: | 2016-06-22 |
发明(设计)人: | 单战;刘赵玲;王淑一 | 申请(专利权)人: | 南京艾迪康医学检验所有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 浙江杭州金通专利事务所有限公司 33100 | 代理人: | 黄素萍;徐关寿 |
地址: | 211100 江苏省南京市江宁*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 tert 基因 启动子 c250t c228t 突变 方法 引物 试剂盒 | ||
1.检测TERT基因启动子C228T、C250T突变位点的引物,其特征在于,所述引物包括扩增 TERT基因启动子C228T、C250T突变位点的正、反向引物,其碱基序列为:
TERT-F:AAGGAAGGGGAGGGGCTGGG
TERT-R:CGACCTCTCTCCGCTGGGGC。
2.如权利要求1所述的引物,其特征在于,所述引物还包括一对测序引物,其碱基序列 为:
TERT-S-F:AAGGAAGGGGAGGGGCTGGG
TERT-S-R:CGACCTCTCTCCGCTGGGGC。
3.如权利要求1至2之一所述的引物,其特征在于,所述正、反向引物的使用浓度比为: TERT-F:TERT-R=1:1。
4.如权利要求1至2之一所述的引物,其特征在于,所述一对测序引物的使用浓度比为: TERT-S-F:TERT-S-R=1:1。
5.如权利要求1所述的引物,其特征在于,所述正、反向扩增引物的扩增反应条件为:第 一阶段,95℃预变性10min;第二阶段,变性温度94℃30sec,退火温度64℃90sec,延伸温度 72℃30sec,循环16次,每循环一次,所述退火温度降低0.5℃;第三阶段,变性温度94℃ 30sec,退火温度58℃30sec,延伸温度72℃30sec,循环24次;第四阶段,72℃10min;第五阶 段,扩增反应结束,扩增产物在4℃下保存。
6.一种检测TERT基因启动子C228T、C250T突变位点的方法,其包括如下步骤:
(1)提取样本DNA;
(2)利用一对扩增引物TERT-F和TERT-R对(1)中的DNA进行扩增,获得扩增产物;
(3)利用一对测序引物TERT-S-F和TERT-S-R对(2)中的扩增产物进行测序,获得所述扩 增产物的碱基序列;
(4)将(3)中的碱基序列与TERT基因启动子野生型参考序列TERT-ref进行比较,确定突 变位点是否存在,其特征在于,
TERT-F:AAGGAAGGGGAGGGGCTGGG
TERT-R:CGACCTCTCTCCGCTGGGGC
TERT-S-F:AAGGAAGGGGAGGGGCTGGG
TERT-S-R:CGACCTCTCTCCGCTGGGGC。
7.如权利要求6所述的方法,其特征在于,步骤(2)的扩增反应条件为:第一阶段,95℃ 预变性10min;第二阶段,变性温度94℃30sec,退火温度64℃90sec,延伸温度72℃30sec,循 环16次,每循环一次,所述退火温度降低0.5℃;第三阶段,变性温度94℃30sec,退火温度58 ℃30sec,延伸温度72℃30sec,循环24次;第四阶段,72℃10min;第五阶段,扩增反应结束, 扩增产物在4℃下保存。
8.一种检测TERT基因启动子C250T、C228T突变位点的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒 包括样本DNA抽提试剂;无水乙醇;检测体系PCR反应液、测序体系反应液、阳性对照品、阴性 对照品和空白对照品,其中检测体系PCR反应液包括一对扩增引物TERT-F和TERT-R,测序体 系反应液包括一对测序引物TERT-S-F和TERT-S-R,其特征在于:
TERT-F:AAGGAAGGGGAGGGGCTGGG
TERT-R:CGACCTCTCTCCGCTGGGGC
TERT-S-F:AAGGAAGGGGAGGGGCTGGG
TERT-S-R:CGACCTCTCTCCGCTGGGGC。
9.如权利要求8所示的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括TERT基因启动子野生型参 考序列TERT-ref。
10.如权利要求8至9之一所示的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括测序纯化液, 所述测序纯化液包括虾碱性磷酸酶和核酸外切酶I。
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