[发明专利]一种分子标记在奶牛产奶量和蛋白含量性状关联分析中的应用

说明书

本发明属于牛的分子标记制备技术领域，具体涉及一种分子标记在奶牛产奶量和蛋白含量性状关联分析中的应用。该分子标记从MAP4K4基因中克隆得到，其核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，在该序列的156bp处有一个T/G等位基因突变，该突变导致HaeII‑RFLP多态性。检测表明：含有TT基因型的个体的蛋白含量P＝0.015，即显著高于GG基因型；含有GG基因型的个体的产奶量P＝0.001，即显著高于TT和TG基因型。本发明还公开了该分子标记的具体应用方法。

技术领域

本发明属于牛的分子标记制备与应用技术领域，具体涉及一种分子标记在奶牛产奶量和牛奶蛋白含量性状关联分析中的应用。该分子标记从有丝分裂原激活蛋白激酶4(mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4,MAP4K4)基因中克隆得到，与奶牛的产奶量和牛奶的蛋白质含量性状相关。本发明主要涉及该分子标记在奶牛产奶量和牛奶蛋白含量性状关联分析中的应用。

背景技术

丝裂原活化蛋白激酶激酶激酶激酶4(mitogen-activated protein kinasekinase kinase kinase4，MAP4K4)是丝氨酸/苏氨酸激酶亚家族STE20的成员。该基因定位于人的2q11.2-q12，共包含有34个外显子，9个剪接位点位于编码区(Becker，et al.,2000)。人MAP4K4最早克隆于巨唾细胞cDNA库，cDNA编码的MAP4K4亚型可以由不同来源的组织分离。MAP4K4属于丝裂原激活蛋白激酶(MAPK)信号传导通路的一个上游激活因子，而MAPK可以被多种细胞外信号激活，如生长因子，激素，紫外线辐射，DNA损伤剂，炎性细胞因子和环境应激等。MAPK在多种信号转导途径中扮演共同的信号转导成分的角色，MAPK信号转导通路自膜受体到MAPK激酶激酶(MAPKKK)，再到MAPK激酶(MAPKK)，然后到MAPK。在细胞信号转导通路中，MAPK在未激活时处于细胞质部分的终末位置，而在活化后却转移至核内，继而调节基因的表达，这种激活模型存在非常普遍，小至酵母菌，大至哺乳类动物(包括奶牛)。由MAP4K4基因编码的蛋白质可以特异性激活MAPK8/JNK调节通路。而研究表明由该激酶激活的MAPK8可以被MAP3K7/TAK1，MAP2K4/MKK4和MAP2K7/MKK7三个信号通路的显性负突变抑制，这表明该激酶可能通MAP3K7-MAP2K4-MAP2K7激酶级联发挥功能。

目前研究发现，MAP4K4具有调节多种重要细胞生理过程和信号传导途径的作用。根据QTL精细定位，MAP4K4被选择作为一个评估中国荷斯坦奶牛产奶性状的重要候选基因，该基因在在牛上也定位于11号染色体，奶牛产奶性状包括产奶量，乳脂率，乳蛋白率。目前该基因与产奶量和乳脂率的相关报道很少，也没有鉴定出的与产奶性状相关的SNP。已经报道的关于MAP4K4的作用主要涉及炎症反应及免疫功能。例如MAP4K4能够通过c-JunN终端激酶(JNK1/2)而促进细胞迁移和侵袭的发生。另有研究认为，MAP4K4作为c-JunN终端激酶(JNK1/2)、细胞外信号相关激酶1/2(ERK1/2)和p38应激活化蛋白激酶(P38SAP)的上游激活因子在肿瘤中通过三种信号途径发挥作用(蔡婧等，2010)。

由于产奶量是评估奶牛生产性能的重要指标，也是奶牛育种的基本工作，而且乳脂率又能最直观地反映奶牛营养水平，因此我们有必要从分子水平为奶牛生产性能提供先进的应用方法。由于MAP4K4能够调节正常细胞的生长过程，因此可能和奶牛产奶量和乳脂率有关，本发明主要阐述了MAP4K4的一个多态性位点与产奶量和乳脂率相关的应用。

发明内容

本发明的目的在于寻找MAP4K4基因的片段作为一个分子标记在奶牛产奶量和蛋白含量性状关联分析中的应用。

本发明通过以下技术方案实现：

一种分子标记在奶牛产奶量和蛋白含量性状关联分析中的应用，所述应用的分子标记的核苷酸序列如下所示，